EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31289 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:11532554-11533110 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr6:11532849-11532860TTAATTAATAT-6.62
ETV2MA0762.1chr6:11533035-11533046CATTTCCGGTT-6.32
HNF1AMA0046.2chr6:11532787-11532802AGTTAAAGATTAACA+6.64
HNF1BMA0153.2chr6:11532788-11532801GTTAAAGATTAAC+6.18
Lhx3MA0135.1chr6:11532846-11532859TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr6:11532842-11532855TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr6:11532843-11532856AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr6:11532844-11532854ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:11532848-11532858ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:11532844-11532854ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr6:11532848-11532858ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TTTGCTTTTT AACAGCCATT AAGCTGGAAC TAATGGGCAT TTTTCCCCTA AACAATCTTA 60
CCTCCTTTAC CATTGAGGTT TAGGGTAAAG TAATTGGAGT CTTTCTCAGT AGGCAGGCCT 120
GGAGCTGTCA GGTAAGCAGA CAGCATGGAG ATGGTGGTAT TTTCAGGCAG TTTGAGGAGA 180
CTTTTAGGAA ACTGAACACT CGGTTGAAAT GAGAGATCTG CAATACATGT GAAAGTTAAA 240
GATTAACAAC ATTAAAAAAT TGTCAAAGAA TTTGAAGACT AATTGCAGTA ATTAATTAAT 300
TAATATGCAG TAAGTATGCG TACTCGAAAG TTCTCAGTTG GATGTTTTGA CTAGAACACC 360
TCTATATTCA GAATACTGAC TCAAAAACGC ACAAGAACCA CAACAACCAC TCAATTTAGA 420
ATAAAATCGG GCAGCTCAGT GGATTAAATA GGTGTAGCAG TGGTCATTTA TGGCTTATTA 480
GCATTTCCGG TTGCCCGCAT TAATCAATAT TGCACACAGT AGTATCAAAC CTCTATATGT 540
AAGCTTAAAG TCTACA 556