EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-33177 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr7:25454115-25456101 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr7:25455566-25455579GTATAATTAATTA-6.12
Lhx3MA0135.1chr7:25455569-25455582TAATTAATTATTT+6.71
POU4F1MA0790.1chr7:25454699-25454713ATAAATAATTTATT+6.02
SOX4MA0867.2chr7:25455476-25455486GAACAAAGGG+6.02
Enhancer Sequence
AATAGAGAGA GAGAGAGATG GGGAGCAGTC AGTTATTTTA TGTGTGGTGT GTGAGTGTGT 60
TTGTATGAGA GAGTGCCTTG ACCAACGCAG TGAGGACCGC TAACAGAATC TTCCCCAGAG 120
CCAAAGTCAT CGTCTCAACC CTTCTACCCC GCAGAGACGT ACCACAGAGG TCTATCAACA 180
CAATCAATGA GGAGATCACC AAAATCTGTT CCAAAATGCC TAACGTCCAT ATAGCCAACC 240
ATTCCCACAT CACACATCAC CACCTATATG ATCATATACA CATCCACCAA GAGGGCATGA 300
GACTGTTCGC AAAAACTATC AAGGCATCAA CCCTTAACAG TGCTCAAAAA ACACCCTGGA 360
GCCACGAAGA GAGGATTGAG CATCTCCCCG GCAACCAAGC GGACAGCTAC GCCACTGTAG 420
TGGCACACAG AGGTAGATCT GACCCCAGTG ACCTCACACA GATTAAACAA ATGCTGAAAA 480
TCATTTGCAA CAATTTATTA GGATAAATTT ACAGTGGATA TGTAGTCTAT AAACTGATCT 540
AGTCATTGTA TATTTTATAG TCATGAAATA ACCTATAGAA TTGTATAAAT AATTTATTAT 600
TACTGCTTTT TATTCACTGG TATTTTGTTT TATTTTTTAT TTTTATTTTT TATTTGGGTC 660
ATAAACTCGT ACATTGTTCT GGTAATTGCG CTATTACTTA ATGGCTTCTT TTAAAATAAC 720
AAGTTATAAT ATTCAAGGAA TGTTCTCTTC AGCCTTTGGG GAGAAAACTA CTTACCCTGA 780
TTTTGTAAAT ATTCTAGATA ATACAGATAT AATTATATTA CTTGAGACAT GGAGTCGTTT 840
AGACTCTAAT TCCCACACTC CCCCAAACTA CAGAGAGCTT TGTGTCCCTT CAATCAAACA 900
GCCTAATGTT AAAAATGGAA GAGATTCAGG AGGAATTATA GTTTGGTTTA AAGATCACCT 960
GTGGCGGTAT ATTCAGCCTG TAAAAAAAGG AACAACACAT ATTTGGATAA AAATTAAAAA 1020
AGGACTTTTA TGTTTAGGTG AGGACATGTA TCTTTGCGCC ACCTACATCC CCCCGTATGA 1080
GTCCCCTTAT TATAATGAAG AGATCTTCTC AATCCTGCAG TCAGAGATCA GTTATTTTCA 1140
GTCTCTAGGC TCAGTTTTAT TAATGGGAGA TCTGAACGCC AGAACAGGGA AGGAGGCAGA 1200
CTGCATTAGT TCAGACGGCG ACAAATATAC TATTGGCTCA CACACATATG ACCAAACATG 1260
TTTTGATAAA ATGCGGCAAA ACTATGACAA CATCATAAAC AAACATGGAA AACAAGTCCT 1320
GCAGCTTTGC AATAGCCTAG GTGTATATAT AGTGAATGGC AGAACAAAGG GTGACTCTCT 1380
GGGTCGACCA ACATATAGTT CACACCTAGG GGTCAGCACA GTAGACTATG CCATTACAGA 1440
CATTGACCAC AGTATAATTA ATTATTTTAC AGTGATGCCA CAACTGCCGT TTTCAGACCA 1500
CAGCCACATT GTTCTCAGTT TGAAAAGATC ACAGAATGCC TGCCTATTCT CAGAACAAAA 1560
AATAAAACTG CATCCCCTGC CACCTAAATT AATCTGGAGT AAAGACAGTC CTGCCCAGTA 1620
TGAAGCAGAG CTCCACTACA CTCAAGTGGA GAACATGATC AATGCATTCA TACTGACTTC 1680
ATTTGGTAAA GAGGAACAAA CTATAAATTT AGCAACCGAA CAGCTGACCA ATATTTTTTC 1740
AACAGTTGCC CAAAAAATAT TGAGGAAAAA TCTGAAATAC AAATCTAAAA AAGGAAAAAC 1800
TACAGCTGGC TGGTTTGACA AAGAATGTCA AAATACAAGA AAAGAATTAA GACAATTGTC 1860
AAATAAAAAA CACAGAGATC CGACAAACCA ACACACACGA GGAAAATACC AACAAACTCT 1920
CCAAATGTAT AAATCACTAT TAAAAGAAAA GAAAGCTGAT CACATGAAGT TAAAATTGGA 1980
TCAAAT 1986