EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30105 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:42119718-42120786 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PBX1MA0070.1chr5:42119831-42119843ACATCAATCAAT+6.44
RFX1MA0509.2chr5:42120738-42120754AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr5:42120738-42120754AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr5:42120738-42120754AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr5:42120738-42120754AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr5:42120738-42120754AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr5:42120738-42120754AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr5:42120738-42120754AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr5:42120738-42120754AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr5:42120738-42120754AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr5:42120738-42120754AGTTGCTATGGTAACA+7.14
ZNF24MA1124.1chr5:42120722-42120735AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr5:42120726-42120739GAATGAATGAATA-7.52
Enhancer Sequence
AATTTGCCAT CCAGTTTTCT AAGGTGGCAT AACATGAAAA AACATGGCCA TCAGCCAATT 60
AATACAGAGC AATTTTTCAT TCGTCTTTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTAT AATACATCAA 120
TCAATGTATT GGGTATTCAA TCTTAACCCT TTTAACCAAA ACATTGTTGT GTAAAGTGTT 180
TGACAGTGTG GTACATCCTT ATTTTGTGGA AGACAGACAC AACTAATAAT AAGACCAAAA 240
AAAGTTATTA AAAATGCCAA CAAATGTTGA CTTAATTTAG TTTACACTAG AGTTCACTGA 300
TGAAATATTT TTGAAAGCAA CCTCAGTGTT ACAGCACATG AATCTATAAC CTTCCTGATA 360
CTAAAGCTTT GCAGACAGGT TTCTTGAAAT GTCTTGGGAA GATGTTCTTC AGTTCTTCTG 420
AATTATCTGA TCTCTGCGTG GAGCATCGGC TGCTGTCAAA CAAAAATTAC ACTGCATTAT 480
TACAATTAAT AGCAAAAATG ACACACTACA CCAAAAGATT ACTTAATAAC TGACTCAAAA 540
TCATTTTAGC TGGTGAAAAT AATGTTCTAA TATTTTGTTC TTACATGAAA CAATACTAGA 600
ATAATTTATA GCAAATCTTG TCATATTTTT TGAGCCATAC TATAGTAAAG TAATTGAAAA 660
AATCTGTTCT ATATTTGCTA AGGTGGTGGC GCGGTGGCGC AGTAGGTAGT GCTGTCGCCC 720
TTACAGCAAG AAGGTTGCTG GTTCGAGCTT TGGCTGGGAG TTTGCATGTT CTACCTGTGC 780
TTGCGTCGGT TTCCTCTGAG TGCTCCAGTT TCCCCCACAA GTCCAAAGAC ATGCGGTACA 840
GGTTAATTGG GAAAATTAAA ACTGTCCGTA GAGTGTGTAT GGGTGTTTAC CAGTGTTAAG 900
TTGCGGCTGG AAGGGCATCC GCTGAGAAAA ACATTTGCTG GGTAAGTTGG CGGTTCATTC 960
TGCTGTGGCG ACCCCAGATT AATAAAGGGA CTAAGCCGAA AAGAAAATGA ATGAATGAAT 1020
AGTTGCTATG GTAACACAAC ATTTCTACAA CTACAGGGTA TTTTATAC 1068