EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-33249 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr7:28781676-28784058 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr7:28783120-28783130GTCACGTGAT-6.02
HOXA13MA0650.2chr7:28781809-28781820GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr7:28781809-28781820GTTTTATTGGT-6.32
NFYBMA0502.1chr7:28783587-28783602ACAGGAGCCAATCAG+6.32
NRF1MA0506.1chr7:28782099-28782110GCGCATGCGCG+6.02
NRF1MA0506.1chr7:28782098-28782109CGCGCATGCGC-6.02
SREBF2(var.2)MA0828.1chr7:28783120-28783130GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr7:28783120-28783130GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr7:28783120-28783130GTCACGTGAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr7:28783930-28783942TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr7:28783929-28783941TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
GTACATTTGG TCATTATGTG CTGAATTTTA GGATTTATTA AATGTTTAAG AAAAGTAATA 60
ATGTACTCAA CACGACCATA TTTTATATAG AAATAACTCT TATAGGATAA TAGTATGTTT 120
AGTCGGTTGT TCTGTTTTAT TGGTTGTTCA TGCGAACATA AATCAGTATT CAATACGTCA 180
TATTTAATAT TACTACGATT AAAACAATAA ACAAAACAAA TTAATGAAGC CAATAACAAA 240
GTAGGTTAAA TGTTTCATAT CGTACAGTTT AACACTCCAG AACATAGGGA GTGTACAGGA 300
CAGCACAAAA ATATAAAAAC ATATTATTAA TGTCACTCAC ACAAAACAAA ACGATGAATT 360
GTTCACGACT CCCTTTTAAA ACCTTTTACT CTGTGTTCAA CAGACCGAAG CATCACTGAC 420
AGCGCGCATG CGCGAGAATT TCACTCAAAG AAGGTTACCA TCCAGAATCA GGCAATCAGT 480
CAGTCAGTAT TCAAAGTCGA CTCTTTCGAA AATGGCGACA CGAAAGCGAA GTATAGTCTG 540
GTCATTCTTC CAAGCGGAGG ATGACAGGAG AGTATTGTGT CTTCTCTGTA TGAAGACGGT 600
TTTGTATTTT GGTCACACGA CAAACATGCT TCGCCATTTA CGAACGAAAC ACCCCTCTGA 660
TTTTTCCTCG CTGGACAAAA GGAAGCCCGC GACAGATGCG GTATCTAAAC GCAACGACAG 720
CGGTTGTGTG GAAGGTACGA GAGGCTACAG TACTGTACTC TTGCGTTTAA CATGATGCAC 780
TCCATAATCT TTGACTGACA ACTGGCTGGC TATGACACTT GCAAACCTGA TGTGTTTTTG 840
TCTTTAGCTT CTGGCGTTTT TTCCTTCCAT TTGGCCTACT TTACACGTGC TTATATCTCA 900
CAAAAAGTGT GTTCAGGAGC CGATACAAAT GCGCTTTATC GTTCAAAACA GTGCTCGTTG 960
TGATTGTGTG ATTCACTATC GACTCCTCGT TGAGAACGGG TTCGTCAGAC AGAGTCTTTT 1020
GTCAAAGTGA CGAGAGTTTC GCTTAGGCCA TGGTTTTGGG TGGATGTCGC AACGACGCCA 1080
TGTTGTTTTT TTAAACAAAT GTCAAATTAC ATCGCTCAAT GATAGAAGGC TGTTTTTGCA 1140
TAATTTGCAG CATGTTAGGC GAAATTCTCC GACTGGAGTC GATTCGATTC GACTCGTTCA 1200
GTCAAACAAA TGAATCTTTT GAATCGTGTC GCTGATTTGG ATCAGCTATA TACGGTGCTC 1260
TGAGTGAAAG AGCTTCCCCG CCCCCTCTCG TCCAGAATAA CCAGGGCAGA AAGCCTTCGG 1320
TGTCAACCGC TAGCTGAATG AACTGTCAAA TCTTCATATT CGGATGATCT ATGGTTAGTA 1380
AGCTCTATGT AGTTTGTCTT TTCCTGAAAT TTGAATTGTA TTAAACTGTA TTCGATCCGA 1440
AACCGTCACG TGATATACCA TCTGCCAGTT TCCCGTATTG GCGCGTTTTT TAAATTATAA 1500
AACTAGCAAG CAGTTGGCTA GAGCTATTTG TTATGTATGT TTAAGAAAAA TCACATTAAA 1560
ATGTTTTGTA AAGGATGATC ATGGAGGCAG CTGCTGTGTG TACAACACTT TTATTCACGT 1620
CAGTACTCCG CTTCCACGTA AAATTCCTAC ATTTGTTGGT TAGTAACGTC TGAATAGTCA 1680
ATTTAATAAT TGCTTTATTG ACATGACAAA TGTTGTAATG TATTGCCAAA GCATTTATAA 1740
AGTTTACATT AAAAAGAACA TAGTATACAG TAAATAGTAG ATTTAAAAAA GTATAGTCTT 1800
GAGTTCAAAA TATTGTATTA GATTATTATA TTAAAGGTGA CTAGAATACA CAATACTTGA 1860
ATGGGGAAAA ATGTCACTGT CAAAAGTGTG AATGAAGTCC CGCCTTCTAG TACAGGAGCC 1920
AATCAGCGGT AGCTTTATGA CGAACAAAGC CCGCCTTCTA GTACAGGAAT CAATCAGCGG 1980
TTGTTATAGA TTGACAATTC TCCAGGGAAG GGTCTGACCT TCGTGAGTTT CTGCAGATTT 2040
TGTGTGATAC AAACATCAAG AAATTAAACT TAATAGACAG TTGTTGTTTA ATTTGAATGG 2100
TAATTCATAT ATGAAATGTA ATTGTAAGTT TGGCGGGTAA TTTTGGAGAA TTTGATGTTT 2160
CCCCATTCAA ACGGAATGCC TAGAGGCGTT TCAAAGATGG TCTCCGAGTG AAATGACTTG 2220
CTTAAAGAGA CTTTGATCCA CCTGTCAGCC TAATTTAAAA AAAAAACTAT TTGTGTGATT 2280
TAAAAAAATC ATTTTCAATT TCATCAAAAT CATTCAGATC AGTCAGAGTA GAAGTGAGCA 2340
AACTGCATCA AAGGTATATT TGTCTCTGTC CACGCCCATG AA 2382