EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30127 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:42503493-42504867 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NEUROD1MA1109.1chr5:42503855-42503868ATGCCATCTGTTA-6.02
SPI1MA0080.4chr5:42503512-42503526AAAAAGGGGAAGTC+6.73
SPICMA0687.1chr5:42503512-42503526AAAAAGGGGAAGTC+6.81
Enhancer Sequence
TAAAGCTCTT AAAAGTTTTA AAAAGGGGAA GTCTCCAGGA ATGGACGGTC TTCCCCTGGA 60
GTTTTATCAA TGTTTCTGGG ACATTTTAGC TGGGGTTTTA CTGACTGTTT TTAATGAATT 120
CGAAAATTTT AACAAACTAC CTGCGGATTT TAGATTAGGA ATAGTTTCTC TGCTTTTTAA 180
AAAAGATGAC AAGAAAATTT TAAAAAATTG GCGACCAATC ACTCTTTTAA ACACAGATTA 240
TAAACTTTTT ACAAAGATTT TAGCGACACG GATGTCGACA GTTTTAGAGG ATGTAATCCA 300
CCCGGATCAA GCCTGTGCTG TGCCCGGGAG GAAGATCACG GACAGCCTAT TGCTGATCCG 360
AGATGCCATC TGTTACGCGA GAGACAGAAA CATTCGTCTA GCCGTGGTAA ATTTAGATTT 420
TGAAAAAGCA TTTGACAGAG TCTCGCACCA GTACTTGTTA CAAGTACTGG AAAAAATGGG 480
GTTCCCGGGA AGATTTTTAG CATGGGTGGG ACTGCTGTAC AACGACCTTG TCAGCAAAAT 540
CATTGTAAAT GGGCATTTAA CAAAAGCAGT AAATATCTGC AGTGGCGTCC GTCAAGGGTG 600
TCCGTTATCC CCACTCCTGT ATGTGGTTTG TATTGAACCA CTGGCACAGC TCTTGAGAAG 660
GGATAAATGG ATTACAGGTT TTAAAATCCC GGGGGGTTTA ACAGCATCTT GTGTTTTATA 720
TATGGACGAC GTTACCCTTT TAACGACAGA CCTCACCTCG GCCCGAAGAG CTATGGATTT 780
GACCGATTTC TACGGTCGGG CCTCGGGAGC CAGATTAAAC CGAAAAAAGT CCGAGGCCCA 840
GCTCTTCGGG CCGTGGGGTA ACGTCGTCAC AGAGGGACTA GAGCTGACTT TTAAGGAAAA 900
TGATTTTAAA ATTTTAGGGG TAAAATTTGA CAAAGAGGGT GGGGGAGGGC AAAATTGGAA 960
CGACATTTTA ACAAAGGTAA ACCAAAAGTT GGGATTCTGG GGGTTACGAA AACTAACAAT 1020
GGAGGGTAAA ATTTTGATTT TTAAATCCGT AATTTTACCA CTCATTTTAC TTGTTTCTTC 1080
TGTTTTTAGT CCACCAAGAC GTTTTATCAG GAAGTTGGAA AGGGCGGTGT TTTATTTCCT 1140
GTGGGGATCC AAGTGGGAGC GCCTAAGAAG AACAGAGTTA AAGAAAAAGC CCGAACATGG 1200
TGGAAAAGGC CTCCCGGATC CCCACCTGTT TTTAGGCAGC CGCTTCACCG CCCTGCATTT 1260
TAGTTACGCG TTGACCCCAT CCAGAGAAAA CAAGACGGCT GCCATGACTC GCTTCTGGAT 1320
GGGGTCCTAC CTGAGAACCC TGAAAGTTTT AGCAGTGGAC CTTAAGTACC CAGT 1374