EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-34589 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr8:4270226-4271612 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr8:4270731-4270745CCAATATTGAAACA+6.11
Rhox11MA0629.1chr8:4271462-4271479ACGCCGCTGTAATGTGT+6.41
YY1MA0095.2chr8:4270759-4270771GCGGCCATCTTG-6.62
Enhancer Sequence
GCGAGAAACA GATACACATA ATCAACGTTA AAGTGGTAAA ATACACGAGC TGTTTGTTTG 60
AAAAAGTCTG AGGTGAATCA TAAACCGGCA CTTTACAGCA TGAGCCGCGC GCGCGCCGCC 120
GTTCACTATT TCTATTAGAA TAAAACACAT TAGCCTGATA AAAAGTTAAA GTCCACAAGT 180
CGGAGAGGCA TTAAAAGTTT CCGTTTCCAG CAAAGCTGGC GGAATGAGCG TTAAAATAGC 240
GTTGAATGTG ATGTTAAAGC GCGTTAGTGT GCGCGAGGCT ACTAGCGCTG CTCTTGCGCG 300
CTCCTGATCA ATGATTGAAC CGAACAAAAG GCAGAAGAGG ATCAATTACT AATAACTATC 360
AATGCAACAC CACCATCCCG TCCCTATAAA GTCGCCAAAA CACAAAACGC ACGAAATGCA 420
AGGTGCACAA CAGCATACGG CATCGCATCG TGTGAAAAAG GTGAGAAATA AGACCAACCT 480
GAAGCCGCCG GAGATCAAAT TTCTTCCAAT ATTGAAACAT CGATCCCACA TCGGCGGCCA 540
TCTTGAGCAC AATATTCAAG AGCGGCTACA ATAAATATAT GGGCTGGATT CCCCCCGTTA 600
AACAGCGTTG ACGATTACAC TCCACATGGA AAAAAAAATG TTAGGAAAAT AACAGTTGTG 660
GGAAACTAGA TGGGACGCGC AGCGCGCCGG AGCCGGAGGA TGCGATATGA ACAAGAATAT 720
AGATGCATAT ATAGATGCAT TAGTGCAGCT CCCGGGATTG CACTTGATTT TGGGTTTGGT 780
AAAGTTATCA ATACTGACGT AACGGGTTGA TCAATAACGT CTGGGAAGTG GAAGGAGAAC 840
AACGAGCAGC CAATGCGCAT CGCCAGATGT TTGATGCGTA AAACGCCGAA ATCATTACAT 900
ATCATTAATA AGAGCCATAT ATAATGAGAT TTTGCAACTT TAGCTCAATA ACGCGTTATG 960
CATGCAAGAA ATGCGGAGAA AGTGGCATGC GAATGGAATA AACACCAAAC GCGTGAATGC 1020
GTAGTTAATT TATTTAGTGT CCTTGTAAAT AATCAAGATT AAAGCTTGAT TAAATAATGC 1080
TAAATTAAAA GCACAAAAGT GCTATTGAGC TATTCAAATA TGTTAGCAGA TCCCAACTGT 1140
GATATAACAA ACAAAACAAC TGCTTAACAG TATGCTCGAG AATGCGTAAA AGGTGCACGT 1200
CTAGTTAGTT TTTGTGTGAG ATAAATAAAG AGATCCACGC CGCTGTAATG TGTGGAATTT 1260
CAACAAATGC CAGGAATGTT TGTTAGTTCT TTATCTTGAA CACGCAGAGG TTGTTTGCTG 1320
AAGGTGTTTT CTCTTAAAGA AGCTCTAAAT GTAAGCGCTC TTGCATTCCT AGACGGAAAA 1380
TAAAAA 1386