EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31412 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:17052907-17054021 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr6:17053790-17053800TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr6:17053790-17053800TTTAATTAGA-6.02
Lhx3MA0135.1chr6:17053134-17053147TAATAATTAATTA-6.18
NFYBMA0502.1chr6:17053721-17053736CTGATTGGCCAATTG-6.69
RFX1MA0509.2chr6:17053848-17053864AGTTGCTATAGCAACG+6.46
RFX1MA0509.2chr6:17053025-17053041CGTTGCTATAGCAACT-6.46
RFX1MA0509.2chr6:17053025-17053041CGTTGCTATAGCAACT+6.47
RFX1MA0509.2chr6:17053848-17053864AGTTGCTATAGCAACG-6.47
RFX2MA0600.2chr6:17053848-17053864AGTTGCTATAGCAACG+6.91
RFX2MA0600.2chr6:17053025-17053041CGTTGCTATAGCAACT-6.91
RFX2MA0600.2chr6:17053025-17053041CGTTGCTATAGCAACT+6.95
RFX2MA0600.2chr6:17053848-17053864AGTTGCTATAGCAACG-6.95
RFX3MA0798.1chr6:17053025-17053041CGTTGCTATAGCAACT+6.4
RFX3MA0798.1chr6:17053848-17053864AGTTGCTATAGCAACG-6.4
RFX3MA0798.1chr6:17053848-17053864AGTTGCTATAGCAACG+6.77
RFX3MA0798.1chr6:17053025-17053041CGTTGCTATAGCAACT-6.77
RFX4MA0799.1chr6:17053025-17053041CGTTGCTATAGCAACT+6.31
RFX4MA0799.1chr6:17053848-17053864AGTTGCTATAGCAACG-6.31
RFX4MA0799.1chr6:17053848-17053864AGTTGCTATAGCAACG+6.51
RFX4MA0799.1chr6:17053025-17053041CGTTGCTATAGCAACT-6.51
RFX5MA0510.2chr6:17053848-17053864AGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX5MA0510.2chr6:17053025-17053041CGTTGCTATAGCAACT-7.22
RFX5MA0510.2chr6:17053025-17053041CGTTGCTATAGCAACT+7.28
RFX5MA0510.2chr6:17053848-17053864AGTTGCTATAGCAACG-7.28
Enhancer Sequence
TCTCAGAAAT CTCAGGAATC GCACAGAAAT GCTCTGCAAA GTCGCCTCGT CTCTCAACCA 60
ACAGATTGCG ATGGGTTTGA TTGTTTTTAT ATGCGGTCAG AAATCATACA ATAACACGCG 120
TTGCTATAGC AACTAATAAT GGCGTGACCT TGCGTGCCTG AGATATTTTT TTATTTTCAT 180
GAATACAATT CATGCAGTTA TTCGATTTCC TAAATCTTAA TTATTAATAA TAATTAATTA 240
AAAGCTCTTG TTATAAAAAT AAATAACTAT CATTGTAATA GGCCTATCAG CTTTGAGTAA 300
AACTTGATAG CGTCACCACC GACATTAGCA GCAGAGAAAT CTTTAACGAA AATCACACAG 360
AAATTCAAGA ATAAAGTTTT TAATAAACAT TACCAAACAA ACGAGCTCTT CTATAAATGT 420
AACTTACTAT AATGAAGAAG TGGACAAAGA TGAAATTGTT CTCCATTCGG GAGATCTACA 480
GGAATCATAA ACTGTTTTCA GAAAAGATAT TGTATTATTT TCTGAGGAAC ACATTTCTAG 540
GAGTTTATTT ACGCTAAATT TCATGCTATT GCCGAATCAC GCTGAAGCAG GGCATTAAGA 600
AAGGTCATGT GACTGACGTC CCTGACGTCA CTCCTTGCGT AGTAAATGTA TGGCCAACGC 660
ACAATTTAGG TATATTAATG AATTTTATTT TTAAATAAAA TAAATTGTAT AATAAACAAC 720
AATAATATTA AATTAAATAA GGCTTTTAGT ATTTCATTTC ATTTAATTTC GATAGCTTAA 780
TCAGTGTATG GTGATGACGC AGTATTGATG AAAGCTGATT GGCCAATTGA AAATTACCCC 840
GGAAATTAAA TTTTTTTACA TTTTTAATTT AATAACAAGA GCTTTTAATT AGAACTAATC 900
GGATTTATAC CCCTTTTTGG CTATTTGTAT TTTACAATTT TAGTTGCTAT AGCAACGCGA 960
GTTATGGTAT GAATTCTGAC TGCATATAAA AACAATCAAA CCCATCGCAA TCTGTTGGTT 1020
GAGAGACGAG GCGACTTTGC AGAGCATTTC TGTGCGATTC CTGAGATTTC TGAAGCTGTT 1080
GGAGGATTTC TGAGAGAAGA AGACTTATTT TAAA 1114