EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30219 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:45144983-45145567 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:45145527-45145538AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr5:45145198-45145211AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:45145197-45145210AAATTAATTAATT+6.92
PHOX2AMA0713.1chr5:45145526-45145537TAATTTAATTA+6.62
POU6F1MA0628.1chr5:45145199-45145209ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:45145199-45145209ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr5:45145526-45145537TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:45145526-45145537TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:45145526-45145537TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
TTCATGTGTT GCTGTACTTT GCGCTTTTTA TTATGAACTT TTCATCTCTT GCATATCTCT 60
TGACAAATGG TTATGTCGCT GTTGGAGTCG AATGATAAAT ACGTCATCAT TAACCTGCAG 120
TGCAGACTGC ATTCTGCTCA CGGGGCTGAG AGAAATAGTA AAAAGAGTAG AGCAGCTACG 180
GTAAAATAAC TAAAAGAGTG AGATATTGTA AAATAAATTA ATTAATTAAA AAAGTGCAGC 240
TGCTGAGAGT GCACTGCAAG CAGCTAAAGA CACCGGCCCT CGCGGCCAAA AAAAAAATTG 300
ACCATGCCCA CCTGGAATTC TCCCAGTACT CCCGATAAGC TCCAGACAGC ACACATACGT 360
TGGGCCGACG TCGGCCGAAG GTCAACACGT CGGCCGCTTT AATTCTAACA TCTATATCAG 420
GGGAGGACAT GATAATGGTG AGATGTCAGA CAGTCTTTTG AAAGAATTCG GACTTATAGC 480
CCTCCAGTGA CCAAACCTCT TACCCAGATA TCAATTGAAT TGATCCACTT GAATGATGGA 540
AGCTAATTTA ATTAATACGA GTGTTATTTT AAACACTGCA TATT 584