EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-34598 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr8:4761593-4762469 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU1F1MA0784.1chr8:4762057-4762071ATTATGGAAATGAG+6.15
RFX1MA0509.2chr8:4761852-4761868GGTTGTCATAGCAACG+7.11
RFX1MA0509.2chr8:4761852-4761868GGTTGTCATAGCAACG-7.1
RFX2MA0600.2chr8:4761852-4761868GGTTGTCATAGCAACG+6.98
RFX2MA0600.2chr8:4761852-4761868GGTTGTCATAGCAACG-7.12
RFX3MA0798.1chr8:4761852-4761868GGTTGTCATAGCAACG+6.64
RFX3MA0798.1chr8:4761852-4761868GGTTGTCATAGCAACG-6.96
RFX4MA0799.1chr8:4761852-4761868GGTTGTCATAGCAACG+6.23
RFX4MA0799.1chr8:4761852-4761868GGTTGTCATAGCAACG-6.95
RFX5MA0510.2chr8:4761852-4761868GGTTGTCATAGCAACG+6.64
RFX5MA0510.2chr8:4761852-4761868GGTTGTCATAGCAACG-7.01
TP53MA0106.3chr8:4761797-4761815AACATGTGCGTGCATGTT+6.58
TP53MA0106.3chr8:4761797-4761815AACATGTGCGTGCATGTT-6.83
ZNF24MA1124.1chr8:4762356-4762369TATTCATTCATTT+6.42
ZNF384MA1125.1chr8:4761683-4761695TTTTTTTTTAGT-6.32
ZNF384MA1125.1chr8:4761775-4761787AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
AAATCACTGC ATGACATTTG ATACTGCACT TGTGTTGCAT AAATGGACTG TAATTGTTCT 60
GATTTCACAC TTTTGCATAC AGTTTGGTTG TTTTTTTTTA GTAATCTGGT GGTTTTGTGT 120
ACTAGATTAT TTCCATTTCC TTTCTGTTAC ATTTGAAATA CGTTTACTGA CAAAAAATAA 180
AAAATAAAAA AAAACTGTTC GAGCAACATG TGCGTGCATG TTTCCTCAAT GCGTGTGCAC 240
GTCAAAATTG GGAACGCGCG GTTGTCATAG CAACGTTTGA TTCATCCAGG AAGCGACACC 300
GCGCGTCTCC TTTTCGCCGG CATTTCAGCC GAAATGAAGA TTTGAACGAC ATAAATACGC 360
TTAATTTGAA GAAACATTCG TTTTAATTGT GTTAAACATT CATTAAGATG TAGTTCAACT 420
GATGGAATGT TGTCACGAAT TGATATGTGA TGAAAGCTAT ATCGATTATG GAAATGAGGT 480
ATGTAAATGA GGTCAGGTAT ATTGTTTACG CTTTATGAAG TTACATTCTT CTAAAATAGC 540
GGTGGGATTA CTTAATCTAC GTGAACTGAC TTGCATAATT TTTGAGGTGA AATGTTTAAA 600
TACATTGTCA GCATTATAGT ATTGATAATG ACCTACAATT AAAATGAGTG GCCTTTCATT 660
GTATCTGGCA ATGTGAGGTT ATTAATCTGG CAAAAATGTA TATTTAACGT CTAATTTCAG 720
CAAAGTTCTA AGTTTAATAT TTTAAAGTTA ATCACTATGA GATTATTCAT TCATTTATTT 780
TCCTTCTTAG TCCTTTCATT CATCTGTGGT CGCCACAGCG GAATGAACCG CCAATTTATC 840
CAGCATTTGT TTTACAAAGC GGATGCCCTT CCAGCT 876