EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31540 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:21427684-21428797 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr6:21428502-21428512TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr6:21428502-21428512TTTAATTAGA-6.02
Lhx3MA0135.1chr6:21427846-21427859TAATAATTAATTA-6.18
RFX1MA0509.2chr6:21428560-21428576AGTTGCTATAGCAACG+6.46
RFX1MA0509.2chr6:21427737-21427753CGTTGCTATAGCAACT-6.46
RFX1MA0509.2chr6:21427737-21427753CGTTGCTATAGCAACT+6.47
RFX1MA0509.2chr6:21428560-21428576AGTTGCTATAGCAACG-6.47
RFX2MA0600.2chr6:21428560-21428576AGTTGCTATAGCAACG+6.91
RFX2MA0600.2chr6:21427737-21427753CGTTGCTATAGCAACT-6.91
RFX2MA0600.2chr6:21427737-21427753CGTTGCTATAGCAACT+6.95
RFX2MA0600.2chr6:21428560-21428576AGTTGCTATAGCAACG-6.95
RFX3MA0798.1chr6:21427737-21427753CGTTGCTATAGCAACT+6.4
RFX3MA0798.1chr6:21428560-21428576AGTTGCTATAGCAACG-6.4
RFX3MA0798.1chr6:21428560-21428576AGTTGCTATAGCAACG+6.77
RFX3MA0798.1chr6:21427737-21427753CGTTGCTATAGCAACT-6.77
RFX4MA0799.1chr6:21427737-21427753CGTTGCTATAGCAACT+6.31
RFX4MA0799.1chr6:21428560-21428576AGTTGCTATAGCAACG-6.31
RFX4MA0799.1chr6:21428560-21428576AGTTGCTATAGCAACG+6.51
RFX4MA0799.1chr6:21427737-21427753CGTTGCTATAGCAACT-6.51
RFX5MA0510.2chr6:21428560-21428576AGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX5MA0510.2chr6:21427737-21427753CGTTGCTATAGCAACT-7.22
RFX5MA0510.2chr6:21427737-21427753CGTTGCTATAGCAACT+7.28
RFX5MA0510.2chr6:21428560-21428576AGTTGCTATAGCAACG-7.28
Enhancer Sequence
TTGCGATGGG TTTGATTGTT TTTATATGCG GTCAGAAATC ATACAATAAC ACGCGTTGCT 60
ATAGCAACTA ATAATGGCGT GACCTTGCGT GCCTGAGATA TTTTTTTATT TTCATGAATA 120
CAATTCATGC AGTTATTCGA TTTCCTAAAT CTTAATTATT AATAATAATT AATTAAAAGC 180
TCTTGTTATA AAATTAAATA ACTATCATTT TAATTGGCCT ATCAGCTTTG AGTAAAACTT 240
GATAGCGTCA CCACCGACAT TAGCAGCAGA GAAATCTTTA ACGAAAATCA CACAGAAATT 300
CAAGAATAAA GTTTTTAATA AACATTACCA AACAAACGAG CTCTTCTATA AATGTAACTT 360
ACTATAATGA AGAAGTGGAC AAAGATGAAA TTGTTCTCCA TTCGGGAGAT CTACAGGAAT 420
CATAAACTGT TTTCAGAAAA ATTATTGTAT TATTTTCTGA GGAACACATT TCTAGGAGTT 480
TTTTTACGCT AAATTTTATG TTATTGCCGA ATCACGCTGA AGCAGGGCAT TAAGAAAGGT 540
CATGTGACTG ACGTCCCTGA CGTCACTACT TGCGTAGTGA ATGTATGGCC AACGCACAAT 600
TTAGGTATAT TAATGAATTA TATTTTTAAA TAAAATAAAT TGTATAATAA ACAACAATAA 660
TATTAAATTA AATAAGGCTT TTAGCATTTC ATTTCATTTA ATTTCGATAG CTTAATCAGT 720
GTATGTTGAT GACGCAGTAT TGATGAAAGC TGATTGGCCT ATTGAAAATT ATCCCGGAAA 780
TTAAATTTTT ATACATTTTT AATTTAATAA CAAGAGCTTT TAATTAGAAC TAATCGGATT 840
TATACCCCTT TTTGGCTATT TGTATTTTAC AATTTTAGTT GCTATAGCAA CGCGTGTTAT 900
GATATGAATT CTGACTGCAT ATAAAAAACA ATCAAACCTA TCGCAATCTG TTGGTTGAGA 960
GACGAGGCGA CTTTGCAGAG CATTTCTGTG CGATTCCTGA GATTTCTGAA GCTTTTGGAG 1020
GATTTCTGAG AGAAAAAGAC TTATTTTAAA GAGCACAATT TCTCTAATCA TCTTTTTTTC 1080
GTTATTTTTC TGATTATTTT TTTAATACAA TTT 1113