EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30763 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:64218415-64219734 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CUX1MA0754.1chr5:64219673-64219683TTATCGATTA-6.02
CUX2MA0755.1chr5:64219673-64219683TTATCGATTA-6.02
FOXK2MA1103.1chr5:64218951-64218962CGTGTTTACAT-6.02
TCF3MA0522.2chr5:64218509-64218519AACACCTGCT+6.02
Enhancer Sequence
TTGCCACTGA AATGTGGTAT ATAAATAAAC TTGCCTTGCT TTGCCTTGAT GAAAGATTTA 60
GAAATTCGTT TAGTAAACAG ACCTACTGTA AGGAAACACC TGCTTGGCAT AAATGCTTGA 120
AAATGATTTA ATAATTTTAA TATTTAATAG ACACTTAAAA GTAATCAAAA AGTAATCTGA 180
TGTATTCAGT TACTTTACTT TTACAAAGTA ATTGAAAAGG TACCTATTTC ATTTTAAATT 240
GTGTAATTTG TAACCTGTAA TCTATTAAAT TTCCAAAGTA ACCTCCCTAA CACTGCAGAC 300
AGACAGAAAG ATAGACAGAC AGACAAACAG ATAGATAGAT AGACAGACAG ACAGACAGAC 360
AGACAGACAA ACAGATAGAT AGATAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ATAATTATAT 420
TATTGAAACA TGCACTCCCA GTTTCTCTCA TAATTAAAAA ATGCAAACTA TTGATGACAC 480
TTTCTTAAAC TTAAAGATAA ACATTTTTGT CTTTTTTCTA AGCATAAAAT ACCCCACGTG 540
TTTACATGTT TTCAGTCATG TTTTATATGT TTTAGACAGC ATAATATAAT GTTTATTTAC 600
ACTCAAAAGT GTTAATAAAA CAATATTTAA TATAATAGCC CTGCATTTCA GTCATAACAA 660
TAAAAAATAC AAATTCAAAT GTTAAATACT TTACCTGTTA TAATCAGTTC TGCAGAAAAT 720
CTCTTTATTT CGGATGAAGC AGCTGTTCTG GTGACCCAAA GACACTGCGC ACACAGAGCA 780
CTGCAAACAC CTCAGATGCC AAGTTAATCC ATTCACCTGC GAGGAGAAAT TACCTTTAAT 840
ATATACACAC ATATATAAAC TCACAAAATT TTGATATTTC TTCTTCGTAT TTTATTCGTC 900
ATAATTTTGA GGTATAAATG AGCACCTTAA GCACATATCT GTCAAATATC TCTGTCGAGC 960
AGCCAGTGCA GATGAAGACA GGCAATATCG TTGAACACCC TGATGTCAAA ACAGGTCTTT 1020
TCTCCCTCAA ACTCCGATAA TAAAGGTTCG TCGACGAATT TAACATATTT GTAGAATAGC 1080
GTTAAAATAT TTTTAAGAAA TTATTTTATT TTATTTAACT ATTAGTCACA TAGTGAAAAC 1140
AATTCTCACC ATTTTTGAGC GCGACGCCAC TTGAAGCGGA TTTTTAAACT CTCACCAAAC 1200
CAACACTCAG ACGGTTTTGC TACACCTGTA TATAAAGCCA TCTCCATTTA TAACAGAATT 1260
ATCGATTAGG CTTTTAACCT CTAAGCCCTT CAGAATTATT ATCATCTGAC ATGTAATAA 1319