EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30947 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:71279218-71280167 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr5:71279489-71279502AGATTAATTAATC+6.03
NFYAMA0060.3chr5:71279636-71279647AGCCAATCAGA+6.32
POU4F1MA0790.1chr5:71279614-71279628CATGAATTATTCAA-6.38
POU4F2MA0683.1chr5:71279612-71279628CTCATGAATTATTCAA-6.44
POU4F3MA0791.1chr5:71279612-71279628CTCATGAATTATTCAA-7.12
POU6F1MA0628.1chr5:71279491-71279501ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:71279491-71279501ATTAATTAAT-6.02
ZNF263MA0528.1chr5:71279736-71279757TCTTCATCCTCCTCTTCCTCC-8.09
Enhancer Sequence
TCCACAAGTG TTAAAATAGT CGTATTTTCA GTGTATTAAA ATCACATTCG GTACACTCGG 60
CAGTTCACAC ACAAAATAGA GATTTAGAAA AATACAAAAG CAAACTAACA GGAGTAAACC 120
GACACAAACG ACTGCTAAAT CCACACAGCG AGGAGCGGAT GGAGAAGAAC TGAACCCTGA 180
ATCTCCACAG CGCTGACATC AGCTGCACAT CACATACAGG AGAAACACCA GCGATTGGCC 240
AAACAACTGT GAGACCTCAT GAATATTCAG AAGATTAATT AATCCAATGA TTGCTCTTCT 300
TTTCTCGGGT GATGTTCAGA TCATCCATAT TACCAGAAAT GTTGAATAAA GACAATAAAG 360
TGAATTAACA GCAGTTAAAA CAGCTTTTCC CCAGCTCATG AATTATTCAA ACACTGAGAG 420
CCAATCAGAG TTCATTCTGC AGCGTTTGAA TATTTAAAGG GCCAGATGTG CACTTTTAAA 480
GAGACAGTTC ACACAATAAT GAATCTTCTG TCATCATTTC TTCATCCTCC TCTTCCTCCA 540
AACCTGTTTG AGTCTATTCT GTTGTGCACT AATGAAGATA TTAACCATCC ATCCACTGAC 600
TCCTATAGTA TGTTTTTTGT TTTGGTTTCT ACTATGGATG TCGATGACGT TTGCCAGCAT 660
TCTTCAGAAT ATCTTGATTT TGACCAGCAC TTGAGTGGGA GGCAATGATG AAGAAATGGT 720
CATTTTTGGG TGAACTGTCC CTTTAAGACC ATTAAACTAG CACTTTACAT GAGCTTTTCG 780
AGTAAATGAA ACGTTTTCAG TGTGAACACA AGTCAGAAAA CCAGATCCAG AGTGAATCCT 840
CATGTCATAA TGAGTCTATA GTGGATCAGT TATCATAATG ACCCTATAGT GATCACATAC 900
AGGAGGGGAA AGACAGCAGA GAATCATTAG CCGGGTTTCA ATGCTCACG 949