EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30984 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr6:194708-195632 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr6:195035-195054TGCACACTAGAGGGCGGTA+6.07
RFX1MA0509.2chr6:195437-195453AGTTACTATGGTAACA+6.35
RFX1MA0509.2chr6:195437-195453AGTTACTATGGTAACA-6.35
RFX1MA0509.2chr6:195586-195602AGTTACCATGGTAACA+7.04
RFX1MA0509.2chr6:195586-195602AGTTACCATGGTAACA-7.05
RFX2MA0600.2chr6:195437-195453AGTTACTATGGTAACA-6.56
RFX2MA0600.2chr6:195437-195453AGTTACTATGGTAACA+6.58
RFX2MA0600.2chr6:195586-195602AGTTACCATGGTAACA+7.11
RFX2MA0600.2chr6:195586-195602AGTTACCATGGTAACA-7.12
RFX3MA0798.1chr6:195437-195453AGTTACTATGGTAACA-6.24
RFX3MA0798.1chr6:195437-195453AGTTACTATGGTAACA+6.44
RFX3MA0798.1chr6:195586-195602AGTTACCATGGTAACA-6.82
RFX3MA0798.1chr6:195586-195602AGTTACCATGGTAACA+7.11
RFX4MA0799.1chr6:195437-195453AGTTACTATGGTAACA-6.08
RFX4MA0799.1chr6:195437-195453AGTTACTATGGTAACA+6.43
RFX4MA0799.1chr6:195586-195602AGTTACCATGGTAACA+7
RFX4MA0799.1chr6:195586-195602AGTTACCATGGTAACA-7
RFX5MA0510.2chr6:195547-195563AGTTGCTTTGGTAACG-6.2
RFX5MA0510.2chr6:195547-195563AGTTGCTTTGGTAACG+6.38
RFX5MA0510.2chr6:195437-195453AGTTACTATGGTAACA+6.82
RFX5MA0510.2chr6:195437-195453AGTTACTATGGTAACA-6.86
RFX5MA0510.2chr6:195586-195602AGTTACCATGGTAACA+7.28
RFX5MA0510.2chr6:195586-195602AGTTACCATGGTAACA-7.3
Enhancer Sequence
ATACATAAAA AAACATGGTT AATGTGTGCT ATACCGTGAT CTAACTGCAG GAACACTAGT 60
TTAACCATGG TATTTGTAGT AAAAACAGTG AATTGTATTC AATGCACCCG AAAAAACACG 120
TGTCGCCTAC TACGGTTTTA CTATCTAAAA AGCATGGGTA ATTTGTGTTA TCCCATGGTT 180
TTATTACAGT GACACTAGTT TAACCATGGT ATTTGTACTG AAGCTTTGGT TATATAAATG 240
GTAGTGTGGT TATTACAGTT GTAATGTTTA TTTAGAACCA TCGTTCATTT GTGTAGGGTC 300
TCTTCAAGCC TTTATTAGTG ACATCAGTGC ACACTAGAGG GCGGTATGTG CTCATTACTT 360
CACCGTCAAC TGAACACCAA ACTCCACAGA GCACCAGCAA AACACACAGC AGGTGCTGGA 420
GGTCAGTCGC TCGTGTTTCT CCATCAGACT TTACTCACCG TTGTGTTGAG TGAGCAGTTG 480
TTTCTGGTGT TGTTAGTCTT GTTTCTGCCC ACATTCAGTC TGGACTGAGC GCTGTTTGTT 540
GTGGTGTGTG TGTGTGTGAT TTGGCCAGAG TGTGCTTTCA GCAGGCATTA CAGCATGATG 600
CTGTTGTTTT CAGTGGACAC CCGAACACAA ACACCTCTCA GCAGATTTAT ATCTCTCTCG 660
TGACAAATAT ACTGATTGTG TTTGTTTTTG GAACCATACT GTGTATATCA TCTGCTGTGG 720
TAATTCATCA GTTACTATGG TAACACGACA ACTGTAGTAG CCTAATTGAT CTGTTGTGGT 780
GATTCTACAG TTGCTATCGT AACATGACAA CTAAAGTAAT TGATTTGTTG TGATTGTGTA 840
GTTGCTTTGG TAACGTTGAT ACGTTGGGCT GATTCTATAG TTACCATGGT AACACGACAA 900
CTATAGTAAC TGATCTGTTG TGAT 924