EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31727 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:29018028-29019762 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr6:29019719-29019736CGTTTTAATTAATTACT+6.36
Alx4MA0853.1chr6:29019719-29019736CGTTTTAATTAATTACT+6.55
ArxMA0874.1chr6:29019733-29019750ACTATTAATTAATTGAT-6.47
FOXC1MA0032.2chr6:29018816-29018827ATATTTACTTA-6.14
Hmx3MA0898.1chr6:29019736-29019753ATTAATTAATTGATTAC-6.12
LMX1BMA0703.2chr6:29019720-29019731GTTTTAATTAA+6.14
POU6F1MA0628.1chr6:29019736-29019746ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:29019736-29019746ATTAATTAAT-6.02
RUNX1MA0002.2chr6:29019008-29019019TTCTGTGGTTT+6.32
ZNF384MA1125.1chr6:29018396-29018408AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:29018397-29018409AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
TAATTGACTT GTTTCATTAG TTTGTTCATT AATAAAAATT ATCAAAGCAG GCTAAAACTT 60
ATTTTTGTAG CCTTGAAATA AAGCTGTCCA CACGACAGCG GGTCACGGTG TTCTCGAGTT 120
TCGTGGCTTC TTACTGAACA GAGCCGCCTT GTTCCGAGGA CGCTGGTGAT CTGTCGTGGA 180
CACAACAGGG ACACGCATTC AGCTCGTGCG CCAGACAATC AGTGGAAGCC CGTAGAGCCA 240
CGCAGTCCAT CAGTCTAGCC TCACCTGTCT TTGACTCGTG ACAGCCACTC AGCCAGTCTC 300
AAATTAATCG CTTCACTTCA CTCACATCGA GCGCATTAGC GTCTAGCTAT CATTGAGAAA 360
GAAAAAGCAA AAAAAAAAAA AGGCTATAAG TTTATGAGTT ACCGCTTCAA GTTTTCAATT 420
CTTTTTTTAC GGGTGTAGAT GTTTGATTTA TTTGTAGTTG TAGTTTGTAT AGCTTTATAA 480
AAATTAGCAC GATACAGAAT ATCTGATAAA CTGATGCATG CAATCGCAAA GTGCAGGATC 540
CATCAGTAGG CTACTGGCCA AAAGAGAAGC GCAGGAAATC AAAGCGCAAT GTGCCCCCTT 600
CGATTAGACA CCACATCAGG GCATCCGGCA GATACAGTAG GACAGAGATA ATGAAGGGCA 660
CTAGGAAAAA ATCTTTACTG ATTTTACAAC ATTATCTCAC ATTTACTTTG AGACTGATTA 720
CTAGACATAT GCAGTTACAG CATATTAACC CTTCCGCAAC GAGATAGACA TGTATAATGC 780
ATTGCAGAAT ATTTACTTAA AAGCTGAAAG CGAAATGAGT AGCCTAATTT CAATAACAAA 840
ATTAAAACGT CGTTTCCACA GAAGAATGTT GTGTATCATT ATAGACAGGG TAACTCTCAG 900
AACAATATAA GCAAATGTGA ATAAAAACAA CAATACCAAT TCCGACCGTC TTACTGCTTC 960
CTTTTTTCTG TAGCTGTGTT TTCTGTGGTT TTATTCCACT ACATGGGATT AGAATAATTA 1020
CATAGGCTTT GAAACAATTA ATTGGCTATA GGCTACCTTT TCCAAACATG TTATAGCCAT 1080
CCCAAGATAT TAATGCCGCA ATGTTCTTCT CAAATTTTCG TAAATATATA TAGTTGACAA 1140
ATTATTAAAT GGCATCAAAG AAAAAAACAA GAGTTGCAAA AAAAAAACAT TTACAAATTG 1200
CACTGGCACA ATGGAAAGAT AAATGATATA ATGAGGTTAT ATGTCTAAGT ACATGAAACG 1260
TCATGCTCAA CTGGAGACAA GCGAACTGTG ATTGTGCTTA GCGAAACTCA GATTTTAGAA 1320
TTACGGTTTA CACCAAATGA CTTTAAATTT AACGAGGGCT CATAAGCCGA CTGAAATTAC 1380
GGTACTCACC AGAAAACAAT ACGAGTTAAG ATGATTTTAG TGCAGTCGCG GTGTTTCGGT 1440
TGAATTCAAA GAGCGCAGAG CCCATAACAT CTCATTTCAT CTTGTGCTAG TCTGAGCGCG 1500
AGAATAGGCG CGCGCACACA TAAAAAAAAA CTTCCTGAAA ATGCTACTTG TCAATAGCAA 1560
TCTGATGTTA GAAGGGCTTT TCCTTAAGAA GCTTTTTATT ACAGTTTTGT AAAATTGCGT 1620
TAGTCAAAAT GTAAAAAATA AATAATGATG ATGATTGAAA TAATAAAATA ACTAGCTCAA 1680
AGATTAGTGC GCGTTTTAAT TAATTACTAT TAATTAATTG ATTACAGTTA CTAT 1734