EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-32338 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:55744447-55745705 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr6:55744881-55744902GTTAGGTTTCAGTTTCCTTTT+7.3
IRF2MA0051.1chr6:55744880-55744898GGTTAGGTTTCAGTTTCC-6.28
IRF3MA1418.1chr6:55744884-55744905AGGTTTCAGTTTCCTTTTTTC-8.03
IRF9MA0653.1chr6:55744885-55744900GGTTTCAGTTTCCTT-6.66
LMX1BMA0703.2chr6:55745054-55745065GTTTTAATTAA+6.14
PAX6MA0069.1chr6:55744706-55744720TTCACGGTTGATTT+6
POU3F3MA0788.1chr6:55744521-55744534AAATTAACATATT-6.41
ZNF384MA1125.1chr6:55745690-55745702AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:55745688-55745700ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr6:55745689-55745701TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
GATTCATTTT GCTACTGCAG CAATCAGCTT ATGTGCACGT GATCTGCTCA TGCATGCATA 60
TGAATCACGG AGGAAAATTA ACATATTAAC ACCAGTCAGA TAGCACTCAA ATGATGATTA 120
AAATAACCAA AACTATACAT TTCTGCTTCA TAACATCTTC TAGTTTGCAA ATAACTATTT 180
GTATCTTGAA ATAATTAAGC AGCGGGCAGA TAAGCACTGT AGGAGCAACT TTTTCCTCTG 240
TGCCGAAATT GAACTCAGAT TCACGGTTGA TTTACCCTCA AATACTGACA TGACAGTCAC 300
GATTTTCATG CAATAACCAA AGTAAAGTTC TCACCGGCTG CCACTCCGGG ACTTGATGAT 360
GGTTTTTTAA CTGTTGTGCA CTTTCTTTTG CTCAATTTTG GCGGAGATTC AGCTTTGGCG 420
GAGATTCTGT TCAGGTTAGG TTTCAGTTTC CTTTTTTCCT TACGTGAATG CCGAACTACT 480
GCATGTCCTT CCGCCTCTCC CTCCAACTGG CGGATGGATT TTTTTTTCTC CTTCTATATT 540
AGTTTGACTT GACATGCATA TTGTATCTAA TCGCATTATT ATAATCAAAA ATCTGATTGT 600
ACTTATTGTT TTAATTAAAT GTTTTATCAT ATATGAAATT GCAACTTATT TGTGCATGGT 660
GAATCCTGAA GTAACTGCTT TATATGTGTC TGTAATGTAT CATACCGTTG GCTAAGCATC 720
ATAACATATT GGTTTCTGAA ATGGACATCA AAAGTACAAA CTGAAGCTCA CCTAAACTTT 780
GGGTTAACAA TGCAAGAATT GAATTCTCTC AACATTAAGT TTAATGACTG AGGTAAATCA 840
AACACCTAAT ATCATACCAA AGCTACAGAA CTGGAAAAAG CAGTGGGAAT TACAAGTTGA 900
ATTGTTCTTT TCCTGACAAA CAATTCACAG GTTTTCTGAT GGTTAGAATT GAAGCAGTAA 960
CTTCGAACCC CTGGCCTGCT TAGCATATTT GTGTTTTCAT TTGCAGCCTT AATTAGCATG 1020
AAGTGAATTA GCAGCTTATT CATTTCAAAG GTTCTGGCAA CCCAGCAGTT CACAGAGACT 1080
ATACATGGCT TGTAAATCTA TGCCGGCTTT GTTCTTGAAC TGTATATGCT TCACGCAGAG 1140
CTGATCATTA ATAAAGAGCT TATATAATGA GCAATGCAAA AAGAGTTCAC GTACATTAAA 1200
AACACACTGT AACTTTAGGA ACTGAAAACT TCATCCACAG CATAAAAAAA AAAAATTA 1258