EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-32181 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:49548180-49549380 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr6:49549034-49549044GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr6:49549034-49549044GTCACGTGAC-6.02
Foxd3MA0041.1chr6:49548801-49548813AAATAAACATAC-6.11
MEF2CMA0497.1chr6:49549218-49549233AAGCCAAAAATAGCA+7.52
MITFMA0620.2chr6:49549030-49549048GTCGGTCACGTGACTAGT+6.35
MITFMA0620.2chr6:49549030-49549048GTCGGTCACGTGACTAGT-6.35
Nkx3-2MA0122.3chr6:49548668-49548681TAATCCACTTAAA+6.13
Rhox11MA0629.1chr6:49548834-49548851TTGATTTACAGCGGCGC-6.11
SPICMA0687.1chr6:49548928-49548942ACAAAGAGGAAGTC+6.12
USF1MA0093.2chr6:49549033-49549044GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr6:49549030-49549046GTCGGTCACGTGACTA+6.34
Enhancer Sequence
TAAGATAGTA TGCTAGCTTA TATGACACAG GCTTAACATG TATCACAATG TTAGTTTACT 60
CTATATCTCA CTTGTCAACT GAGGGTAACT TTAAATGACT ACATGACATT GCGTGCTAAA 120
CAGTAAGTTA CTAGGGCACG GTGTGTGTGA AACACTTTAT GTTGTAGTGT AAAAGTGCAT 180
ACAGGCTGTA CTTAAAGTAT GACACGTATT TTGTACGTTT TAAAGGTTAT AAGCTAATGT 240
TATCCAAGCG TGTTAACCGG AATCGACCCC GGTGGTCAGG CTGGCTAACA AACTGACAGT 300
CAAGCTCCAG TCAACTAAAC TACATTGGTA TGTACTATTT AATTCAAAGT ACAACATAAT 360
TTCCACCATA AATTATTTAA TACATCACAT ATTACCTTGT TGGCTAAACC TAGCTGTTTA 420
TTACAGTAAG GTTACTTTTT ATAATACCCC AGGATGTTAC CGTTAGCTCC CCAACTCGCA 480
ACTAGTGTTA ATCCACTTAA AATTTCCCCA GGCAGGGACC TTTGTTCTTA CAACATCAGA 540
AATGTAAAAA TGGTATAAAA AATTATTAAA GTCAACAGTG ATAACATAGC AGATTCTCTT 600
TAAACCGCCT CATAAAGCTT TAAATAAACA TACTAAAGCA CGTTACCTGC CATCTTGATT 660
TACAGCGGCG CTGTCACTCC ACTTCCTCAA AAGATTTCCT GCTCTTATTT CAATCCCGGC 720
ATCTATGTGA AGATCGAGTA CATATAAAAC AAAGAGGAAG TCAACGAAAC AAAGCACTTT 780
ATAGCGAGTA AATAGCGCAA ATTCCCGTAT CACTCAACCG AACGCTCGGT GAGGAAAAAA 840
ATAAGACAAT GTCGGTCACG TGACTAGTCT ACAGACGTCC GATTCGTGAA TGAGTTGTTC 900
ACATGAGTCG GATCTTTTCC GGGAATCAAT TGAACCGTCT CACAGAAAAG AACTGAATGG 960
TTCTTTCATG AATGGTTCTT CAAAAATGTA TTTATTGTAC TATTTCAGCT CAAACCGTGG 1020
TATTTGGTTA TACATAACAA GCCAAAAATA GCAACTGACA CTTTAAGAGA TAAAAAGCAA 1080
TCACAGCGGC TCTTTATACT GATACTCAGT GGTGTAAATT ACAAATACTC AAATTACTGT 1140
ATTCGAATAG TTTTTCTCAG GTATTGTAAT TTACCAGGTA GTTATTAAAA TGTGTACTTT 1200