EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-33150 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr7:24302047-24302988 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr7:24302956-24302973ATAAATTAATTAATTTA+6.07
ArxMA0874.1chr7:24302957-24302974TAAATTAATTAATTTAT-6.07
DBPMA0639.1chr7:24302870-24302882TATTACGTAACA-6.32
DBPMA0639.1chr7:24302870-24302882TATTACGTAACA+7.22
ETS2MA1484.1chr7:24302555-24302565GACCGGAAGT+6.02
HLFMA0043.2chr7:24302870-24302882TATTACGTAACA+6.27
Lhx3MA0135.1chr7:24302616-24302629TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr7:24302958-24302971AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr7:24302617-24302630AATTAATTAATTT-6.92
Lhx3MA0135.1chr7:24302959-24302972AATTAATTAATTT-6.92
POU4F2MA0683.1chr7:24302074-24302090ATGAATAATTAAATAG+6.54
POU4F3MA0791.1chr7:24302074-24302090ATGAATAATTAAATAG+6.27
POU6F1MA0628.1chr7:24302618-24302628ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr7:24302960-24302970ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr7:24302618-24302628ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr7:24302960-24302970ATTAATTAAT-6.02
SPI1MA0080.4chr7:24302317-24302331AAAATGCGGAAGTG+6.84
SPIBMA0081.2chr7:24302319-24302331AATGCGGAAGTG+7.22
TEFMA0843.1chr7:24302870-24302882TATTACGTAACA-6.04
TEFMA0843.1chr7:24302870-24302882TATTACGTAACA+7.22
Enhancer Sequence
CAGGCTAATG GCCGACGTCT CTCAGAAATG AATAATTAAA TAGGAATGCA TTCGTTTAGA 60
TTGCAACTAT GCAGTTTATT TATAAGGATA GTGCCTGACT AAATTAAGCC TCAAAAGTAC 120
ATTGTGTTGT ACAACAACAG CAATATTTGC CAAAGTGTTC TGCCAAAGTG TGCCAGAGTG 180
TTCTGCTTGT CGCTGTTATG TAGGCGGAGT AATACACGAG GGTGAAGAGG CTGGTCAAGT 240
GCTGTTACCG GCAAATACTG ACCTTATTTT AAAATGCGGA AGTGCGCCTG TTTTCGTGAT 300
TGTCTTAGAA CTTCCGTTTC AGTCGCCAAC GGGAGAAATG ACTAGGAATA ATAAACGGCA 360
AAAAACGGTC AAACTAGTTG CTCTACAAAC AAATGTTTGC ATGACTATAC AGACCAAGTA 420
GAATAATATA ACAAGGAAAT ATCAGTTTGC AACATCAAAC AGCGAAACGA GCAGTTTTTA 480
ATGTCTAAAA ATGAATGGAA GTGAATGTGA CCGGAAGTCT CGTGCCAAAA AGATTCAAAT 540
GGCAGCGCCC GCTCGTCACA TATATATTAT AATTAATTAA TTTTTTTAGC TTCTAAATGA 600
ATGTTTGTGC CCTTTCCACT AGATGTTGCC TTTGTTCTCT CCTCTTTCTT CTGAGAGCGC 660
TTCAGTCCCT GTGTGGTTTT GTGGCATAAG TTGTGCTGTG ACATCTGTCC TGCTCTCACT 720
GTTTCTGCTC ACCCACTGAA AGTATCAGCT AATGAGATCT CTCCATTCTT CTGGTGGAAG 780
GTAATGCTTT TATCTGGGTA TTTCAACATA GATCTGTAAT ATTTATTACG TAACATAACA 840
CAAACAACTT CTCAGGGAGT GTGGATGGCT ATTATCGGCT ATGGAATTTT GAAAAAAATG 900
CAGCTGTTTA TAAATTAATT AATTTATGTA TTTTTTATGA A 941