EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-32656 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr7:5904378-5907827 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr7:5906491-5906508TGAACTAATTAATTAGG+6.16
CDX2MA0465.1chr7:5905025-5905036AAGCAATAAAA+6.32
FOXA1MA0148.4chr7:5904492-5904508TTTTGTTTACACAATC-6.4
FOXC2MA0846.1chr7:5904907-5904919TAAATAAACAAA+6.18
FOXP1MA0481.2chr7:5906884-5906896TACTGTTTACAT-6.11
Foxj3MA0851.1chr7:5907233-5907250AAATTTGTTTACCTTTT-6.73
Lhx3MA0135.1chr7:5906493-5906506AACTAATTAATTA-6.22
ZNF384MA1125.1chr7:5907246-5907258TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr7:5907247-5907259TTTTTTTTTATT-6.62
mix-aMA0621.1chr7:5906497-5906508AATTAATTAGG+6.32
mix-aMA0621.1chr7:5906494-5906505ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
AGGGAGGAAA ATTAATACTA AAAATATAAA TAAAAGTCAT TAAGTAGATG GTTAAAAAAT 60
GGTTCTTACA TAGACAGTAA TAAAGATGTC CAACTGCTGT AATAAAAGTG ACAATTTTGT 120
TTACACAATC TGATACATTA AGTCTTCGAG ACATTGGTGT TACTTAGCAT TACATGTTTA 180
TATGGACTGT AAATGGTAGA TAATTATGAT GGCAATGTCT ATGTAGAACT TACAGTACAT 240
GTACAATAAA TTAAAATTTA AACAGATAAT GTGTAACATG TAAAATGATA CTTGCAAAGA 300
AGGCCAATGC AGCCACAATC CCATGAAAAA CATTTATTAA ATCAAAGAAA TATCTAAGAC 360
GATTCAGAAT TTTCACAGAA AAATTAAACA AATTAGTTGT AAATCACTAC TAATGAGGTG 420
AAAATGAACA TTAATTACCT TAAGAAAGGT ACTGGTGATC ACTCTTCAGC TGGAAGAAGT 480
GGTAGAGGAC AACACAATCT AAAAGATGAG TAAAAAATAA GTAGATCAAT AAATAAACAA 540
ATACAAACCT TGACAGTTAC TGCCAAAACA TTTAGTTAAA AGATAACTTG GAGCAGAGGG 600
TGCAATGATC TGGTATACAA AGATATAGAC ATGGCACATT TATAGACAAG CAATAAAAAG 660
AAAATAAAGA AATCATTATT ATAGTTCACT GATATTAGTT TAAAGTTACA ATATTATTAT 720
TCATGATTTT GCATAGAAAA TTCTCTCTTG TTAAATTTGT ACCACATCCA CCTTGACAAC 780
AATTAGGTAA CCAGTCACAG CTACACGTGA TGAAGTCATT ATGGCATTTG TGCTGTGAAC 840
ATGATTATTT TGCTGGTTTA TTATTTTATT TTTGGTCTCA TTTCATCAGT AGTCAGAAAA 900
AAAAATCTTT GAAATAATTG TACAGTAAGC TTTAAAATAC CCTTGGTCTG TCTCAGACTT 960
AGTTGAATTC AGTTTTTTAT AGTTTAATAA AACACTTCTG TAAATTATTC ATTTAGTTTC 1020
TTTTCAGCTT AGTCCCTTTA TTAACCAGGG GTCGCCACAG CAGAAAGAAC CGCCGACTTA 1080
TCCAGCATTT ATTTTAAGCA GGGGATGCCC TTTCAGCTGC AACTCATCAC TGGGAAATAT 1140
CCATGCACAC CCATTCACAC ACACACACAC ACTACAGACT TTACCTATAC CACATGTCTT 1200
TGGTCTGTGG GGGAAACCAG AGCACCTGGA GGAAACCCAC GGCAACACGC GGAGAACATG 1260
CAAACTCCAC ACAGAAATGC CAACTGACCC AGCCGAGGCT CAAACCAGCG ACCTTCTTGC 1320
TGTGAGGTGA TCGTGCAACC CACTGCGTCA CTTTAAATTA TTGTTGCATC CATTTCATAT 1380
