EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30144 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:42618051-42620150 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr5:42618455-42618472CAAAAATAAACAAAACT+6.32
Foxj3MA0851.1chr5:42619678-42619695CAAAAATAAACAAAACT+6.32
HNF4A(var.2)MA1494.1chr5:42618857-42618872TTGCCCTTTGGACTG-6.19
HNF4A(var.2)MA1494.1chr5:42620080-42620095TTGCCCTTTGGACTG-6.19
Enhancer Sequence
CTCCGCCTGT CACGCGGAAG ACCGGGGTTC GATTCCCTGA CGGGGAGGCA TTTTCTTCAA 60
GACGCTGAAC TCCTTACCCC ACCTCAGGCT TAAGCATAAA GCTGTCCAAA GAAACAAACC 120
CACCATTCAA TATTGGCCAT GTCCTTCTTG TGGTAAAAAA GAGCTCGATT TTGCTCACTC 180
GCTTTTTTGC TGCGGTTCCA AAGATTGCAA TTGTGAAGAG AGGGAGAAAA AGACACACAG 240
ATCCAAGATT GCTGCGCTTT AGAGAATGAG CTAAGAGCAA CTTCATTTGA TCGCCGGATT 300
GATAACAACC ATTCTGTCTA GGCTAATCTA CTGACACAAA CACTCTTCCA CATCTCGTTC 360
TGCAATTCAA CATCTTAATG CAGCTCTGCA GATAGCAGAG CACCCAAAAA TAAACAAAAC 420
TCACAATAGT TCCTCCCCAC GGAAATCTTT AGTAAAAGGC GAAAGATTTG TGCGTGATTG 480
AAGAGAAACT CGAGCTGTAA CACTATGCTG CTTAATCAGA GCAGTAGGCC TGACACAGCA 540
CAATGTTCGG CAAGGGTGAC TGCAAGGCAC GTTGGCCTCG TAATCATACT TTGTTGAAAG 600
GAAGGCATCG AAGCATTACG CAGTACAGAA TGAGGTCACA CAGAAAGAGG TGCAGTCTTT 660
GGATAAGACA AATATATCCA CATTTTCAAA GCTGCAGTGA TGTCACCATG TAATATTGTG 720
TTATTAGGAC ATAAGACAGA TTAGAGCCCA GTCCTTGGTA ACAGCCAAAG GTTTTGAGGG 780
TGACTATAAC CAGCAGAAGC TACAGTTTGC CCTTTGGACT GAACCCATCG GTCGTTGTTT 840
TTATTACATG TCTGACTCTG CCTGTCTTAA GGAGGAATGG CTTGGCTTCG GTTTGGTGAG 900
ACTGCTAGCA GAAAGTGTCC ACCCACGCTT GACATAACCA AAAGCACGCT AGTCTTTATT 960
AGTATAGTGG ACAGTATTTC CATGTGTCAC CCGGATGATC AGGGTTCGCT TCCCTGCCAG 1020
GGGGGGCTTT TTTTAGGATG CTAAACTCCT CTTAAAAACT TGAGCTTCAG CATGAATCTG 1080
TCCAAAAAAA AAACAAGCCC ACAGTGCGAC GTTCGTCGGA AGAAACTTGC AGCCTTTTGC 1140
TCTCAGGCAC CCTCAACATA ATAGTGCAGC TGAACAGTTT ACATTCTTGC ATAAGTGATC 1200
CTCGTTAGTA TAGTGGACAG TATCTCCGCC TGTCACGCGG AAGACTGGGG TTCGATTCCC 1260
CGACGGAGAG GCATTTTCTT CAAGACGCTG AACTCCTTAC CCCACCTCAG GCTTAAGCAT 1320
AAAGCTGTCC AAAGAAACAA ACCCACCATA CAATATTGGC CATGTCCTTC TTGTGGTAAA 1380
TAAGAGCTGG ATTTTGCTCA CTCGCTTTTT TGCTGCGGTT CCAAAGACTG CAATTGTGAA 1440
GAGAGGGAGA AAAAGACACA CAGATCCAAG ATTGCTGCGC TTTAGAGAAT GAGCTAAGAG 1500
CAACTTCATT TGATCGCCGG ATTGATAACA ACCATTCTGT CTAGGCTAAT CTACTGACAC 1560
AAACACTCTT CCACATCTCG TTCTGCAATT CAACATCTTA ATGCAGCTCT GCAGATAGCA 1620
GAGCACCCAA AAATAAACAA AACTCACAAT AGTTCCTCCC CACGGAAATC TTTAGTAAAA 1680
GGCGAAAGAT TTGTGCGTGA TTGAAGAGAA ACTCGAGCTG TAACACTATG CTGCTTAATC 1740
AGAGCAGTAG GCCTGACACA GCACAATGTT CGGCAAGGGT GACTGCAAGG CACGTTGGCC 1800
TCGTAATCAT ACTTTGTTGA AAGGAAGGCA TCGAAGCATT ACGCAGTACA GAATGAGGTC 1860
ACACAGAAAG AGGTGCAGTC TTTGGTTAAG ACAAATATAT CCACATTTTC AAAGCTGCAG 1920
TGATGTCACC ATGTAAAATT GTGTTATTAG GACATCAGAC AGATTAGAGC CCAGTCCTTG 1980
GTAACAGCCA AAGGTTTTGA GGGTGACTAT AACCAGCAGA AGCTACAGTT TGCCCTTTGG 2040
ACTGAACCCA TCGGTCGTTG TTTTTATTAC ATGTCTGACT CTGCCTGTCT TAAGGAGGA 2099