EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30093 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:42067601-42069090 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:42068627-42068638TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:42068628-42068639TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr5:42068448-42068462ATAAATAATTAATA+6.29
POU4F3MA0791.1chr5:42068448-42068464ATAAATAATTAATAAT+6.2
PROP1MA0715.1chr5:42068628-42068639TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr5:42068628-42068639TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr5:42068628-42068639TAATTAAATTA-6.62
RFX1MA0509.2chr5:42068368-42068384CGTTGCTATAGCAACC+6.82
RFX1MA0509.2chr5:42068368-42068384CGTTGCTATAGCAACC-6.82
RFX2MA0600.2chr5:42068368-42068384CGTTGCTATAGCAACC+7.37
RFX2MA0600.2chr5:42068368-42068384CGTTGCTATAGCAACC-7.4
RFX3MA0798.1chr5:42068368-42068384CGTTGCTATAGCAACC+7.17
RFX3MA0798.1chr5:42068368-42068384CGTTGCTATAGCAACC-7.22
RFX4MA0799.1chr5:42068368-42068384CGTTGCTATAGCAACC+6.65
RFX4MA0799.1chr5:42068368-42068384CGTTGCTATAGCAACC-6.67
RFX5MA0510.2chr5:42068368-42068384CGTTGCTATAGCAACC-7.59
RFX5MA0510.2chr5:42068368-42068384CGTTGCTATAGCAACC+7.71
Enhancer Sequence
TGCCGCTCTG CCGCTTCCTC TTCCTGTTAC CCTGATCTGT GGACACAGAT TTGGCCAACA 60
GGGAAGGCAG AGGTGCGAGA AATCCATCAA GCTCTTGGCT CACGGTCTGG GTTCCACCAT 120
CACCATCATG TGTCCTGACG TCCTGAACAG CTGCCTGGAT GAAAGCAGAA CTCCTGGATC 180
TGGAGCGGCC TGAGACAACG ACAACAACAA CAACAACATA TCACGTTTAT TATAAGATTA 240
TAAGAATTAA TCAACAATTA ACTTTAGTAG CTGCATCTAC AGAGAATAAA AGACATCTGA 300
TCACTTATAT CGGGGAACAG TTGTGTTGAA ATGGGTTCAT TTGTACCAGT TTATTTACAT 360
CACATTTCCC CAAACATTAC ACAACATCAT ATCATGATTG ATCATAAACA AATAAAAACT 420
AAAACACTCA CTGCGGTTTT CACCCATCTG ACAAACTCCT CCAAACTCCA GCAAACCTGA 480
AAACAAGAAC AAAGATCAAA TATCAATAAA AATGTCAATA AAAACAAGAT CAAAATCAAA 540
ATAAACACAA CAAAAGAGCA ACAAAACGTG TCAAAAGGAA TAATTTCAGC TCTGAGCGTC 600
GATCTCCTTG TAAAATAAAA GTCTTCTGTC AGAAATTCTC TGGTCTCCTT GAAGAATCGC 660
AGTATCAGCA CAGTAATCCT CAGCAAATGT CTCAGAAATT CGCCTCTCCT CAATCAACAG 720
ATAGCGGCGA GTCTCGGTGT TTATATATGG AGTCAAATCA TACCACGCGT TGCTATAGCA 780
ACCACAATTT GAATCGCCAA TCTGAATCAC GTGAGTAAAC GATTCATCTC ATCTCAACAT 840
ATAAATAATA AATAATTAAT AATAATAATA ATAAACATAG TTAAAATAAT AATAATAATA 900
ATAATAATAA TAATAATGAA GTTTAAATCA ATTAATTTAT AATTCACGAA ACTGTAATAA 960
TAATGCTAAA TGAGCAAGAT TGGTTTGACA AGGTTTGACT TTGTAAAATG TACAGCTATT 1020
TAGGAATTAA TTAAATTAAA ATAATAAAAT TAACTCATAT ATTTTCTATT AGTGGCCCAA 1080
GCAATGTAAG TGCATGCTGT TTAATTACAC GTACAGTGCT AACTGCTCAC GTAGATATTA 1140
GGAATATAAG TTAAAAAAAG TTTATTATTG TAAATAATAG AAAGTAAATT AAATCGTTCA 1200
CAATTTCTAT GTCTATGCCT ATATTTTACA GTCTATGGTC TACGCACGAT TTCAGATCAC 1260
ATGGCCGTTT GTATCATCAT CTGGTAGGCT ACATGGTTCA GTCATATTTA TGTACTTTTC 1320
ATTTGCTCTT GTTTTCAGAT TTAATATTAT TAAGTTTTAT TAATGTTTTC GTTATTTTGG 1380
ATGTATGTGA AGGCTTTTTA AGGGACTTTG TGTTCACTCA ACGGCTAGAA AGCACAAAAG 1440
TTCACCTGCC GAATGAGTTC CCGCGTCTGA CCACAAGATG GCGTCCACA 1489