EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31414 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:17139598-17140607 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr6:17140351-17140361TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr6:17140351-17140361TTTAATTAGA-6.02
Lhx3MA0135.1chr6:17139699-17139712TAATAATTAATTA-6.18
NFYBMA0502.1chr6:17140282-17140297CTGATTGGCCAATTG-6.69
RFX1MA0509.2chr6:17140409-17140425AGTTGCTATAGCAACG+6.46
RFX1MA0509.2chr6:17140409-17140425AGTTGCTATAGCAACG-6.47
RFX2MA0600.2chr6:17140409-17140425AGTTGCTATAGCAACG+6.91
RFX2MA0600.2chr6:17140409-17140425AGTTGCTATAGCAACG-6.95
RFX3MA0798.1chr6:17140409-17140425AGTTGCTATAGCAACG-6.4
RFX3MA0798.1chr6:17140409-17140425AGTTGCTATAGCAACG+6.77
RFX4MA0799.1chr6:17140409-17140425AGTTGCTATAGCAACG-6.31
RFX4MA0799.1chr6:17140409-17140425AGTTGCTATAGCAACG+6.51
RFX5MA0510.2chr6:17140409-17140425AGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX5MA0510.2chr6:17140409-17140425AGTTGCTATAGCAACG-7.28
Enhancer Sequence
TAGCAACTAA TAATGGCGTG ACCTTGCGTG CCTGAGATAT TTTTTTATTT TCATGAATAC 60
AATTCATGCA GTTATTCGAT TTCCTAAATC TTAATTATTA ATAATAATTA ATTAAAAGCT 120
CTTGTTATAA AATTAAATAA CTATCATTGT AATAGGCCTA TCAGCTTTCA GTAAAACTTG 180
ATAGCGTCAC CACCGACATT AGCAGCAGAG AAATCTTTAA CGAAAATCAC ACAGAAATTC 240
AAGAATAAAG TTTTTAATAA ACATTACCAA ACAAACGAGC TCTTCTATAA ATGTAACTTA 300
CCATAATGAA GAAGTGGACA AAGATGAAAT TGTTCTCCAT TCGGGAGATC TACAGGAATC 360
ATAAACTGTT TTCAGAAAAA TTATTGTATT ATTTTCTGAG GAACACATTT CTAGGAGTTT 420
ATTTACGCTA AATTTCATAT TATTGCCGAA TCACGCTGAA GCAGGGCATT ACGAAAGGTC 480
ATGTGACTGA CGTCCCTGAC GTCACTCCTT GCGTAGTAAA TGGCCAACGC ACAATTTAGG 540
TATATTAATG AATTATATTT TTAAATAAAA TAAATTGTAT AATAAACAAC AATAATATTA 600
AATTAAATAA GGCTTTTAGT ATTTGATTTC ATTTAATTTC GATAGCTCAA TCAGTGTATG 660
GTGATGACGC AGTATTGATG AAAGCTGATT GGCCAATTGA TAATTACCCC GGAAATTAAA 720
TTTTTATACA TTTTTAATTT AATAACAAGA GCTTTTAATT AGAACTAATT GGATTTATAC 780
CCCTTTTTGC CTATTTGTAT TTTACAATTT TAGTTGCTAT AGCAACGCGT GTTACGATAT 840
GAATTCTGAC TGCATATAAA AACAATCAAA CCTATCGCAA TCTGTTGGTT GAGAGACGAG 900
GCGACTTTGC AGAGCATTTC TGTGCGAATC CTGAGATTTC TGAAGCTGTT GGAGGATTTC 960
TCAGAGAAAA AGACTTATTT TAAAGAGCAC AATTTCTCTA ATCATCTTT 1009