EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31506 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:20478444-20479484 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr6:20479396-20479406TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr6:20479396-20479406TTTAATTAGA-6.02
ATOH1(var.2)MA1467.1chr6:20479248-20479258GACAGCTGTT-6.02
MITFMA0620.2chr6:20478966-20478984AAAGGTCATGTGACCGAC+6.15
MITFMA0620.2chr6:20478966-20478984AAAGGTCATGTGACCGAC-6.15
RFX1MA0509.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG+6.46
RFX1MA0509.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG-6.47
RFX2MA0600.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG+6.91
RFX2MA0600.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG-6.95
RFX3MA0798.1chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG-6.4
RFX3MA0798.1chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG+6.77
RFX4MA0799.1chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG-6.31
RFX4MA0799.1chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG+6.51
RFX5MA0510.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX5MA0510.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG-7.28
Enhancer Sequence
TCATAGCCAG TGGAAGTGTG GAGTAAAATC GTTCACTTCA TAGGCACAAA CCTAATAGAT 60
AGAGTGCACC TAACTTTACA TTTATTTTTT CTCTTTTTCT TTTCTGTAAA ATGTGTAAAA 120
AGACAAAAGG GGAGATAAAA CAGACTTGTT CTTAAGCTCG CTATAAGATT AAATATTTTT 180
CAATAGGCCA ATCAGCTTTC AGCAAAACTT CATTGCGTCA TCACCCACAT TCATCTTTAC 240
AATATGTTTA TATTTATAAT CTTTACAGTT ATCGAAAATC GCACAGAAAT TCAAGAATAA 300
AGTTTTTAAT AAACAGTACT TAACAAACGA GCTCTTCTAT AACGTTAAAT GTAACTTACC 360
ATAATGAAGA AGTGGACGAG GATGATATTG TTCTCCATTC GGGAGATCTA CTGGCATTAT 420
AAACTGTTTT CAGAAAAATT ATTGTATTAC TTTCTGAGGA ACACATTTTG TTTACGCTAA 480
ATTTCATATT ATTGCCGAAT CACGCTGAAG CAGGGCATTA TGAAAGGTCA TGTGACCGAC 540
GTCCCTGACG TCACTCCTTG CGTAATAAAT GTATGGCCAA CGCACAATTA AGGTATGTTA 600
ATGAATTATA TTTTTAAATA AAATAAATTG TATGATAATA AAAACAACAA TAATATTAAA 660
TTAAATAAGG CTTTTAGTAT TTCATATGTG ATCATGGTAA TTTGGTGTCA ACTGATCGTG 720
TCTGTTATTA AATTGTAAAT TGAAATTAAA CTCCTGGAAT ATATTAATGC TTGTGTATAT 780
TGTTTTATTA TGCTGAGATG CGAAGACAGC TGTTCAAATG AGCCATTTTT ATTTGAGTTG 840
ATAGCTCGAT CAGTGTATGG TGATGACGCA GTATTGATGA AAGATGATTG GCCTTTTGAA 900
ATTTATCCCA GAAGTTCTTT TTTTATACAT TTTTAATTTA ATAACAAGAG CTTTTAATTA 960
GAACTAGTCG GATTTACACC CCTTTTTGTC TATTTGTCTT TTACAATGTT AGTTGCTATA 1020
GCAACGAGTG TTATGATATG 1040