EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31320 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:12874949-12876071 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr6:12875074-12875095ACTTGCTTTCGTTTTCCCTTT+7.18
IRF2MA0051.1chr6:12875073-12875091AACTTGCTTTCGTTTTCC-6.45
IRF3MA1418.1chr6:12875077-12875098TGCTTTCGTTTTCCCTTTCTT-6.91
PHOX2AMA0713.1chr6:12875922-12875933TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr6:12875922-12875933TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr6:12875922-12875933TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr6:12875922-12875933TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
GACAGACTGT TTATTTCACT CAATCCTTAT ATAATTGTAT ATCTTTCAAA TGTTACCCAG 60
TTATTATATT ATAGTCTATT AGAAAGTATA TAAAATCTTT GTCTTCCGAA ACGTAGCCAA 120
GCCTAACTTG CTTTCGTTTT CCCTTTCTTT AAATCAATGT AAACAGGTAT GAAAGTATTT 180
GAACAACTTC AGACACGTTT ACACAATCTT TTACAAATCT TTTGACATCG ACCAATTTGG 240
ACATAATTAT AAAATAAATG CTAACGTTAT AGTATAGGCT ATACTTACGG AAAACGTCCT 300
GGTGAAATGA GTTTTCCTTA GATCATAATT AACTAGTGAC AGGCTTGGGT GACAGAGTGT 360
CAGGCTTGGG TGCTCTTAAC AAGCTCAAAA TTGACTAAAA TCGGTTATGA TAGTCGTAAA 420
CAGTCGTATA CAGTCTAACA ATCTGTCGTT TATCAAAACG ATTTTTAGTG AAGCTTTTAC 480
AGATACTAGT TCCGAGTGTA GACAGACGCC GGCTGGCTAG GGGTGGAGTA AAGTAAGTTT 540
TTACAGTAAA TCAGACCCTT TTCACATGAC GTCAAGCGGG AACCCACCCA GTCAGCTGTA 600
TATTTACTAC AGATACGGTT GTCTTCTGTT GTCTGCAATC AAGGTGAGAC GTCTAAAAAA 660
ATACAGATTA TCCAGATTTC CGCTTGAACC AATTAAGAAA GTGGGACTTT TTCTTGTATA 720
TTGCTTTGTG TTGCTGCATG AGGTTGATAT GTACTTGTCA GCATTTGTCA AATAAAGATT 780
TCAGATGTTT ACACGAGTGC TGAACATTTA GGTCAAATTT ATTTTTATTC TTTTTTGTGT 840
CCTGAAGAAT ACATAATGAA TAAAACGGTG GGTATTTTAC TGTGGGCTGT TTACAGTGGA 900
CAGCTGATTC TTAAACACAT TCATATTACT CACATTCTAC TGCTCAGTTC TCTGACATTT 960
TTTCGTATAT AGGTAATTTA ATTATGAACA GAAAACATTT ATGTCTATAT AAAACAAAAT 1020
CATTATAAAA ACTACAAGTG AAAATATAAC ACCAGGAAAA CTGCATTTGA ATTCAGAATT 1080
ATTAGATTCT GAATTTATTT GTAACATTAT TAAAATGTAG TA 1122