EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-32609 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr7:5440730-5443032 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr7:5442289-5442306GTTTTTGTTTATTATTA-6.08
Foxo1MA0480.1chr7:5441093-5441104TGTAAACAGCA-6.14
LMX1BMA0703.2chr7:5441301-5441312AATTTAATTAA+6.32
MIXL1MA0662.1chr7:5441314-5441324GTTAATTAGA-6.02
NFYAMA0060.3chr7:5441156-5441167TCTGATTGGTT-6.62
ONECUT2MA0756.1chr7:5442302-5442316ATTATTGATTATTA-6.02
ONECUT3MA0757.1chr7:5442302-5442316ATTATTGATTATTA-6.36
PHOX2AMA0713.1chr7:5441300-5441311TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr7:5441300-5441311TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr7:5441300-5441311TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr7:5441300-5441311TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
TGGGGTTTTG GAGACGTCTG CATCACCATA TGTGGATAAG AACAGGACGT GTGTTTGGAT 60
ATAAATTGTG CTTTTTGACC ACGCTTCGTT ATTGTTGTTT ATTTATTCCT TTGCTGGAAA 120
TTAGAACTGA ATTTAGAAAT AGTGTTGAAA CAAATCTTTG CACTTAACAA AGGAAATTAA 180
ATATGTAGGC TAATGGATAT CTTCAGTGAA GTGCGTACAA CACTATTTCC TTACTCCAGG 240
AGTAAAGAGT GAAGTAAAGA GGCTGAATGG AGGAGGCTCG TTCTTTATCC TCGCGCTGCA 300
GATGCTTTGT TTAACTGTTT TCTCGCTAGT GAAGCGTTCA TTTTACACTC ACAAAATCCT 360
TGATGTAAAC AGCAAATGCG CCACGGCCTG ACACAACTGA CTCTTAAAGG GAATGAGAGA 420
TGAGACTCTG ATTGGTTTTA TGCACATTAT GCTCAAAACA CACCCTATAC AGAATCTGCG 480
CAAGCAGATT TTAGCCCTTC ATGGAGGCTT TATTTACTCG TGTTAATGTG TGTAAATTAC 540
TTTACACAAG TATATTATAT TTGTTCAGTT TAATTTAATT AAATGTTAAT TAGATTCAGC 600
AATATTGACA AATTTAAAAA GTGTTCGTTT GATTTATAAT AAAGTTTCTA ACGTAATATT 660
TTCTGTCTTT TAGTAGATCT ATTATATGAG AGACTTGCTT TGTTTAACAA TTAAGAATTT 720
TTACAAATTC TCAGCAGAAA TAGCAAAAAA TATCTGCAGA TTCTGTCTGG CCCTACTCAT 780
AACTGATAAA GAGAATATCA CAGCCCTGTT AGAGCATGCG CCAGGTTGTG CAGAGTGCAT 840
TTTTCCATCC TTAAAATAGC GAAAGTGGAT TCGGACTCAG CCCCTTAATG CTTTTGGGCC 900
ATGAGCTTTA GACTTTGTGC CTAGATGGTT AAAATAGAGC CCTTAGATAG TTTTGAAGTA 960
GTTATGAAGT AAAAATGATG AGGAATATTT TCCCAGCGTT TATGCATTTT GTCAGTACAT 1020
TTACACTAAA ATGACGGCCT GAAACAAACT TTTGAATACA AGATTCAGAG TGAACTTTTA 1080
GAAAACTCTG CTATTTATAA TCTCTGTGTT GATTACAAGT GCAAGTCTGT GAAAATGGTG 1140
ACATCGTGTG GATGAGTTAT GTGTGTTTAG TCTATAAGGG GTTTCTACTT CCATCACAGT 1200
TTGTTCAGTG ACCTGTTTGC TGAGTATCTG GAGATACTCT GATGTAAACA ACAGCATGGA 1260
TTGCACGGTT GATGTGCAAC TTAACAAACT AATATGTTTT TTTTTCAGTT CGACTGATCA 1320
ATGCAGCCCA AAACACCACC ATAATTGATC AGTTTAATGT AATTGTTTAT GTTCTCTGCC 1380
TCCAATATGG TCGCTTATTA ATGCATCATG TAAAATCTGT AAAGGAGCTC CCGTTTTAAA 1440
GCTGATTTAA ATGTATATTG TGGAGTTACT AAAGGATCTA CAAGTTTAAA AAGCAGCTAG 1500
AAATAATAAA AAAGGTAAAC TACTCCTTTC TATTGTAGTT ACTAATGTAT ATCCTCATTG 1560
TTTTTGTTTA TTATTATTGA TTATTAGTGT TCATAATCTG TTTCTGTGTT ATAATGTGGA 1620
TGTGCTAACT TAATATTTGG TTAGGGTTCT GATTGTTTAA TGTTTAGTAC ATACACAATA 1680
TTAAATTAGT GAAAGCATTG ATGGAAGGAC TGTTTGTTGG ACTGGACTTT ACTAGAACTA 1740
TGTTAAGCTG CTTTGACATC ATCTACATTG TGAAAAGTGC TGTATAAATA AACATGAAGT 1800
GAAGTGAATT GCAGTGTTTG TGCTGTTTCA GATACTGAGC AACATCACCA TCTGCTGGCC 1860
TGGACAATAC AGCTGCGCCA TACACACAAC ATGTCAACAA TGCAAAATAT TGCTTCATTT 1920
CTGTACATCA TTGCTGTGCA AACATATATT TAATTTTATA CTGAGACAGA TGCAGCTCTG 1980
AGTTATTTAA AAGGCATAAT AAAGTTATTT AATCACATTT AAAGGTCTGG ATCAGGGCAC 2040
GTGTGTTCTC ACTCAAGACC ATTGGATAAA TAATTTCTGT GCTCACAATA ACTTATTTGA 2100
GCTTTTGGCT ATTTTAAGAT ATTGTATTAC AGTGCTTGAT TCATTATTTA AACTGTAAAA 2160
TAAAAAGACA GACAAATCTT CCCTCTGCTG GTCGGTTATT ATAGTATTAC ATCTTAATGA 2220
TCTAGAAAAT TATTTTATTT ATCACAAACA CTGTAAATCT GTCTGCTAAC AGTAGCATAA 2280
ACAGGATGAA ATGTGTTCTT TT 2302