EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-32422 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:58287624-58289082 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr6:58288676-58288687TATGTAAATAT+6.62
FOXC1MA0032.2chr6:58288676-58288687TATGTAAATAT+6.62
FOXC2MA0846.1chr6:58288475-58288487TTTGTTTATTTA-6.18
FOXD2MA0847.2chr6:58288476-58288489TTGTTTATTTAAT-6.06
FOXE1MA1487.1chr6:58288475-58288490TTTGTTTATTTAATT-6.29
PKNOX1MA0782.1chr6:58288345-58288357TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr6:58288345-58288357TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr6:58288345-58288357TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr6:58288345-58288357TGACAGCTGTCA-6.92
POU2F2MA0507.1chr6:58288638-58288651TTTATTTGCATAT+6.98
POU5F1MA1115.1chr6:58288640-58288651TATTTGCATAT-6.02
Pou2f3MA0627.1chr6:58288637-58288653TTTTATTTGCATATAC-6.29
TGIF1MA0796.1chr6:58288345-58288357TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr6:58288345-58288357TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr6:58288345-58288357TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr6:58288345-58288357TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
GTAAATGAGA CATTCTTCAT CCCTTACCTG ACAGAAAATT AGTAAACCGT GTGGCGATGT 60
TCATAATGTT TGTCAGGCGT CGAGTGATTT ACAAACGCTT GCGAATCTGT GCGACTGAAT 120
CGTTTGAAGG AATCGGTTCA GATGAATGAT TCATTTGTGA ATCGCTCACA TCAGCCACTG 180
CAGGCAGGCA GCCGAACCCG CCGCCTGTGA TGGAGGAGCG GATCTGATCC GATTTTACCG 240
GCTCCTCCGA CAAATATGCT GCTCGAACAA ACCCGGTTTC CACATAAAAT CACCGAAACC 300
ACCGACTAAT TGATATGTGA ACTGAATCAG GTAAAGCTGT TTATTCATAA TGTCTGTCCT 360
GTGTTTGTGT GTTTGCTCAG TTCAACTGTC ACATGGGTCG CGTCTCAAAA CCCAGTTTGC 420
TCCCTATATT GACAACATCT GTAGCCATTA TATATTAAAA TCCTAAGGTG CTTACAGCTT 480
AACCTGTATT TTAAAGCTGA GAACACGTGT AAACATGTTA CTTGTATACT GTAGTAGCAT 540
TCAGGCATCT TTGTTTTGAA CCCAAGTGCA CTGTCTAGTA AGTGAGCTCA GTAGGTTTTC 600
AAACACAACC AGAGTCCGCA TTGCGGCCTG CTCCGGTATA TACAGAGCTC TTTATTAACA 660
CCTGTGTTAA ATGTAAGGGT TTGTGTATTC GATGAAGTGA TAATAAGCGG TGACGGATGG 720
CTGACAGCTG TCATCTGTTT GTTTTGAAGC GATTGTGAGG CTGGAATTAG CTGTCAAACA 780
AACATGTCTC AGATTGATTC GCGCCAAAGC TTGGAAAACG TCAAAACATA CGGCGGGATT 840
TAATTTGTTA TTTTGTTTAT TTAATTTCAG TGGAGCTAAC TCTTATTTCT GCTCTTTTGT 900
TTTAATGTTT AGCAGTACAT TGATGGATTT AATCCCAGTC ACCGTTGGCA GTCAGTCTGT 960
GTTAGCATAG CTCTCGTACT GCTAATAGCC TTCATCCTCT TGTATAAAAC GAGTTTTATT 1020
TGCATATACA TTGTGTAAGG GTATACAATT AATATGTAAA TATGAATACC AATGTTTGTG 1080
TTAGGATTTA AAGCTTCACT GACTCTTATC CGTTCGGTTA GCATAGAAGC TAACAAACAC 1140
AGCGGCTACG GAAGTCGAAT TGAAAACATC ACCAGGACGT GGAATTTAGG AAGATTTTGC 1200
TTTTTATTAA TCATTTATTT TTGCTTTTTT TAGTACTTAT TTGCGTGATA ACGAGTGTGC 1260
TAAAACAAAT AACATTATGG GCACCGTATT AAAGTATGAG TACCTGAAAG TGACACGTAA 1320
ATACATGGTA TATTATTTAT TTTAAATAAG CTATATTTCT ATCTACCATC ACAATGGCAC 1380
AACATTTTAG CATAAGATTT TTTTTGTACC AAATGCACTG TTATTCAGCC GTAAACCATG 1440
GTATACTTCT GTGTTTTA 1458