EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-32300 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:54222970-54224115 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK1MA0852.2chr6:54224040-54224054GCCTTGTTTACCTC-6.76
IRF1MA0050.2chr6:54223550-54223571TTTTGCTTTCTGTTTTATTTC+7.06
Lhx3MA0135.1chr6:54223381-54223394GGTTAATTAATTT-7.22
Enhancer Sequence
TGCTCTGCTT CCTGATCTTT GTGTCAGGAT CCAGCCCTTA CAGCCCTGTC ACTCCTGTCT 60
GTGTTTAATG TCTCTTTGTT TGTCTTGTGT ATTAGCACAT GGTTGTCTCT TTTGTTGTGT 120
TGGCCATGTG CTCCTCTTGT CCTGCCTCCT TGTTTTCCTA TGCCTCGCCC CCTTGTTTAG 180
TCCTTGTTTG TCTAATTATG TTCACCTGTT CCTTGTGCTA TCTACTCCCT TTATATTGAG 240
TTCATTTTCC ACTTGTCTTT GCCGGTTCGT CATACTATCT TTCGTGTGCT TGTCTAGCTT 300
ATTTTGTTAA GTGCATAATA GAGTTTTTTT ATAGTCTAGT TTTGTTTCCT TTGTCTAGTC 360
TAGTACAAGT GTTTTTGATC TTTATCTTGA ATTAATTTAT CCTTTTGATT TGGTTAATTA 420
ATTTATTTTT TCTTTCAATA AGTTTGCTGT CATTTTAACT TATTTCTGTT TGCAGCTCAA 480
GACCAATTTC AAGTTTTTAT TTTGCTATTT TTGTGATCTT TAGCCTCAGT CTAGCCCTAG 540
TCTTTAGTTA ATTCTTTATT TTTTAATTCC TGTTCCTGTG TTTTGCTTTC TGTTTTATTT 600
CTAGTTATAG CTTATTTCTT TAAGCCTTTT GTTTTTAGTT TCAGTAGTTT CGTGTAGTTC 660
CTAATTTGCT TCATTTTTTT TGTTTTTTGA GCACTTATTT CCCTCTTAAT AATTTCTCAT 720
ATTTACTACT TCTAGTTTGT TATTTTGCTT GCTCTTCTTT TTAATTTTCT TTGTTTCCCC 780
AGCCGTCTAG TCCTGTTGTG TTGCTTGTGT CACTTCCCTC CTGAGTCATC GCTGGTTGTG 840
GATCCCCTTC CCTTGATGAT CGATCTGTTT GCCACCCCTG TCCCTAACCA GAGGTTCGGC 900
TAGCTACCTT TTGACTGCTT GGCCTGAAAT TTGGAATTCC CCTTTCCTGA ACAGCCTGTG 960
TTACCCTCTT AAGACACTTC CCTCTGTATC ATCCTGAAGT CCTGAGTCTC CTCCCCTCAC 1020
CAGCCTGTTC TCCTGAAATC GTCCTGCACT ATTGATTGTC CTCCTGCATA GCCTTGTTTA 1080
CCTCCTGAAA ATAAACCTTG TGTTCTCTTG TCAATTCTGC ATTTGGGTCC TCCTTGCTAC 1140
CTGTG 1145