EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30139 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:42590075-42592139 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr5:42590333-42590350CAAAAATAAACAAAACT+6.32
Foxj3MA0851.1chr5:42591556-42591573CAAAAATAAACAAAACT+6.32
HNF4A(var.2)MA1494.1chr5:42590735-42590750TTGCCCTTTGGACTG-6.19
HNF4A(var.2)MA1494.1chr5:42591958-42591973TTGCCCTTTGGACTG-6.19
Enhancer Sequence
CTTGTGGTAA AAAAGAGCTA GATTTTGCTC ACTCGCTTTT TTGCTGCGGT TCCAAAGATT 60
GCAATTGTGA AGAGAGGGAG AAAAAGACAC ACAGATCCAA GATTGCTGCG CTTTAGAGAA 120
TGAGCTAAGA GCAACTTCAT TTGATCGCCG GATTGATAAC AACCATTCTG TCTAGGCTAA 180
TCTACTGACA CAAACACTCT TCCACATCTC GTTCTGCAAT TCAACATCTT AATGCAGCTC 240
TGCAGATAGC AGAGCACCCA AAAATAAACA AAACTCACAA TAGTTCCTCC CCACGGAAAT 300
CTTTAGTAAA AGGCGAAAGA TTTGTGCGTG ATTGAAGAGA AACTCGAGCT GTAACACTAT 360
GCTGCTTAAT CAGAGCAGTT GGCCATACAC AGCACAATGT TCGGCAAGGG TGACTGCAAG 420
GCACGTTGGC CTCGTAATCC TACTTTGTTG AAATGAAGGC ATCGAAGCAT TACGCAGTAC 480
AGAATGAGGT CACACAGAAA GAGGTGCAGT CTTTGGTTAA GACAAATATA TCCACATTTT 540
CAAAGCTGCA GTGATGTCAC CATGTAAAAT TGTGTTATTA GGACATCAGA CAGATTAGAG 600
CCCAGTCCTT GGTAACAGCC AAAGGTTTTG AGGGTGACTA TAACCAGCAG AAGCTACAGT 660
TTGCCCTTTG GACTGAACCC ATCGGTCGTT GTTTTTATTA CATGTCTGAC TCTGCCTGTC 720
TTAAGGAGGA ATGGCTTGGC TTCGGTTTGG TGAGACTGCT GGCAGAAAGT GTCCACCCAC 780
GCTTGACATA ACCAAAAGCA CGCTAGTCTT TGTTAGTATA GTGGACAGTA TTTCCATGTG 840
TCACCCGGAT GATCAGGGTT CGCTTCCCTG CCAGGGGGGG CTTTTTTTAG GATGCTAAAC 900
TCCTCTTAAA AACTTGAGCT TCAGCATGAA TCTGTCCAAA AAAAAAACAA GCCCACAGTG 960
CGACGTTCGT CGGAAGAAAC TTGCAGCCTT TTGCTCTCAG GCACCCTCAA CATAATAGTG 1020
CAGCTGAACA GTTTACATTC TTGCATAAGT GATCCTCGTT AGTATAGTGG ACAGTATCTC 1080
CGCCTGTCAC GCGGAAGACC GGGGTTCGAT TCCCCGACGG GGAGGCATTT TCTTCAAGAC 1140
GCTGAACTCC TTACCCCACC TCAGGCTTAA GCATAAAGCT GTCCAAAGAA ACAAACCCAC 1200
CATACAATAT TGGCCATGTC CTTCTTGTGG TAAATAAGAG CTCGATTTTG CTCACTCGCT 1260
TTTTTGCTGC GGTTCCAAAG ACTGCAATTG TGAAGAGAGG GAGAAAAAGA CACACAGATC 1320
CAAGATTGCT GCGCTTTAGA GAATGAGCTA AGAGCAACTT CATTTGATCG CCGGATTGAT 1380
AACAACCATT CTGTCTAGGC TAATCTACTG ACACAAACAC TCTTCCACAT CTCGTTCTGC 1440
AATTCAACAT CTTAATGCAG CTCTGCAGAT AGCAGAGCAC CCAAAAATAA ACAAAACTCA 1500
CAATAGTTCC TCCCCACGGA AATCTTTAGT AAAAGGCGAA AGATTTGTGC GTGATTGAAG 1560
AGAAACTCGA GCTGTAACAC TATGCTGCTT AATCAGAGCA GTTGGCCATA CACAGCACAA 1620
TGTTCGGCAA GGGTGACTGC AAGGCACGTT GGCCTCGTAA TCCTACTTTG TTGAAATGAA 1680
GGCATCGAAG CATTACGCAG TACAGAATGA GCTCACACAG AAAGAGGTGC AGTCTTTGGT 1740
TAAGACAAAT ATATCCACAT TTTCAAAGCT GCAGTGATGT CACCATGTAA AATTGTGTTA 1800
TTAGGACATC AGACAGATTA GAGCCCAGTC CTTGGTAACA GCCAAAGGTT TTGAGGGTGA 1860
CTATAACCAG CAGAAGCTAC AGTTTGCCCT TTGGACTGAA CCCATCGGTC GTTGTTTTTA 1920
TTACATGTCT GACTCTGCCT GTCTTAAGGA GGAATGGCTT GGCTTCGGTT TGGTGAGACT 1980
GCTGGCAGAA AGTGTCCACC CACGCTTGAC ATAACCAAAA GCACGCTAGT CTTTGTTAGT 2040
ATAGTGGACA GTATTTCCAT GTGT 2064