EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-36597 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr9:21714138-21715387 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr9:21714215-21714227GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:21714219-21714231GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:21714223-21714235GTTTGTTTGTTT+6.32
RFX1MA0509.2chr9:21715220-21715236GGTAACCATAGCAACA-6.34
RFX1MA0509.2chr9:21715220-21715236GGTAACCATAGCAACA+6.35
RFX2MA0600.2chr9:21715220-21715236GGTAACCATAGCAACA-6.44
RFX2MA0600.2chr9:21715220-21715236GGTAACCATAGCAACA+6.52
RFX3MA0798.1chr9:21715220-21715236GGTAACCATAGCAACA-6.42
RFX3MA0798.1chr9:21715220-21715236GGTAACCATAGCAACA+6.49
RFX4MA0799.1chr9:21715220-21715236GGTAACCATAGCAACA+6.17
RFX4MA0799.1chr9:21715220-21715236GGTAACCATAGCAACA-6.72
RFX5MA0510.2chr9:21715220-21715236GGTAACCATAGCAACA-6.11
Enhancer Sequence
TCCTCAAAAG CTCTGAGTGT AGGGGCTGAC TCACAGCCAG CTGTAAAAAA TGTATGCATT 60
TTTGCTGATC TTTTTTTGTT TGTTTGTTTG TTTGTTTTAT TATAAGCCTT CCCCACAGCA 120
CCTGCTTCAT TGCCGTCAGA ATGACTGAGA GTGAGTCATC TGTGAAGCCA CTGTGTTTGC 180
ATGACTGAAT AAGTGTGTGT GTGTGGGTAT AAGAGAGAGA AATTCCCAAA GTTCAGCAGC 240
TTAATTGTGT GTATTTAACC TTACTCACTC AGTACTTGTC CTCTTTTCGC CTGCAGCTGC 300
TCAGACTGAT CTTCAGCTCG CCTCTTCAAT GTTGTTTGTT TTTTAATAAC TATTATTCTC 360
ACATCTGCGT CAATAAATAT TAGTACAAGC GAGCCCCATA GTCAGACAGC GCGCAAAATC 420
CCCTTGATGC CATCTGGTCT CTGTGGAGAA GTCCAAACTG AGATACTAAG GCGCAGAGAC 480
AAACATGATG TAACAGCAGC AGGAGAGGCA GGTGATGATT GCCTTGATAG AGTGAAGATG 540
CTCTCCAGAG TGACAGAGGA AGTAGCTTTT TAAAAATTTG AATTTGAATG TTTGGTACCA 600
CCTAATCAAG GATGCGCGCG CCGCACAGCA AAACCGAAAA CACCAAGTTG CGCTGTAAGG 660
TACTACTGCA CCGGAAAACA GTTCAACTGA CAAAACCAAA AGGCTTGACA CCCCAGAAGT 720
TCTGTTAGAC AGACAACAGC GCATGATTCA TTTAAATACT GCTTTGTCAA CATTAATCCT 780
CCACAAGCAT TTCTCCTTGA GTAAAACGTG AATGAAAAAC TTATTTTGAC CACAAAATTA 840
AAAGCGCAAC ATGAAGTTAA ACAGGCGCCA GTTAAAGGTG CCAGGAAGAA TCATTTTCAC 900
AGAAATGCAA ATTACATTTG GGGTCCAATA GGCTACATCT CTGAAGAATA AAGTTCTTCA 960
AAGAACTATT TTGTCATAGT GTGAAGCTTA AGGAACCTTT TGTGGGGTCT TCCTTACATG 1020
TTAAAGGTTC TTCATGGAAC CATCGATGTC TATTAAGATC CTCTATTTTA AGAGTGTGTG 1080
AGGGTAACCA TAGCAACAGT ACGCTGCTCT GTTTCACTTT TCGGAAGGAA CATCTCAAAA 1140
CATAAACACG GATGTTTTTT AGCAAATGAC CACATATTTA AAAATCACAG ATATAGGCTT 1200
TATAAAAAGA TTTGTTTTGT TTAGAAAGTT GAAGAACCAT CATCACAAC 1249