EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-35238 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr8:28617521-28618528 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr8:28617982-28617996ATTGTTTACCTTCC-6.48
IRF1MA0050.2chr8:28617806-28617827TCTTTCTTTCGGTTTCGTTTT+7.16
IRF3MA1418.1chr8:28617809-28617830TTCTTTCGGTTTCGTTTTGAA-6.58
IRF4MA1419.1chr8:28617809-28617824TTCTTTCGGTTTCGT-6.61
IRF7MA0772.1chr8:28617810-28617824TCTTTCGGTTTCGT-6.26
IRF8MA0652.1chr8:28617810-28617824TCTTTCGGTTTCGT-6.47
IRF9MA0653.1chr8:28617810-28617825TCTTTCGGTTTCGTT-6.91
RARAMA0729.1chr8:28618282-28618300TGGGTTAAAAGGTCAATT+6.09
RXRBMA0855.1chr8:28618283-28618297GGGTTAAAAGGTCA+6.08
RarbMA0857.1chr8:28618281-28618297GTGGGTTAAAAGGTCA+6.04
RargMA0859.1chr8:28618282-28618298TGGGTTAAAAGGTCAA+6.42
TBX20MA0689.1chr8:28618167-28618178AAGGTGTGAAG+6.32
TBX21MA0690.1chr8:28618167-28618177AAGGTGTGAA+6.02
Enhancer Sequence
TTTAAACACT TGGAATAAAC AAAATACAAG TTTTGATATG AGGAAAGTTT TGTAAAAGAA 60
TTGCTAATAT TTTAGAAATG TGTTGACTAA ATATTGTGTG AAAATAATGT TAATGTTATG 120
CTCACAACGG GCCGATGTTG TGCTATTGTG TTAAGCGTTT TGAAAAAGTG ACTACAGATT 180
TGAAAAGTTT GTTAGCAAGT GAAAAAAAAA CTTTAAGTAA TATTAAAGTG CGATGAAGTT 240
AAGAACAGGA GGAGGAGGAA GTAGAATCGG CCGTTGATCA TCGAGTCTTT CTTTCGGTTT 300
CGTTTTGAAA GCAAGAAAGA AAGTGCACGT AACAACGCTT TGATCATGCA CTATACTTAC 360
TTTTTAATGT GTAAGTATAA AATGCATTTA TTCGTACATG CATCTGCATA TTTTGTTTGC 420
ATTTAATTTG TTGCATATAA GACATTCGTG TAACAGGACA CATTGTTTAC CTTCCGCTTA 480
TGTCTACCAT TTGCTTTCAT TTTAGCGTGT TTTTATTCGA CATAAAGTGT AACCTCAGAT 540
ATATCTTTTT AAAATGTCTT TCCCCTAGTC CATGTTCTGG TTCACCTGTC AATATCGATA 600
GAGGAGAAAG GATGGATTAA AATACCATGT CGAGCTAATA CAGAGAAAGG TGTGAAGTAT 660
AGGAGAATCA ATTGGTACAA GGTTTGTACC AAACAATTTA AAATGCTCCA GCTGTTAATC 720
CAATAGTTAA TTGCATAACA CATAAAGGAA TGTTTCCTGC GTGGGTTAAA AGGTCAATTT 780
ATTTGACAGG TTGAAGGAGC TTCTGATGTG CTGACTGGAC TTGTTTCAAA GAATTTGATG 840
AAAAACACCA CCACACTCTA TAAGTTTGCC GCTCATTCCT ATGAAATTGG AGAGGACAAC 900
TCTTTGCTTA TTCCTGCTGT GACACAAAAC GACTGTGGCA CCTATAGATG CACATTATGG 960
CCTCCACTGG GTCATTATAT TCAGGAAGTA AATATTGAGT ATTCTGA 1007