EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31716 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:28252451-28253778 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr6:28252635-28252654CTGCGCCACCTGGTGGATC-6.15
Foxd3MA0041.1chr6:28252668-28252680AAACAAACAATC-6.92
GSX1MA0892.1chr6:28253186-28253196TTTAATTAGG-6.02
Enhancer Sequence
CACCAACAAA AAAGTTGTTT GGTCAGTTTA GAGATATATG GCTGCCTAAA AGCAAAATGG 60
GGTGAAGGAA GGAGGAGCTG ATGAAAAGCC AAAAAGAAAA AAAGGAGGAG AGCACAGAGA 120
GAAAGAATTC TGTGTTTTGG AATCTTTCTG TTATTTCCCT CAAGTACAGG ATGTTTTCTG 180
AGGTCTGCGC CACCTGGTGG ATCACAAAAA GAGTGAAAAA CAAACAATCC TCTGACATGT 240
CAGATGGTGT AAATTACGCA GTCCGGTTTG TGCTTGTGCA GTGTGTTCGC TATGCAGTTT 300
ACGACTGATC CAAGCATTTA GAGTGAGCTC AGATCAGGTT AAACCTGTGA AGCTTCCGTT 360
TCGAAGCAGT GACAGTAACT CATACTTTTT CCTCATTTCT CGTCGTCCTT CAGAGAACGC 420
AGATCGGATT GTAAGGCACC AAGCCAAAAT GTGAAATTAT GACACAATCC CATCCCTTTG 480
GCTCTCTCTC TACTCTAAAC CTATCTTGAA CTACTTTTCG AGGAAGCTTA TTTGTTGTTG 540
TCATTGTCTT AAAGTGTCAA GGGAGCTGGT TGATCATTAT CAGAGAAATG CAGTACTCGG 600
TGTTCTGTCT TCAGCAGTTG CATCCGCACT CAAAACTCCA CAAAACGCAC ATAACCACGA 660
TGCGCTTTTA AAAATATATT GTATATTTCC GAAGGCTTGT GTGCTATTAA GGTTATGCAC 720
TCTCACTCCT CCAGATTTAA TTAGGCGCTA ATCTCAAAGA GAAGATGTTT CAAATCCATT 780
CATTTGAACG CGTGCTATTT CCTTCTCTCC ACACCTTGCT TTAAATTGTG GCGCAAGACT 840
AATTTCTCAA ACGGCCTAAT CCCTTTATGA ATCGCTCTTG CGATATCATG CTCTCTTGTG 900
GAACTGGGAA TTGGAGAAAT CTGTTGGACT ACATTTTTAT GCCAAACAGA GCGCTTCTTA 960
TCATTGGAGA GACTTAAGTT GCTGCCACTG GGAATTAAAC CGCTAGATGG ATTTTTTCTC 1020
CGAGTTATTG GAGATCTCAA TTATGCGCTA TTTAACTATC AGCTTTGCCT GATGTTTCAC 1080
CTAAAATAAA AAGAAACAGA TTCTACAACT GTTGCTAACA GACTTTTTTT TTCATGGATA 1140
GGTATCGAAT TTTATCCATA AGAAATATAT AGGGGAGAGC GGGACACAAA GGAACTCTTT 1200
TTTGTTTTGA CCAAATAATG AACGAAGTAG CGGGATTAGA CAAACCCTTT TTTACCAACA 1260
ACACACAAGC CTCTTCTACA AGTGAGCACT GAAATTATGA TCGCCAGACC TATGGTTTCT 1320
GTGCGGT 1327