EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-32613 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr7:5450599-5453067 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr7:5451507-5451519TAAGTAAATAAA+6.07
HOXB9MA1503.1chr7:5451325-5451335ATTTTACGAC-6.02
HOXC10MA0905.1chr7:5451325-5451335ATTTTACGAC-6.02
HOXC11MA0651.1chr7:5451325-5451336ATTTTACGACC-6.62
HOXC12MA0906.1chr7:5451325-5451336ATTTTACGACC-6.32
HOXD10MA1506.1chr7:5451325-5451336ATTTTACGACC-6.32
NR2C2MA0504.1chr7:5452089-5452104TGGGGTCAAGGGTCA+6.61
Nkx3-2MA0122.3chr7:5451447-5451460TAAAACACTTAAA+6.33
Nr2f6MA0677.1chr7:5452090-5452104GGGGTCAAGGGTCA+6.81
RXRBMA0855.1chr7:5452090-5452104GGGGTCAAGGGTCA+7.28
RXRGMA0856.1chr7:5452090-5452104GGGGTCAAGGGTCA+7.17
RxraMA0512.2chr7:5452090-5452104GGGGTCAAGGGTCA+7.1
ZSCAN4MA1155.1chr7:5451716-5451731CACACACACTTTAAA+6.01
Enhancer Sequence
TCCTCGCAAA CTCTGTCAAT TATTTACAGA GCTCTGAACG CTCTCCTTCC AGTGCATCAG 60
TATATAAGTG TGTCTGAAGT ATTAGGAATT AGGAATTACT CACTTTCTAA ACCCCTGAGG 120
CCTTCATTTA TCTTCAGAAC ACACTCGGTC ACTTCAGAAT CAGTGCAGTT ACTTGCGTTA 180
TGGTGGGAAA AAAGCTTTCA GAGTAATAAC ATTGTGAAGG AAGTTACTTT TTGACATGCA 240
TTACAAACCG CAGTCCTGGA GGGCCAGTGT CCTGCATAGT TTAGCTCCAA CTTGCTTCAA 300
CACACCTGCC TGGAAATTTT TGTATACCTA GAAAGAGCTT GATTAGCTTC AGATGTGTTT 360
GAAAGAAATG GAGAATACAT GTCAAGGACT ATCCAACAGC TTTTTATTTG TATGAACCAT 420
CAATGCACAC CTACAAATTA AAGTCCAAAA GTTAGATTTG TAATCCTACA ATTGGACCTG 480
GTTTTGATTA GGAAATCTGC ATCAATGGAT CATATTAGAG ACTGTTAGAC AAGAGAACTG 540
ATCTGCAGGA GGAAAAGCAC ATTGATGGCT GGTCTGGAAT CAGTGGTTGG ATTTGAAAGC 600
CTGTTTGTGG ATTTCATTGT GGATTATCGA TGGCAGAATC AAGGTATGAG ATGTGATTTT 660
TATAAGCTGA AAACTAGCAT AACGCTGACT TGACAGATTT GTACATGATG TGAACAAGCA 720
GTGAGCATTT TACGACCCAA AATGGACCGT TATCTTGTAC TTGTTTCTCA CAATTGAAAA 780
TATGGATTTA ATATATTTTC ATTTTGTCAA GCCTCCTGTT GACAGGTGCT GAGAATTAGC 840
AAGTCTGCTA AAACACTTAA ACAAATGCAT TTGGCTATCC AGTGTAACTG ATGACCATAA 900
TAAATAAATA AGTAAATAAA TAAAAAATTA TATATTTGTA GGTATAGCCA GCAATATTTT 960
AAATTAGACT AAAATTTTAA ACATGCATTT TGCTGCATGT CCCTATAATG ATGCATTTAT 1020
CATGTTGGAA TGGGGAATAC AAACTCTACA AAGAATTACT ATAAACATGA CATGTCCCTG 1080
AATATATATG TGTGTTTGAA AATAAACTAC AAGGTTACAC ACACACTTTA AATATTAAAC 1140
CCTGCAACAT ATTATACGAT TATAAATTTT GCAAACATTT GAGACGTCAC CCACAATAGA 1200
GATATCGCTA TTATTAACCG TATAAAAGGA TTTACAAATG GATTATGCCG GCCAAATGCG 1260
AGAAATAAGC CATTTACAGT CAGCATTACG CGTGACGTCA CTCTATTGAA ACAGCAACGC 1320
CCCTTCATTG TTGTAATTAT TTAATTATTT TACATTTAAA CCCCAAGTTT AAATACCGCA 1380
AGGTGTATTA AATGTATGCA ATATATTTGC ACAATAGAAC ATAATATATA AACGTAGCTA 1440
TATTATTTAC TTGAAAAGCC CGCGAAATGA CTGGCCGAGG ATATAAAAGC TGGGGTCAAG 1500
GGTCAGCGCG AGCGCGCGCG TGGAAGACGT TTTCCCGACT GGATCTCGGC GTGAGGGGAT 1560
TGCGCTGAGG TAAAGTTTCC ATTTCAGGTC TGACAGAGAT AACAGTGAGG GAAAAGTTTC 1620
TCAAAGCAAT TTAACCACTG AAAGTTGCTT CGTTTTTCAA TGAATCCACC ATAATGTTTG 1680
CAGAAGTCAT GGCTTTTAGT CTATTTGCGA CCGTCCACTC GTCAACACCG GTAAAAGCCG 1740
TTAAATACCG TTAAAGGTCA GATGACTCGG ATTGATACGC CCTATGCCAT GATAATATTA 1800
GCGAGAGGAA AATAATATTT TTATTAATTA TTATTTTAAA AATATGTAAA CCTAGAAATA 1860
TTACTTTGTT GAAAAGACTG GGCGAGATAT CAGCTGCGGT CAGCGTGGAC ATTGAAGAGT 1920
GAAGTGTTTT TCTGACTGGA TCTCCACATG AGAGGATTGC GCAGAGGTAA AGTTTCCATT 1980
TCAGTTCGAC AGATAACATT GAGGGAAAAT TTGTCTCAAA GCAATTTAAC CACTGAAAGT 2040
TGCCTCGTTT TTCAGTAAAT GTACTATAAT GTTTGTAGAC GTAATGGCTT GTGGTCTTTT 2100
TGCTACCACA AACACTGTTA AAAGCCGTTG GAAGTCTGAT GTGATTTCCT CGAATAGAGC 2160
AAATGAGCTC GGATTAAATT AGATTTTATT AATTGTTATT CATTGTAAGT AAGTTAATGC 2220
GATAGTTTGC AAAGTATACA TGCTTATTTT GCATTTTAAA TGCCCAGAAA CAAACTTTGG 2280
TAAAGCCAAA ATGGCTAAAT GAACTAAACA GGTTGAGCAA AAAACGGAAT TTAATTTTTG 2340
AAAAGGTGTT TGAGGCTTAT ATATCATTAA AACAAGGCTT AATAAATAAG TAAATGCCTT 2400
TACAAATATC TGGACTAAAT ATATTTGAAG GAATATGGCG TCATAGAAGT TAATGTAAAC 2460
TGTTTTTA 2468