EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-36034 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr8:52650764-52651703 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr8:52650999-52651016ATTAATTAATTAATACA-6.32
Arid3bMA0601.1chr8:52651091-52651102ATATTAATTAT+6.02
ArxMA0874.1chr8:52650992-52651009TAAATTAATTAATTAAT-6.19
ArxMA0874.1chr8:52650999-52651016ATTAATTAATTAATACA+6.4
Hmx2MA0897.1chr8:52651610-52651627ATCATTTAATTGCCTGT-6.69
Hmx3MA0898.1chr8:52651610-52651627ATCATTTAATTGCCTGT-6.85
Lhx3MA0135.1chr8:52651001-52651014TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr8:52650997-52651010TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr8:52650994-52651007AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr8:52650998-52651011AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr8:52650993-52651006AAATTAATTAATT+6.92
MEF2CMA0497.1chr8:52650877-52650892TGCTATTTTTAGGTT-6.46
POU6F1MA0628.1chr8:52650995-52651005ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:52650999-52651009ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:52651003-52651013ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:52650995-52651005ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr8:52650999-52651009ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr8:52651003-52651013ATTAATTAAT-6.02
SP1MA0079.4chr8:52651106-52651121TAAACCACGCCCCTT+6.61
SP4MA0685.1chr8:52651106-52651123TAAACCACGCCCCTTAA+6.37
Enhancer Sequence
TACAAATAAT AGAAAAGAAT TTTAGGAGAA TGTTCTTTTG CAACCATAAA ATAACGTTTC 60
CAGAACAGCG TGGTCGTCAT TTAAATAACC TAAATATAAA GAACGTTTTC CATTGCTATT 120
TTTAGGTTAG TATTTTGCAA TCGTAAAATA ATGGTTCGGA TAACCAATAA ATAAACGGTA 180
ATATTTACAA AACATCAGGG AACTGCAATA AACACCTTTA AAAATAAATA AATTAATTAA 240
TTAATTAATA CATAGAAATA TATTCCATTA TTACATTAAG GTGTCAGATG GCTTTATTGT 300
ATGGAATTAT TACTTATTTA TCACGCGATA TTAATTATGT TATAAACCAC GCCCCTTAAC 360
TATCAAACCA ATCAAGGTGA AGTGCGCGGC TCTGTAACAT CACGCTGGGA ATAAAAAGGC 420
GCGCGCCGCT CCGTCAGGTC AGTCAGTGAT GCTGCTGTGC TCTGTGTTGA AACAGGAGGA 480
AATTGTCGAG GTATTCTGCA TGATGAGACT CAAGCAGTAA ACTTACACAC ACCAGGTTCA 540
TTCAACATCT GTCAAAGCTA CTTTGATTGA ATATTGCTGC CGGTTACTGT ACAATGCGGG 600
CGTGAAGCGG AGGAGGACAG TCATAAGAGT GTTGTTGATC TGGATAAATA AACTTCATCA 660
AGTCTGAAAA CTCTCCGGAG ACTGGAGGAT CTTCAAGGTC AGTCCCCTGC TCTTATTAAT 720
AATTGTTGTA AAATTCGTTT TATAAGCGCA TATTTGTTCA TTTTTTAATA GTGACAACTT 780
ATAACTATAT ATATAACTAT ATTGTTTACC GCTACTTTGA ATATTGGATC TGAAATTAGC 840
ATTAGCATCA TTTAATTGCC TGTTTACGAT GTTGTACTTT GATAGTCATT GGCTGATAAT 900
ATTATTTGCC TATTTAGAAT TTGCAAACAA TGCTTTGCT 939