EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-32069 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:46307222-46308542 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr6:46308255-46308265AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr6:46308255-46308265AGCAGCTGCT-6.02
CDX2MA0465.1chr6:46307483-46307494TTTTATTGCTT-6.32
Foxq1MA0040.1chr6:46307613-46307624TATTGTTTATA+6.32
HOXD9MA0913.2chr6:46307482-46307492GTTTTATTGC-6.02
IRF1MA0050.2chr6:46307692-46307713ACCATGTTTCAGTTTCATTTC+6.25
IRF3MA1418.1chr6:46307695-46307716ATGTTTCAGTTTCATTTCAGT-6.34
IRF9MA0653.1chr6:46307696-46307711TGTTTCAGTTTCATT-6.3
LMX1BMA0703.2chr6:46307796-46307807AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr6:46307795-46307806TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr6:46307795-46307806TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr6:46307795-46307806TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr6:46307795-46307806TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
ATAATCTTGC TCCTTAGTAC CTTATTGACT TGCTTTGTCC ATATACCCCC TCTCGATCAT 60
TGAGATCTTA TCATCTCAAT TTATTCACCA TGCCTAGAAC AAGCCTTAAA AAACGAGGTA 120
ATCGAGTATT TGCTGTTGCT GGTCCTAAAC TTAAGAACAG TCTAACAATT CACATCAGAC 180
TTTCCCTCTT CATTTCTGTG TTTAAGTCTG TTTTAAAGAC CTTTCTATTT TCTCTCGCTT 240
TTAAATACTC CCTGATCACT GTTTTATTGC TTTTATTTGT CCATGTTTCT TTTATATTCT 300
GCTTCTCTGT CTTTCACACT CCTATGTACA GCACTTTGGT CAACCTTGTT GTTATTAAAT 360
GTTCTTTATA AATAAATATT GTATTGTATT GTATTGTTTA TATTAGTAAT GAATTAACAT 420
TCATATAAAT TCAAACAATC TTAATTTAAC TTTATTTGTA TGTAAAATAA ACCATGTTTC 480
AGTTTCATTT CAGTGTTACA TTGTTGTTAT AGTACTTTAC TCAAGTCTCG TAGACAATAT 540
GAAGTGAAAC TAACACAAAG TATGCTTTAA CTTTAATTTA ATTAACTGTT TTTTAAAATT 600
ATGATCCTAC CGTAAATGTT CCCGCTGAGA CACGATCGGC CAATCACACG CCGCTTCCTC 660
CTTTACGTCA TCTGACAGGT AGAAGTACTA GGAAGTAAAC GACAACAGAA ATGGCGAGAA 720
AGTCGCTCAA ATTTAGCCAC TACTCTAAAA TGTTACTCAA TTTGATTCTA TATAGTGTTT 780
TTTGGGAGTT CGTATTTGCC TTTTCGACAC GTCGCGACTC AAGACAGTCT GGAAGTTCGG 840
AGAAACCCAC TTCAGCTGCT CCAAATGATC AACAGGTTTG TTATTGTACC CGTCACTTCC 900
CTGCCAGTTT GCACACTTTA AACCTCCCTG TCAGTTTGCA CACTACAAAC TATCCCTAAT 960
CTCTCATTTT GCAGGTTGTA AGGCTTCATT CAGGAGTTAT TGCGTCTGTT GTGGTCGTTG 1020
TTATAGGTGC AACAGCAGCT GCTTTCTTCA TCATACGCAA ATACTGCTTT CCACAGAGGT 1080
GCAGCACAGT ACATTTAACA CCATTTGCTT TATGTAACAG CGCAACTTAA TATGTCAATT 1140
CTGATACCAC GTTTTTGTAG GAACACTTTT TCAATATAGC ATATTTTGCA ATAATTTATG 1200
TTAAGTTAAA TAATACTTAT GCTCAAATCA GTACCAATCA GTAAGTTATT TAGTTGAACA 1260
AAATATGTAT TAAGGTAAAG TTGTTTTTTA TTAGCACATT CGTTCAGTGA AAACTTGTGA 1320