EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-36010 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr8:52108234-52109296 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr8:52108819-52108830ATATTAATTAC+6.02
RFX1MA0509.2chr8:52108924-52108940GGTTTCCATGGTAACA-6.73
RFX1MA0509.2chr8:52108924-52108940GGTTTCCATGGTAACA+6.75
RFX2MA0600.2chr8:52108924-52108940GGTTTCCATGGTAACA-7.03
RFX2MA0600.2chr8:52108924-52108940GGTTTCCATGGTAACA+7.06
RFX3MA0798.1chr8:52108924-52108940GGTTTCCATGGTAACA+7.1
RFX3MA0798.1chr8:52108924-52108940GGTTTCCATGGTAACA-7.29
RFX4MA0799.1chr8:52108924-52108940GGTTTCCATGGTAACA-6.73
RFX4MA0799.1chr8:52108924-52108940GGTTTCCATGGTAACA+6.79
RFX5MA0510.2chr8:52108924-52108940GGTTTCCATGGTAACA-7.03
RFX5MA0510.2chr8:52108924-52108940GGTTTCCATGGTAACA+7
Enhancer Sequence
CACAATAATA TAAAATAGTA ATTAAGCAGA GTATCATTAA TGTTATTTAT TAAATTACCC 60
ATTAAAGGGT ATTTTATCAA CTTCTACAGC AACCCCAAAC CTAAACTCAA GCATCAGAGT 120
AATGTAAAAC GGTGATTAAA CCGAATATTA TTCAAATTAT TTATTAAATT ACTTATTAAA 180
GTGTATTTTA TTAACGTATA CCCCAATCCC AATCCTAAAC GTAAGCATTA CCATAATGTA 240
AAAACAGTAA TTAAACCGAT AATTATTCAT ATTATTCATT AAATTACCCA TAAAGTGTAT 300
TTTATTAACA TCTACCCTTA TCCTAAACCT AAACTCAAGC ATAACCATAA AGTAAAACAG 360
TAATTAAGCA GAGTATTATT CATATTATTT AATAAATTAC CCATTAATTG TGTTTTATTA 420
ATATCTTTCC TTACCCCAAC CATAAACTCA AGCATCAGAG TAATGTAAAA ACAGTATTAA 480
AACCGAGTAT TATCAATATT ATTTATTAAA TTACCCATTA AAGTGTATTT TATTACCGTA 540
TACCCCTATC CCAACCTTAA ACATAACCCT CACGGCAAAG TAAAAATATT AATTACTGTG 600
GTACAGTCTC GCATTTGACG TGGGTATCCG CAGCTGTATC CCATCTAGAC TTTACCGGGC 660
ATTTCTTGAG TAGAGCACGT GCGCCTCTTT GGTTTCCATG GTAACAAACC GGCAGGACGC 720
TAAAGGATTG TTATAAATAA ACTAAATACG ACATCTTATG AATCCAAAAT AAACATTGTA 780
AATTACATAT ACTCTAATTT AAAATTATTT TCACAAGTTT GAGCTTCACT TCCAACAGAG 840
TTGTTCTGTT TTTGGCTGCA TACGTTACTT TTTCCATGCT AACGCTAGCT GTGCTGTCAA 900
TACATACATC GAAATTAAAG GTAAGACGAT TTTTTATGAT AACATAGTCT TAATAATTAC 960
TAATTTACAG TTATTTTGAA GGACGAATTC GTGTATAATG AGGCCTGTAG CCAGCCTGGT 1020
GTAAAGGGTG GTTGTTTTTT CTCAAAAGTG GACTTTTTTT GC 1062