EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30561 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:55804245-55805116 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr5:55804926-55804947TTTTAGTTTCGGTTTACCTTT+6.19
IRF3MA1418.1chr5:55804929-55804950TAGTTTCGGTTTACCTTTAGT-6.39
PBX2MA1113.1chr5:55804555-55804567ATGATTGACAGA+6.22
Enhancer Sequence
GTATGGGTCA GTGACTGATT GTTTTATAGA CGATATACCT GCAGCTTATA TGAGAAGATT 60
TAACAAAGAA TTTTACTTGT GCTGGAGTCT GTGACATTTA CAATAATTTA AATTGATATA 120
GAAGCATCAA ATGAAAAATA AATTCATTAA GGAAATAACA AACTGAATTA ATAAGGTAAG 180
GCTGTGTTAC TTAACATTAC TTGACAAATA TTAATAAACA ACAGCTTACT TCTTAATAAA 240
TCGAGGATGC GTATTTTTCC AAACGGAAAG GCGGAAGTTA AGCGACGTCA TTGCTCCATT 300
AACTGCTGGG ATGATTGACA GACAGTGGAC CAAGCAAACA AAGCTAAAAT TAAGCAAAGC 360
TAAGCAAGGA GTGGCAAAAA AGGAGAAAAC GGGGGTGCAA AACTACCAAA GGTAAGAATC 420
GTTTTTGTGA CACCATTGAT GTAACGTAAT GTTAACTGTT TACCGCCTAG CCTAATCAAA 480
CGTTAGCATC AAACAAAGGT ACGTTAACCA ATTCATCCAG CTTACTAAAT TTCTAAATAT 540
TTGACTTACC TCCCTTGCAG TTAAAGAGAA AAATTACTTT GTGTTGTCTT TATACCACTA 600
TGACATCCAA ATTCGCTTTT AGAAAAGATA AATAGACCCA CTTACGTCAG TTCTCTTCCC 660
CCTATTGGCC ACGCAGTGCG TTTTTAGTTT CGGTTTACCT TTAGTATCAA TTGGAGACTT 720
CTCTGGAAAA TTTACGACTG AAAATATTAA CATTACACGT TGTGATTTAG GGCTATTACA 780
GTATTAAGTA TGTATTCAAA TGTTTCACTT TCAATACTGA ACTGCTTTCT GAGTTTGAAA 840
ATGATTCTTT AAGTTATTAG GAATAGGAAT A 871