EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-34911 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr8:18427178-18428885 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr8:18428377-18428392TTTGTTTATTTTATA-6.15
Foxj3MA0851.1chr8:18428374-18428391GTATTTGTTTATTTTAT-6.44
RARA(var.2)MA0730.1chr8:18427418-18427435TGACCCTTGCGAGACCT-6.52
Enhancer Sequence
GGGGTATATG GAAATCAGTG GCTAGCCTAT ATGTCAAATG TTATAAATAT CTTCCTTTGT 60
GTTCAACAAA AATAAGAAAT TCAAACATGT TTGGAACAAC CAGAGGGTGA ATATGATGAC 120
AGAAGTTTGA GTAAATTATC AATGTAAAGA GTGAAAGTTC TTTCAAGTTT GTTTGCCAAA 180
ATTGGAAATA TCATTACAAT CACGCATTGC ATCTAAGCTG AAGTCCAGAT TTTAAGGACA 240
TGACCCTTGC GAGACCTTCT CAGACCCCCG AGGGGAAACA CAGGAATATT AAGAAGCTTA 300
CAGAAATAAT CAACGTTCAG TTGGTTTACA TAAGCCAGTT TGAGACAGAG TGAAAATTCA 360
TTTGATATTT AATTGCTTAA GATCATTCAA ACCAGACGAC TGGTCCATGT TTACGAGACA 420
AAAAAAAGTT AAGAAACCTG GCATTTATGC GCTAAGCGTG TAATACCAGC ACAAAGCCAA 480
GTGCAAACCA GAGTTGGGAG GTGGAAACAT GCGGGGCTTA CCAGGATAGC GCGCTTAGTG 540
CAGTCACAAG ACCCGACCAT CCATGAACAA AAACGTCCAG GCGTTTATTT CACTGCTCGG 600
CTACATTTAA AGCAAGTATA TTTGGATACG TGAAGGTTCC CCATCCTTTC CATGGGGTGC 660
GTGGCGCGAT GGATATCTCC AAGAACATTT ACGCATTCAG CACTTTGCCA GCTATGATTC 720
TTTTTAAAAA CCGCATAGAG GAGTTTTGAG ACACTTTTTA TTGTTATCTG AACTTCTGTG 780
ATGAGTTTGA AACGAAAGGA GGGGCGAGTG TCAAAGGAAC TGACCACGAG TTGAGAAGAA 840
AAAAAAAAAC TAAGGGAAAG ATGTCTACAT TTGCCACCCA CACGATATCG ATTGTATTAC 900
ATTCAAGAAG CTTCGCACTT GACGTATAAA AACAAGACGC ATGTTCTCAA GAAAGACACG 960
AGACAACAGG AACTTTTGGA AGATATATTT TTCTCTGGCA ACTTTGCGTC CACATCATTA 1020
GAGGCAGAAG CACCTACCAA TATATAATCG TGTAAGTCTA TTTATTTTTG CCTCTGTGAC 1080
TATAATTAGT GATTACGCTG AAGTGGATAA TTTCTAAAGA AATTAAACGT GGACAATGCG 1140
CAATGGTTAG ATTTAGGTCA AATCAAGGAT GTGTTTATTT AAAACATTTA AAATTTGTAT 1200
TTGTTTATTT TATATTTGGA TATTATGCAT TTATATAGTG TAGATATGTC GTGACTTGTA 1260
CAAAAATCTG CCTATAATAA CGCAGGACCA CTGCGCAAAT TTTGCCAAGT GCGCATTTAC 1320
GCGCGTATCA ACTTTTACTA GGCTATGCGA CGATTTAATG ACTTGCTTTC CTGTTTTGTT 1380
CGTTTGTCAG TCTGGAAAGC CATGCGGGCT GAGAAGAGAT GGCACATCTT GTTGAGTATG 1440
ATTCTTTTGC TCATCACCTC CAGCCAGTGC ATGGACAGCA AGGAGGTAAA GGAGTCGGAA 1500
AGGAAAACTC TGCTTAATCT AATCCTGCAA GTGATCGGGG AAAAGCCCGC GTCCAGACGC 1560
GTCACCAGTG GCCTCTACTC TGTATCTCAA GATGCTAAGT TTTCCTCGCG TGAAAACACT 1620
GCACATTTGC CCAAGCCGGA CAACAGCAGA CCAATAGGTA AGCTGATTTG AGATCAGGTG 1680
ATAAATGTAA TCCAGGGCAT TAACTCC 1707