TTACTCATAT ATATCATAGA ATGTGAGATT ACTTTAAATA AACAGATTAG CTAATAATGT 1440
TTTGTAATTA CATTTAATGT CTCTTTTCAA TTAAATTATA TTTACTTGAT GCAAAATGTG 1500
TTTGTTTCAA GTAGGAAAAA AATTCTTGAT CACCACCTCT GCCTTATTTT GAGCCAGGAA 1560
TAAATTGTAT TGTTATTGTT AATATATAAT GTCGAACCAT TAGAATATTA AGTATACATA 1620
GACAGGAATT TATTGTATAT CTGGCAATAC ATTTGTCATG CCAAAAACAA AACAAAACAA 1680
TGATTGAATT GAAAAGGGAA AAACGTGGAG AAAAGGGAGA TGTGCCAAAT AATACACAGG 1740
GATGGATGAA TATGTGTCTA TTAAGATAAA TATGTAAAGT TCCATTATTT GTCTGTCTGT 1800
TAGGCAGCAC TTTAACTACT TTTGTGGTTT ATGTGCTGCT TTCCTAAGGT TACATCAGGC 1860
TAAATTCTTA TCACAGAATA AGAAATAAAA TGTACAAAAT GAGAATACTA TGAAAATGCT 1920
TTTACTACAT CTTATATAAC GGGTTAAGTT TTTACTGTCA TCTGTTTGCG TTGCTTAGCA 1980
ACGCTAGTAA ACAAAGGAAA GACGAAGTGC GTGTAAATAT CTACGTGCGA TCCGCTAGGC 2040
CACGGATTCT CAATCCTGTT CTTGGAGATC TACCTTTCTG CAAATTTCAG TTGGTACCCA 2100
TATCAAACAC ACCTGAACTA ATTAATTAGG ACCTGCATGC CACTTGATAA TTACAGGCAG 2160
ATGTGTTTGA TATGGGTACC AACTGAAATC TGCAGGAAGG TAGATCTCCA GGAACAGGAT 2220
TGAGCACCCC TGCGCTAGGC CAAAGGCCTT TATGTATGGC GCCCTCTGGT TTCCCGTATG 2280
AATGAAATGG GCATGAAGCT CTAAGTTCAT CGCCTCAGTA TGGGTAAAAA TGGTAAAATA 2340
TCAAGTAAAG ACATGATATT CCATCAATAT TTCATCAAAT CTGGAGACTA ACAGAAAAAA 2400
ATGCATACTT TTGGGATAAA AGTCAAGAGT TTATTTAATG ACAAACGACT GCATTTCTTT 2460
ATAAAGCATA TAACGTTAAG GGGTCAAACG TTATAAACTG AATTAATACT GTTTACATGG 2520
CAAAATAACG AACAGGAGGT ATAAAATGCG AGTAAATTAG ACTGAGGACA AAATTCGTCG 2580
CACACCATCC GGTATAGTTC CCTCACAAGA CTAATTTAAT AGTAATGCTT AATAACGATT 2640
TATTCGTTTC TCAAAAACAA TTAGTTCATA ATATATCTGT CTGAGTATAG CCAATTTAAG 2700
CACTCGTACG CATTTTTTTT AACATTTAAT TGAAAATTTA CCTCAGAAAT CGTTCCTAAT 2760
GCGAGACCCA ATGTGCGGAC CATCGGACCG GATGATTAAG GACAGGTTAT GGAAAATCCC 2820
AGCGGTCTCA TTGGCCAGCT CTTATGTTTA CGTTAAAATT TGTTTACCTT TTTTTTTTAT 2880
TTTTTTTAAA GAAATACCAA GGTATTTCGC AAACTTATCT TGCTTATATC TAAAAAATAT 2940
TAGTACAAAA TAAGGTACAA TACATAATTA TAAATATAAA AGATATTAAC TAAAATTATA 3000
AGTATTGTTA CTGATAAAAC TCAAAACAAA ATCGTAATAA TTGTTTTGAT AAGCATACAA 3060
TCGTCTTTTA ACACTCTAGT GACCAACGTA AAACATTACT CATTTAATAA GAGAATACAT 3120
CAGTGTGATA TTTTAATGAA TTATGACCTC AGAAATGTTT CAATGTACTA CATATAATGA 3180
ATTTTAAATA ACAATTAACA TTACACGAAT AAAATAAAAA ATAAAAAAGA CATGGATATC 3240
ATTTGATAAA AGGTTTCCAT CTGACGTCAT GTCCCTTGGT GATGGATGCC TCGCTTCTGA 3300
TTGGATGCGC CTCACTGTCA ATCCACATGG ACATCCATCT GACGTCATGT ACCTTGGTGA 3360
TGGATGTCTC GCTTCTGATT GGATGCGCCA CATTGTCAAT CAACATTTAT TATATGAATA 3420
AAAATAATAA ACAAAAATGC ATGAACATC 3449