EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-32472 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:60145817-60146835 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr6:60146652-60146671TTTCCACCAGGTGGCGCAA+7.34
ZNF143MA0088.2chr6:60146741-60146757TTCCCACAATCCAACA+6.06
ZNF24MA1124.1chr6:60145917-60145930AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
CCTGCAGAAA CTCTGAGCTG GAAGGGCATC CGCAGTGTTA AGCATATGCT GGATAAATTT 60
GCGGTTCGTT CCTGATGAAT AAAGGGATTA AGCAGATGGA AAATGAATGA ATGTACCCAA 120
TCATGCTAAT TGTTGCTATC AAATAAAAGT GAGTTTTCTG TCAGTTGTAC CCCTGTTGAG 180
CGGGTTTACA CCTAAACTGG TTTAATTTGG AGCAGAAATG AGGAATGAGA TGAGTTTATT 240
ATTGCTCCAT GCGAGGGTTT GCTTGATTGG CTCCAATTGG CGCCTCCGCT CATTCAAACT 300
TCGCGCCTCG AGAAGTGACG GTTGACGTTA TTAAGTTTGG TTACGCAATC GTAAGGTTTG 360
GTCGCTTTAA TTCAGGATGT TTTCACCGAA TAACTTCATT AATATTTAAG ATACAAGTAA 420
CTTACAATGT TTGACATGAC AGCCCAATCG CGCAGCACGT CAAAAATGGC TTTCAGAAGC 480
ATCTGCTTTC GTGTTCAGAA GTGTTTGGAA CAGACATCAG AGGTGAGCGA AAGACCAAAC 540
TCCAAACTAG CCAACAAAAA CACTCCTGTA ATTTGTCTTA GTAATATGTT TAGTTATACC 600
CTTAACATGG TAGCAACATT AAACATAACG TTAGACAAAA ACTTCAACTT CAGAAACATT 660
GAAAGTAAGC ACTTTATAGG GCTTCGCCAT GTAGGCATAT GTCAAGAGTT TGTGAAGTTT 720
AAGCAGGCAT TTTCTGTGTG GGTTGTTCAA GTTAAATGTT CTTATCGTAG TTTAAAAGCC 780
TGTACCCTGA TTTCTTGTTT TATTTAAAAA TGATTTCCAA TTCAATATGT TCATGTTTCC 840
ACCAGGTGGC GCAAAAATCA CAACATTCTC TCTGAAAGCG CGCGCTCTAG TAATAAGAAA 900
ATGGCTCCTC TTTTTAAACT CAAATTCCCA CAATCCAACA CGACCACAAT TTTCTCCATT 960
TCGTTGTTGA TAAAGAAACG CGAATAACCA TTATATATTT CGCATTTGAC AATATCCT 1018