EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31403 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:16713921-16715071 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr6:16714850-16714869TCCTGCCATCTGGTGGTAG-6.53
EN2MA0642.1chr6:16714256-16714266GCTAATTGGG-6.02
IRF1MA0050.2chr6:16714587-16714608TTTTGGTTTCGTTTTTTCTCT+6.25
IRF3MA1418.1chr6:16714584-16714605TTGTTTTGGTTTCGTTTTTTC-6.83
IRF9MA0653.1chr6:16714585-16714600TGTTTTGGTTTCGTT-6.14
Enhancer Sequence
GTGCTTTTAC AGACCAGTCC TGTTGGCATT TCAGTTACTG CAGTGCAAAC TCAGGAGAAT 60
TATTGGTAAA ATAATAGAGT GGAGGAACTA TGACATCAAT TTGTATGCAA AAACCCGGAA 120
GCGAATTAGC ATTTTAGCAG TTCCAGTTCC CTCGTCCCAA AGTCAATGGT TTTTTTAATG 180
GGGTTTCAGT AAAATCGGTT AAATAAGGTT CGTGGCCAAC ACAAACTCAA AATACTTTCA 240
CATTTTGTTC TACGACATAG AACACATCAG TTACAGCACA CTCTTGAATT TTTAAATTGG 300
TTATGCTTCT TTAAAAAGAC GGTTGCTATC AAGTTGCTAA TTGGGACTAC AGGCGGTGTT 360
AAGAGTATGG AATTACTTAC CTGTTTGCGT TGTCTTTGTG TGTTTGGAGC ACGTGGGTTT 420
GTTTTGACAG CTGGCCACGT GCTTCTTGTC CGCGTGCTTT TTGTTTCCCC GCCTTAGAGA 480
CCTGGTAATC AATTTGCGAT CCTCTCCTTC ACCTGTTGCT GCTTGATTTC TCCCCTATTT 540
AGTCTCCTCT CGTCTCTTGT CTTTCGTCAG TCCGTTTTGC ATGCTCGTGA GGCTTGTACG 600
TTAATATCTA TTGTGAGTAA TCTGTCTTGT CGTGTCCTGT TTCCCCAGAC TCCATGCTCC 660
TACTTGTTTT GGTTTCGTTT TTTCTCTCCC TCCTTTATTT TGATATTTTG TCCTGTCATC 720
CGGATCGCTG TGGTTTGGTC TGGCTGTCCC ATTCTCGCTG CTGAATCTCC ACCAAGGGAG 780
AACGCCCAGC AGTACCCCGT AAGGCTCTTC TTCTCCGGTG CTGGCCGAGC GTTTGGTATT 840
GCTCAATCGC CCCCTGGGGG TAATATCCGG AACTCACCTG ATTCTTTTCA TCTCTCCTTC 900
TGCTGCCCAG TGAAGCCTTG GGAGCGCTCT CCTGCCATCT GGTGGTAGCG CCCGGAACTG 960
CGCCCATTTC TGAGTCCAGC TTTTTGAGTT TTGAACTGCC TTTTGAGGAT ATTTTGTGTT 1020
TTTTTTGAGA AGAATAAATT TGTTTTACCT GCTATTGAAT CTGTTCCCTT TCTACCCTGA 1080
CAGAACGGAC TGACCAAATT ATGGATTCAG CAGGTGCTGA GCATGTGAGA AACGCAGTGG 1140
CACAGCAGGG 1150