EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-35176 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr8:26838354-26839735 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr8:26839279-26839295GTTTGTTTACTTAATT-7.32
FOXC2MA0846.1chr8:26839280-26839292TTTGTTTACTTA-7.22
FOXD2MA0847.2chr8:26839281-26839294TTGTTTACTTAAT-6.98
FOXP2MA0593.1chr8:26839280-26839291TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr8:26839277-26839294TTGTTTGTTTACTTAAT-6.39
GCM2MA0767.1chr8:26839175-26839185TACCCGCATA-6.02
PAX3MA0780.1chr8:26839167-26839177TAATCGATTA+6.02
PAX3MA0780.1chr8:26839167-26839177TAATCGATTA-6.02
PAX7MA0680.1chr8:26839167-26839177TAATCGATTA+6.02
PAX7MA0680.1chr8:26839167-26839177TAATCGATTA-6.02
POU4F1MA0790.1chr8:26839524-26839538CATAAATTATTCAG-6.73
POU4F3MA0791.1chr8:26839522-26839538TACATAAATTATTCAG-6.15
POU6F1MA0628.1chr8:26839714-26839724ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:26839714-26839724ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
ACGCAAACAC GACGAGGACA TTCACTCTCC ACACAGAAAT GCCAACTGAC CTTCTTTCTA 60
TGAGGCGACA TTGCTAACCA CTGAGCCACA GTGTCGCCCC TAAGGGAAAA TATATTTGCT 120
TTAATCAAAT TGAAAACAAG TGCATTAAAA GAGAGTACAT CTTAAAAGGA CGTGTTTAGC 180
ATTGCGTGTT AATACTCCTT GTTCTACACA GGTGCATTAA GATCTCGCAC ATGCGCCTTG 240
GCATCAGTGC AGTCTGCAGC AGTGTACGTC CTGCGCGTGC CCACCAGACT CAAGCAGCGA 300
GGCGTCACAA CAAAGCTGGT AAGCAATGCA CAGGTACAGC ATATTTAATA CAGAGAGCAT 360
AAGGCAGACA TAATCTAAAT TATGGCATTA AATGTTTTTC CTAAGCGTTG CGACGTAAAT 420
CTCCGTTGTG TTGTCAGAGA GCACTTGGGC TAACTGCGCG TGCAGTTTTA ATAATTGTGG 480
CAAGTATTAA CGCTATTAAA AACAAACATG GATATAAGGG GCTTAACCTA AATGCACGTC 540
GAAGCAACGT GAAGCGTGTG TTTGTGACCT TAACCTACCC CGTCAGAAAC TGCTTAGCGA 600
CAGTGCCAAA CGGGGTTTGT TTTATTTAAA GGGCTGTCAG ACATCGCAAC ATGTGCGCTC 660
TGACTGCTCA ACAGACATGT TTACGCGATA ATACCCCATT TAAATACTTT AACGTAATCG 720
CTAAGCAATG CATTATGTGG TGTAGTAAAT ATTTGCGCAG CAGTATAATT TTAAATAGGC 780
CTGTATGATA TTATAAACCG CTGCTTGCGT GTTTAATCGA TTACCCGCAT ATGTACATGA 840
ATGCGGCAGT TATGGGTGCA TTACGTTATT TATTGACCAT TGAAGACAAT TGATTCGCGC 900
GTTGTCATTG TTTTGACAGT GTGTTGTTTG TTTACTTAAT TGGGACGCCC TGTGAATGTG 960
ACCCCAAAGT GCGTCTGTGA AATGAGATTA TTAATATTAG CTTGGCTAAG GTTGTCTGAC 1020
CCCACCCACA CCTCCACAGG TAGACTACAA ATTGTAACTT CTTTTACGGT CTGTAGATCT 1080
TCAGCCACGT GTGATTTCAT TTTGTAATAC AGCAACGTTT ATGGATATTG CATATAATAT 1140
ATGAAATTAC ACCAGATATC TGTCATTTTA CATAAATTAT TCAGATATCA AATTGAATTG 1200
ATAATGTGGT CTCACTAAAC GTGTTGGAAA AACACTGCTG TGTGGTGTGT TTTCCCTACA 1260
ATTTGCTCAA CTCATCTTAT TGTCCTACCT GTGTTTAAAT TAAGAGCCAT TGACGGTATT 1320
ATGATTTCTT AAGTAATTTA TGCTTAGCTG TTATTCGCTC ATTAATTAAT GATGAGATTG 1380
C 1381