EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-32433 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:58701610-58703210 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr6:58702716-58702728AAACATATGCTG+6.04
CTCFMA0139.1chr6:58702965-58702984TCTCCACTAGATGGAGCCA+6.27
Hmx1MA0896.1chr6:58702835-58702852TAAAGCAATTAATTAAT+6.06
Hmx2MA0897.1chr6:58702835-58702852TAAAGCAATTAATTAAT+6.37
Hmx3MA0898.1chr6:58702835-58702852TAAAGCAATTAATTAAT+6.44
IRF3MA1418.1chr6:58702371-58702392CGGTTTCGGATTCGTTTTTTA-7.12
IRF9MA0653.1chr6:58702372-58702387GGTTTCGGATTCGTT-6.79
Lhx3MA0135.1chr6:58702841-58702854AATTAATTAATTT-6.92
NFYAMA0060.3chr6:58702449-58702460TCTGATTGGTT-6.62
POU6F1MA0628.1chr6:58702842-58702852ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:58702842-58702852ATTAATTAAT-6.02
TEFMA0843.1chr6:58703166-58703178TGTTATGTAATA-6.04
ZNF24MA1124.1chr6:58702795-58702808AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr6:58702799-58702812GAATGAATGAATG-7.82
Enhancer Sequence
GTTTTTGGTG TGTTTTTATT GGTTTTAAGC ATTGACATAC AGTTTCTGAT TTGTTTTTAT 60
CATTGCTGTG CAGCTGTTCA AGTGTTCTGT TTGGTTATTA GCGTTTCTGA CCGGTTGCTG 120
GGGTTTTTTG GTTGGTTTGT AGCATGTTGC TGTCAGGTTG TTGAGGTGTT TTGATTGATC 180
TCTAAATTTA GTCACACAGA AAATCCCAAA TTTAGGCCTG TATGATTAAT ATTCTTAATT 240
AATGCAAGTA ATATATATTA CACACTCATT CACACACACT CATAATCCAA TTTAGTTGAT 300
CAGTTCCCCT ATAGCACATG TGTTTGGACT GTGGGGGAAA CTGGAGCACC CAGAGGAAAC 360
CCACACCAAC ACGGAGAGAA AATGCAAACT CCACACAGAA ACAAAAATTG ACCCTGCCGG 420
GACTCAAACC AGCGACCTTC TTGCTGTGAG GCCCTGTGTT GCTTCGAGAA TAAAATAAAG 480
GACAAAAACT TTACCAAAGT AAATGAATAA ATTAAAATAA TTCATTAATT TTCCTTCAGC 540
TTAGTCCCTT TATTCATCAG GGGTCGCCAC AGCGGAATGA ACAACCAACT ATTCCAGCAT 600
GTTTTACACA ACGGATGCCC TTCCAGCTGC AACCCAAGTA CTGGGAAATA AATTATAGTA 660
ATATTTAAGA ACCAAATCCT TTGTGGATGG ATTTTGGCAG CGGTTGGGAT GTTTTTGCGC 720
TTGTTTTTGT TGTGTTTTAA TTGGTTTTCA GCGTTGATGA ACGGTTTCGG ATTCGTTTTT 780
TATCAAAGCT GTGCAGCTGT TGAGTGTTTT GATTGGTTAT AAACGTGTTG TCGGTGTGTT 840
CTGATTGGTT TGTAGAGTTT CTGGACGGTT GCTGGGGTGT TTTGATTGGT TTGTAGCACG 900
TTGCTGTGCG GTAGTTGAGG TGTTTTGATT GGTCTCTAAA TTTAGTCAGA AAAAAAATCC 960
AAATTTAAGC CTGTATGATT AATATTTGAT TAATATTTAA TATGATATGA TATTTAATAT 1020
GATTAATATG ATTAAAAAAT TTTAGAGAGA GAGAATGTGT ATGTTTTCCA GTACTAGGTT 1080
GCGGCCGGAA GGGCATCCGC TGTGTAAAAC ATATGCTGGA TAAGTTGGTG GTTCATTCCA 1140
CTGTGGCGAC CCCTGACGAA TAAAGGGACT ACGCCAAAGG AAAATAAATG AATGAATGAA 1200
TGAGGCCTAC AACATGTAAG AGTCGTAAAG CAATTAATTA ATTTCTGTTT AAGTTGTGAA 1260
CAGAAATGCA CCAAAATACT ACTAATAATA TAATGAGAAA TAAGTTTGTA AATGATGAAC 1320
TGAAATGATA TTCATAAATG GGGGTGTTAA TTGTTTCTCC ACTAGATGGA GCCATAGATT 1380
CGTATTTGGT TAGTTGGGTT ATCTATATAT AAAGAAAATA CAAACATGAA TTTCGTTATT 1440
AAAAATGGAG CCGATCCGTG TTACAATAAA ATCTAATAGA ATTATTGTTA TTAGAGTTAT 1500
TGATAGTGAT AGTAAATATT TTGAATATGG ATATGGAGGG ATTACATCAA TCTGTTTGTT 1560
ATGTAATAGA GCTATATTCA CTAATTGTGT AACGAAATAT 1600