EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31145 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:6915773-6917061 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD11MA0908.1chr6:6916602-6916612GTCGTAAAAA+6.02
LMX1BMA0703.2chr6:6916769-6916780GTTTTAATTAA+6.14
ZNF24MA1124.1chr6:6916829-6916842CGTTCATTCATTC+6.98
Enhancer Sequence
TCTGGATCTT GAAGTTTTTT AGTGAATCTC AAAGAGCCTG ACTGATAAAC TCTTAAACTG 60
CAGAAGCGGT TTACAGTGAC CTGCAGAAGG AAACAGTAGT TTATGGTTAA CTAGAAATAT 120
GTGCGTTTGG CCTCACTTCA GAAATGCCAA TCTGAATGGA CAAAAAGGGG TTTTCAGATG 180
TAAGAATACA ATATTTATGA AGGCATTTTC CTAGAGCGCG TCTCCGGATT GGACGATAAG 240
AATAGCGTCT CGGCCAGCTG TAATAGATGC CTATTCACAT AGCGGTGTGG ATTTCAGCTT 300
TTTTCGTTGT GGTTGCAAAA GTGAACTGGA CTTCATAAAT CAGCCCGTGA ACTCTGTTAG 360
TTTTGCTTTC AAAGCGGAGA TCGACGGGTT TTTCAGGAGG AGAGCCTTCA CACTGACCGC 420
GGGCTACACA AACATTCACC GGCGGCGCGG GGCCCTGAAC ACTCGAGCCT GTATGAGGGA 480
AAATCAAAAA TAAGGTGGAG AAAAATATGT GTGTAATTAA GGCTTAAACG TATGTGAAGC 540
CGACGACTAT TTTTACACAC GTACGCTACG AAAACAAACA CAAAAAGTAG CAGAATAAAA 600
AGGAAAAACA GACCCGAGGT TGTCTCCAAC GGTCGCCCTC ATAAATCGCG GGAAGGTCAG 660
GTAAACGAGC GCGGAGAGGT GACAGGTAAA GACGGGGTGA AATCTACGAG TTCCCACATG 720
GCTTTATGGA CATTAACGTG CTGGCATTCA GAGGAAAGGA GCTGATATAA ATACCTGAAG 780
GTGAGGGGGA CATTGGAGTC AAATAAATTC CACTCGGGAC CACATCAACG TCGTAAAAAA 840
TATCTGAGAG TCAGAAAAGG GGGGTGTGTG CCGTTAATCA CAAGCGGTCG TGTTGAAGCA 900
TACGGGTAAA CATTAAAACA GTCACAGGTC ATGCTCAATC TACAAGGGCA GTTTAATGTT 960
TTCTTTTCCA ATCGCGCTTA AAACAGCAGC GGCACTGTTT TAATTAAACG TTTCAGGTTT 1020
CCTTTCCCGT CGTTTTATTG ACAGTCACCC CTTTTGCGTT CATTCATTCA CATAAATTGA 1080
GCAAGAGCCC CGTGGGAGAA AGTTCAAATA TGCGGTTATA AAATAACCTG ACGACTACCG 1140
TGTCTTTAAT TTGACGAAAC CTGCCCCCAT ATTCTCTGTT CTGCAGACTG AAAGAGCTGA 1200
AACCTTGAAT GAACTCAAGG ATTTTCACTA AAACAACAAT AACCGTGGTC CTCATACACC 1260
GGTGTCCGTT TTTCATCTAT GAGACAGT 1288