EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-33571 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr7:40605200-40606507 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hnf4aMA0114.3chr7:40605736-40605752AGGTTCAAAGTCTAAG+6.19
RarbMA0857.1chr7:40605554-40605570TGAACTTCTGACCCTT-6.63
RargMA0859.1chr7:40605553-40605569TTGAACTTCTGACCCT-6.91
Enhancer Sequence
TACTTCATGA GTAGTCAATG CTAATGCAAC ATTATTTTAA CTGCAAAATG CGCTATTATT 60
TTTGTTACAA TGTAAACGCG AATACTTAGC CGCGGTGCGC TGTTTTCTCT GCTCTTAGGT 120
AGCCTGCGTT ATATTCACTT TTGGATGTAA TGCTAAAGAT TTGTGTTGCT TAAATATGGT 180
TTATTGGATT CGTTTATTTT GTTGCTCAGA TTTGTATATT AGCATTTACA TCCAACTTTT 240
TACATTTATT TATTTTAAAG AAAGCTAGGC CTCTGCTAAA GTCAGACAGC TTCGGGAATA 300
GGCTGTCTGT CCCCAACATG GCTTTCCACT CTCGTTGCAT TAGCAGGAAT CTTTTGAACT 360
TCTGACCCTT TGCCAATGCT AAGGAAGAAT AACATGCAGC TTACTAAGTG CATCGAAAAT 420
ATGTTTGCAG TGCAAATTAG CCTCTATTGA AGTGTTTCCG TGTAATTTAC AAAGTGATTA 480
TCCCGAGCAT AATTTTTATT AGGCTGTTTT GAACGTGCCT CTGTTAAATA GCTTTTAGGT 540
TCAAAGTCTA AGTCATGACC GGTTATAGCA AGGTTTGCTG AAGCATTGCG AATAATGTCC 600
GCCAAAGTCA ATTTACACGC CACGCGCAGG TGCATTATAA AGTTTCCCTT TTACCGGTCC 660
TTAAAAAAGA TGAAACCCGT GTCTGGTGTG GTTTTCTCAG ATGTATATCA AGCTCTACTT 720
AAGGTGAATG TGATTATAAG TGTGCAGTGA CCCGCGGGCA CACACGCTGC TATAAGCTAC 780
CCTTGCAATC TAGTAACATC AAATGAACGT CTCAGTCTTT CAAAGGGAGT TAACGAGGTG 840
TCCTGTTGAC AAATGTTTTG GAGAAGCGCA TCCGAGTGTA AGACAGGGTT TGTTGGTTGA 900
ACACGCTGTG CGGTGAATTG GACTTAACGG TGAAGCTCGC GAAATTAGGC GCAACTGCGA 960
GGGTATCCAG GAGGCTGTTT GCTCTGACAG GTAGCTGATA AGTGTTTCCT CTAAAACAGT 1020
TCATTTTGGG GGGAGATTAG TTGCTGACTG TGACTAGGCG GCTTGTTGAA CAAACCTCGT 1080
GTGGAGCACA AAGCGGCGGC ACAGGGGGTT CCCGCTGCGC TTCATGGTGG CTGAACAGAA 1140
TTTGGCTTGA TTTGCGGCAC ACGACTCAAT GAATTAATAA AGAGTTCAGG CTTCACGGCT 1200
CATCAATCCC CGGTAGTTTT GCTTAGGATG TGCTAGGTTG CATCTTTATG TCGCTTGCTT 1260
GTGGTTTACT CTATCAATCA ACAGCCACAA GTGTTGTAGA GCTAAAA 1307