EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30996 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:422666-424162 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr6:422909-422919GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr6:422909-422919GTCACGTGAC-6.02
FOXD2MA0847.2chr6:422884-422897ATTAAATAAACAA+6.06
FOXE1MA1487.1chr6:422883-422898TATTAAATAAACAAC+7.1
Foxd3MA0041.1chr6:423821-423833GATTGTTTATTT+6.62
MITFMA0620.2chr6:422905-422923TGAAGTCACGTGACCGAT+6.79
MITFMA0620.2chr6:422905-422923TGAAGTCACGTGACCGAT-6.79
PHOX2AMA0713.1chr6:423019-423030TAATTGGATTA-6.02
POU1F1MA0784.1chr6:423723-423737CTCATTTGCATATA-7.08
POU2F2MA0507.1chr6:423723-423736CTCATTTGCATAT+7.52
POU3F1MA0786.1chr6:423724-423736TCATTTGCATAT-6.18
POU3F2MA0787.1chr6:423724-423736TCATTTGCATAT-6.37
POU5F1MA1115.1chr6:423725-423736CATTTGCATAT-6.32
Phox2bMA0681.1chr6:423019-423030TAATTGGATTA-6.02
Pou2f3MA0627.1chr6:423722-423738ACTCATTTGCATATAG-6.22
USF1MA0093.2chr6:422909-422920GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr6:422905-422921TGAAGTCACGTGACCG+6.07
Enhancer Sequence
AATATTAATT TAAAACACAA CAGCTATAAA ATACTCGCTC TAGACAGAAA CAAAGAGGCG 60
TCAATACTTT TTAAAAATCA AATAACTGTT GAGTCAACTC CATTTCTATA CCTTTCTTAT 120
GCTATTTAAA ACATTTAATA TTTCCGTTAT TGTAAAAGGT AATCTCTGTA CGGTTTAAAC 180
TATATTTTTG TCTGTTTTGT TTAGATTACT TCAATGCTAT TAAATAAACA ACAAACTAAT 240
GAAGTCACGT GACCGATCAC GAGATTTGAG AGCTCAGGCG GGATATTTGA ATTTGAAATC 300
AGCTGGAGCT CAAACGGCCG ATTGAAACTA ACGGATGTCG ATTAAATCTC GATTAATTGG 360
ATTAAAACTC ATCAAAATCG GACAGAAAGA AGATGCGATT GATCAGAGGA CAGCAGACTC 420
CGGTAAGACG CTTTACACTC TCAGGCCTCG AATCAGTAAA CAAAACAAGC TGAAAACACA 480
CACAGACAAA GCAAACACAA AGTCTGAGGT ACTATAATGA ACGCTGAATT ATTCCCATCC 540
AATATTTCTG CTATTCCTGC TTCTGTGTTT GCTGTTAGTT AAATGTTTTA TTTATCACTT 600
GTGACAGAAA TCATAATAAA GATCCTGAGC GACCAATGAA ATTATAATAG GCGGAGCTTT 660
ACTGCTAACA GTATGCTAAT CAGACGTGTC AGCAATGTGA AATTAATGTT TGACAGCTCT 720
ATTCTTAAAG AAATGCCAAT TACCAATAGC ACTATTCTGT GATGTTTACT ATGACAACTA 780
CATCAAACTT TGCAAGTTTT GAATTATGAA TTATTTACTT GATTGCCTTT ACTTAAAAGA 840
AGCATTTAGG TACTCATTTG CCTACACACG TTCATTCTTA TTCATGTGCC CGTTTAAAAG 900
TAAAGTATTA TACACAAACT GAATGCGATA TCTCACCGTG TGTTGAAATA GTGGAGTTTG 960
TGTTTAATAT GCTGCTGCAC AACATCTGCG TCAAATTCCG CTTGTTTTGA GTTTGAATAC 1020
TTGATTGGCT GTTGAATATT CAAAAAGTCA TTAACCACTC ATTTGCATAT AGACTAATAT 1080
ACACGCATGC GCTCTTATTC ATGTGCCCGT TTAAAATGAA AATATTCCAC ACAAAGTGAA 1140
GACAATATTT CATTTGATTG TTTATTTCAG TTTATTGATT AATATGTGTA ACTTTAGTCA 1200
GAGAAAGAAT TTAGAATTAG CGAAGATGCT TATTTGGCAT ATTTGTTTAA TAATATAACA 1260
ATCTTGTGAA CTTAAAAAGT TGGAAGCCTT GCAATTTTAT TTCTTTGTAT ATTTAATTGC 1320
AATAACAACA CAACAATTAC ATTTGAACGG ATAGAAATAA AGTACAAACC ACTCAGAGAT 1380
TACTTTTGTT GTTTGTTGAC AATGATGGAA ATATGAATTA CATTTAAAAT AATCTAACAA 1440
GGGTATATAA AGAAGGAAAG GAGAGGAAAA CGAATAGAAA ATTACCCAGA ATATTA 1496