EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-33654 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr7:44273663-44275200 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr7:44274400-44274411TATAAACAATA-6.32
HOXA10MA0899.1chr7:44273703-44273714AGTAATAAAAA+6.14
RFX1MA0509.2chr7:44274645-44274661CGTTTCCATGACAACG-7.24
RFX1MA0509.2chr7:44274645-44274661CGTTTCCATGACAACG+7.25
RFX2MA0600.2chr7:44274645-44274661CGTTTCCATGACAACG-6.93
RFX2MA0600.2chr7:44274645-44274661CGTTTCCATGACAACG+7.03
RFX3MA0798.1chr7:44274645-44274661CGTTTCCATGACAACG-6.74
RFX3MA0798.1chr7:44274645-44274661CGTTTCCATGACAACG+7.01
RFX4MA0799.1chr7:44274645-44274661CGTTTCCATGACAACG-6.51
RFX4MA0799.1chr7:44274645-44274661CGTTTCCATGACAACG+7.14
RFX5MA0510.2chr7:44274645-44274661CGTTTCCATGACAACG-6.23
RFX5MA0510.2chr7:44274645-44274661CGTTTCCATGACAACG+6.44
RUNX1MA0002.2chr7:44274195-44274206AAACCACAGAC-6.62
Enhancer Sequence
GTGGTAGAGT GAGTAGAGGA CGATCCAAAA TCTAGAAAGA AGTAATAAAA AATATATATA 60
TTACTAACAC ATTTTAAGAA ATGGATACTT GTATTAAACA AGGGTGCATA AAACAGATCA 120
GAAGAGAGTT AAGATTTCTG ATTCAAATAC TTTTCAATTT AAACTTTCTA TTCAACAATG 180
AATCCTGAAA TAACAAAACA TGATAAAAAT AAGAAATCTT GCTTGATCAG CAGCAAATTA 240
TGAATACAAT ATTACATTTT GGACTGGAGC ACTGACGCTG TAAATTCAGC TTTGAGAAAA 300
GCAATGTAAA AAATTGTTTA AAACCACTCA CTTATGTTTG GATGTCAAAA CTAAAATAAC 360
TGCAATCAAG ACATGTATCA GATGCATGAT AATGTAGGGA TTTCTTATAA AAATGCACAT 420
GAATCTATTT AACAGTTAAT TATAGTCTTA CCTGTGTTTC CTCCAGCTCT GTGATTAGCT 480
CCCTTCATCT TGGCTCTTTT CTTCTGTTGT AGGGGTAATT TTGTCACTCC TGAAACCACA 540
GACCACTTTT TAAAATTAAT ATTAGTTTAC ATTACTGTGA AATATCAAAG TAACACATTT 600
GTACTAACTT TAACATTTTA TTTCGCTCTT GTCGACAGTA CAGTGCTTAT TTTAGGCTTA 660
ATAAAGTAGA CTACCTCCAA TAAAACATTG TCAAACCTCT CATCTACACA TAAAATGTAA 720
TTAAAAGCCA ACACTTTTAT AAACAATAGC TAGCCTAATG CTAACGTTAC CACTGCTAAA 780
ACTCTAACGG ACTTTTTCCA AAGACACAAC AGTCTCTATA AAAAACATGT TCAACAGAAA 840
TATGTCAATT ACCAGTAAGA AAAGTGTCAG AAACAGTTAT ATGTAACATT TGCGTGATTT 900
TAGCGACTAA ACTTACCTGA AATTAGTGAA AACTGCCGCA TGAGAGAAGT GCTGTTGACG 960
GTCAGGTGTC GTGTAGTTGC TCCGTTTCCA TGACAACGCT CTCTGCTGCA GTGCTTGAAT 1020
GGGGCTCGGT AATGGACACT TTAAAGTCAC GCAGCATTTA CATAAACATT TAAACAATTT 1080
ATAAACATAT TAAATAATGA CATTTAATAT TAAATCTTGA TTTTTAAACT TAATTTTGTT 1140
TTGTTTTAAT AATAACCTGT TATATTTAAA ACCTCTTGTA GTTTTATTTA CTAAACTTTG 1200
CTTTTATTAA TAACTATATT TTTATTTAGT GCCTCATTTG TTTAAAATGT AAAAAGTGTT 1260
AAACAAAAGT ACTTATATCA GGTACAGAAC AGCCAACAAC ATTAAAAACA TCACCGGGTG 1320
GGCCATCGGT TAGCCACTGG TGTCCAGACG GCGGTCCACC CACGGTAATC CGCTGGTGGC 1380
ATGCCACCCA AAAAAACGCC GGTGGGCCGA CATAACTTTT AGAATGGGCG GCTTGCCGCT 1440
GGTAAGCCGA CGGCGGTCCG CCCATATCAA GCCGCTGAAT TTGTGCCGAC CAAAAAACGC 1500
AGACGGTCCG CCAACTCGAT TGTTTGCTGG GTATGTA 1537