EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-34086 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr7:61394188-61394992 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr7:61394942-61394954AATGTAAACAAT+6.32
RFX1MA0509.2chr7:61394907-61394923AGTTGCCATGGTGACA-6.31
RFX1MA0509.2chr7:61394907-61394923AGTTGCCATGGTGACA+6.3
RFX2MA0600.2chr7:61394907-61394923AGTTGCCATGGTGACA-6.33
RFX2MA0600.2chr7:61394907-61394923AGTTGCCATGGTGACA+6.49
RFX3MA0798.1chr7:61394907-61394923AGTTGCCATGGTGACA-6.22
RFX3MA0798.1chr7:61394907-61394923AGTTGCCATGGTGACA+6.54
RFX4MA0799.1chr7:61394907-61394923AGTTGCCATGGTGACA+6.31
RFX4MA0799.1chr7:61394907-61394923AGTTGCCATGGTGACA-6.43
RFX5MA0510.2chr7:61394907-61394923AGTTGCCATGGTGACA-6.19
RFX5MA0510.2chr7:61394907-61394923AGTTGCCATGGTGACA+6.3
Enhancer Sequence
AACTATATAC AATATATACA GTATGTACAT ACGTGCCCTT GACCCTTCAT CTGGCACTAG 60
TATGGCTCAG TGCCTGGGCT TCTTCCTCCG GGGCTCCTTG GGCAGTGGCT CTCTGCTGAT 120
GTCCACCCTG AATCTAGGAG CGACGCTGGA CTCGGACCTG CTCTCCGTGA TGATCACACG 180
TCCATCTGGT TGCTCGGTCT CCTCCAGTGC AGGCCGGTCC AGCTTCTCCC AGAGCCGCTG 240
CTTGATCTCG AGTCCTTGCT GAAGGCTGTA TCGGCTAGCG CGTCTCTTCT TGGTGGAGCC 300
CATCACACTG CAGTAGATCT GCTGAAAGTC CTGCACACTG CGACCGTGGA TGGAGAGGGG 360
CTCCTCCTGT GGACACTCAC CCGCTGAGGA GGAGACTGAT GCTGCGGGAC GGAGGACAGG 420
AAGAACAGCC GCGTTCATCA GGTACCTCTC CTCCAGGGAA GTGTCCGACG AGCTGCAGGT 480
GTCCGGCCTG GCCGCCGCTG CTGGCTCCGC AGAGGAAGAG ACGCGCTCCA GCTGGAAGTC 540
CTTCAGGTGC CCGGGGCGCG TCCTGGTTCT TCTCGAGCGC CGCAGAGTCA TCACGAACAA 600
CTTCAAACAC TTCTCAAACT GCTAAAACTT TGCCAAGGGA AATTTGTGCA GAAGTTTGTA 660
GCGCGATGAT CAGCACTGAT TACTTTATAG ACAGTTGTGT GGATGTTTAA ACCAATTCAA 720
GTTGCCATGG TGACAGAATG ACGAGCCTCA TTTAAATGTA AACAATAATT GATTTCAGCG 780
TTAAGTCAAT TAGAGCAGCA AAAG 804