EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-36199 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr9:2523748-2524376 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr9:2524301-2524313GTATGTTTGTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr9:2524256-2524269AAATTAATTATAT+6
POU1F1MA0784.1chr9:2523785-2523799TTTATTTGCATATT-6.34
POU2F1MA0785.1chr9:2523787-2523799TATTTGCATATT-6.37
POU2F1MA0785.1chr9:2523795-2523807TATTTGCATATT-6.37
POU2F2MA0507.1chr9:2523793-2523806CATATTTGCATAT+6.02
POU2F2MA0507.1chr9:2523785-2523798TTTATTTGCATAT+6.98
POU3F3MA0788.1chr9:2523786-2523799TTATTTGCATATT-6.04
POU3F3MA0788.1chr9:2523794-2523807ATATTTGCATATT-6.05
POU5F1MA1115.1chr9:2523787-2523798TATTTGCATAT-6.02
POU5F1MA1115.1chr9:2523795-2523806TATTTGCATAT-6.02
mix-aMA0621.1chr9:2523771-2523782AATTAATTAGT+6.62
Enhancer Sequence
CTGCAAGCAT TTGAGGATTT ATCAATTAAT TAGTTTGTTT ATTTGCATAT TTGCATATTT 60
ATTTATTTAT TGTTTTTGCA GGTTTCGTAC TCCATAGAAA GAAAATTATC ATAATAAGCT 120
TTAAGAAAGT TATTATTCAT TTTATTGTTA ATAAGTTTAA GAGATTCACT GTTTTACACA 180
CAAAAAAAAA CATTTATGAT CTTTTGAGCC ACCGTTGTCA TTGCGTCATA AAGAAGCGCC 240
GCTTTTGGTG GTGTTATGAT GTTGTTTAGT CGAAAGCGCT AAGTTTAATT CTTAATAACA 300
CTTTGGTCGT ATCGCTGGTG ATTAAACATG GGCAAATCTT TTGCTAATTT CATGTGTAAG 360
AAGGATTTCC ATCCTGCATC AAAATCCAAC ATAAAGAAGG TGAGAGGGTT TAAGCTAGCA 420
TGCTAATACG CCTCGAGTGT AAACATTAGG CTGACTTTGT TCAGATCGAG TCATATTGTA 480
GTAATGATAT CATAATTAAA TGTTTGCTAA ATTAATTATA TTAAGCAGCT TTCCCGTTAA 540
TTTATTTGAT TTTGTATGTT TGTTTGTGAG GGAATTGCCC AAAAAAACTG CGATTCCAGC 600
GTTACGGATG TGATACAGTA AAGACTTT 628