EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30626 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:57885765-57886667 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr5:57886176-57886191ACGACCTTTGAACCC-6.98
POU4F1MA0790.1chr5:57886355-57886369CATTAAATATGCAC-6.4
POU4F2MA0683.1chr5:57886353-57886369TTCATTAAATATGCAC-7.69
POU4F3MA0791.1chr5:57886353-57886369TTCATTAAATATGCAC-6.95
RFX1MA0509.2chr5:57886013-57886029GGTTGCCATGGAAACT+6.67
RFX1MA0509.2chr5:57886013-57886029GGTTGCCATGGAAACT-6.69
RFX2MA0600.2chr5:57886013-57886029GGTTGCCATGGAAACT-7.06
RFX2MA0600.2chr5:57886013-57886029GGTTGCCATGGAAACT+7.17
RFX3MA0798.1chr5:57886013-57886029GGTTGCCATGGAAACT+6.97
RFX3MA0798.1chr5:57886013-57886029GGTTGCCATGGAAACT-7.2
RFX4MA0799.1chr5:57886013-57886029GGTTGCCATGGAAACT+6.74
RFX4MA0799.1chr5:57886013-57886029GGTTGCCATGGAAACT-7.21
RFX5MA0510.2chr5:57886013-57886029GGTTGCCATGGAAACT+7.06
RFX5MA0510.2chr5:57886013-57886029GGTTGCCATGGAAACT-7.1
RXRBMA0855.1chr5:57886177-57886191CGACCTTTGAACCC-6.74
RXRGMA0856.1chr5:57886177-57886191CGACCTTTGAACCC-6.72
RxraMA0512.2chr5:57886177-57886191CGACCTTTGAACCC-6.67
Enhancer Sequence
TTAGTTTTAA ATAGTTTTTA TTCTTATTTT GGACTTTGTA TGTATAACAT GACAGCATTA 60
CAATTTATTC TGACTTTAAC ATTTTAAAGG GATGTGGTAT AATTAAAACA CAGGTAATGG 120
GTTCCAGCAT GTTTTATAGT CACATTATTG TTATTGGAGC GTGCATAAGC ATGTATGTGT 180
GTGTGTGAGA GAGAGAAACA CAGATGCACC TGGAGGTCTG TAAGTATTCA AATGTGAAGG 240
CCTCTAAAGG TTGCCATGGA AACTCATTTG CATGATCTGA TGATTTTCAT ACTGGAAGTT 300
TAGCTCAGGA GAGGCTTGAT TTCCATATTA TGGGGGGAGT GAGTGGCACT GCAACCACAG 360
GCTCATAGAG CTCCATTTGA AATTCAAATC AAGAGAGATT ACCTGCCATT GACGACCTTT 420
GAACCCCCAA CTAACCCTCC ACGCTCACTT CAGTGGAACG TTTGGCTGTT TGTTTTCATG 480
GTGTGGTCCA TTATAGATAC TATGGCAAGA CATTGAAGGT GAACAGGTTT TAAACACAAA 540
TAATAATTAC CACCATACTT CTGGTGTGTA CTAAACTAGA GGTATTGATT CATTAAATAT 600
GCACAGTTAA ATATTTGCAT TCATTTATAA CTCAAAAATC AGAACATCGG ATGAAGTCAA 660
TTTTGGTAAT TTTAGAATAA AAGGTTTTGC AGATGAATTT TGAGCCTTTT TTATGTAAAA 720
CACACATGCA CACACTAATA TGTACACTTT AGGTACTAAT ATGCAGACTT GGGGTACTAA 780
TATGCACACA TACTAATATT CACACTTTAG GTAATAATAT GCACACTTTA GGTACGAATA 840
TGTACACTTT AGGAACTAAT ATATACACTT AAGGTAGTAA TATTCAGACT TTAGGACCTA 900
AT 902