EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-31057 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:3119962-3121246 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr6:3120272-3120283TTTTATGGCTC-6.14
LMX1BMA0703.2chr6:3119981-3119992TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr6:3119987-3120000AAATTAACTAATC+6.03
Lhx3MA0135.1chr6:3119978-3119991TAATTAATTAAAT+6
NRF1MA0506.1chr6:3120600-3120611GCGCATGCGCG+6.02
NRF1MA0506.1chr6:3120599-3120610TGCGCATGCGC-6.32
PHOX2AMA0713.1chr6:3119982-3119993TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr6:3119982-3119993TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr6:3119982-3119993TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr6:3119982-3119993TAATTAAATTA-6.62
mix-aMA0621.1chr6:3119976-3119987ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
AAACAAATTA ACTTACTAAT TAATTAAATT AACTAATCCG TTTTGAAATA AGGCTATAAC 60
ATGAAAAAGT GAAGCACTAT CAATACTTTC CGAATGCACT GTATATAAGT ATAGCTTGCC 120
TATATGACTA AACAGATAAC TAAACAGACT AAACAGATAG AATATACCAA GTTATTTATA 180
TATCAAATAT TTCAAATATT ATCTACAGTT CTATGTGGGA TGTAGACCTT ATGACATTTT 240
AAGTGCATTA ATCCACTTTA TTTATTTTTT TTATCTATTT TATTTTTATA TTTCTCTTGG 300
GTCAAATATG TTTTATGGCT CATATCATAT GTGAGTGAAT TAAATTACAT AAAATTGCGT 360
CTCTTTTTAT CTATACATAA ATATATAAAA TACCCATAGC CTTATGCTAT AATTTAAAAC 420
GTTATGTGCA GTAACCGGAT TATCGTTTGT GTTATCATAC AGCAATACTA TCTATATTAT 480
CTACATATAT TCTCTGACCC ATATGGAGGG TATCGCTGGG TCATATGGAG GAAGTTATAT 540
ACAAATTGTC CGTATTATCT TTATGTCCTC ATGTGGAGTG TGTTGATTAG GGGGCGCGCG 600
CAGGGGAACG CCTTCTTCCA TCTTTGTAAA CAGTGAGTGC GCATGCGCGT CGCTGCACTC 660
TAATGGAGGA CATGTCTGAT CTGCAATCGC CTTTTTCTGC GCCGTTTTTC TGAGTTTGCG 720
ACCTCAACAT CACTTAACTG AGTCTGCGAC AGCCGTGAGT AAACTCCTCT CCTCCTCCAC 780
TGACATATAT GATCGGATTT GTATGCGTAC GTACAGATTT CGTGTGTGTT TCAGTGTGTG 840
AACGTCTGTG TTTACAGTAG TTAGCCAATA GGCTCATCAA AGTTTGGAGC GATCAATAAT 900
TCATGTAATA ACACAGTTAT ACACTCCATA AAAAGTGTAA TTACACTATG TGTATAGATA 960
CGAGCGTGTG TGTGTTGAGC TAAAAAGGCG TGTTTGCCTG ACAGGAGTAA GTTTGTGTTC 1020
ATTTTGAGCG GCTTTAGCCG TCGGTGTGTG TTTGTTGTTG TTTTTTAGCT GTCACTTTGA 1080
CAGATTTCGA TGTCAGAATT TTAAATGTTT CTATGCAAAA CCTTATGGTG AGATCATGAC 1140
AGATTCATAT ATACGATGGT TATTGGTTAA ACACTCCAAA TGAACAGATA TGATATGTTT 1200
ATTTGGCTAA CGTCAGCTAG CATGCTAATA TGAGTTTACA GGTGCTCCAA GATTCATAAT 1260
AATAACCGTT ATTAATTACT ACAG 1284