EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30091 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:42060583-42063212 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr5:42062254-42062266AAAGTAAACATA+6.11
Foxo1MA0480.1chr5:42062802-42062813TGTAAACAGCA-6.14
LMX1BMA0703.2chr5:42061441-42061452TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:42061442-42061453TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr5:42061259-42061273ATAAATAATTAATA+6.29
POU4F3MA0791.1chr5:42061259-42061275ATAAATAATTAATAAT+6.2
PROP1MA0715.1chr5:42061442-42061453TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr5:42061442-42061453TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr5:42061442-42061453TAATTAAATTA-6.62
RESTMA0138.2chr5:42063073-42063094TTCAGCACAATGGACAGCTCC+9.64
RFX1MA0509.2chr5:42061179-42061195CGTTGCTATAGCAACC+6.82
RFX1MA0509.2chr5:42061179-42061195CGTTGCTATAGCAACC-6.82
RFX2MA0600.2chr5:42061179-42061195CGTTGCTATAGCAACC+7.37
RFX2MA0600.2chr5:42061179-42061195CGTTGCTATAGCAACC-7.4
RFX3MA0798.1chr5:42061179-42061195CGTTGCTATAGCAACC+7.17
RFX3MA0798.1chr5:42061179-42061195CGTTGCTATAGCAACC-7.22
RFX4MA0799.1chr5:42061179-42061195CGTTGCTATAGCAACC+6.65
RFX4MA0799.1chr5:42061179-42061195CGTTGCTATAGCAACC-6.67
RFX5MA0510.2chr5:42061179-42061195CGTTGCTATAGCAACC-7.59
RFX5MA0510.2chr5:42061179-42061195CGTTGCTATAGCAACC+7.71
Enhancer Sequence
TCCTGGATCT GGAGCGGCCT GAGACAACGA CAACAACAAC AACAACATAT CACGTTTATT 60
ATAAGATTAT AAGAATTAAT CAACAATTAA CTTTAGTAGC TGCATCTACA GAGAATAAAA 120
GACATCTGAT CACTTATATC GGGGAACAGT TGTGTTGAAA TGGGTTCATT TGTACCAGTT 180
TATTTACATC ACATTTCCCC AAACATTACA CAACATCATA TCATGATTGA TCATAAACAA 240
ATAAAAACTA AAACACTCAC TGCGGTTTTC ACCCATCTGA CAAACTCCTC CAAACTCCAG 300
CAAACCTGAA AACAAGAACA AAGATCAAAT ATCAATAAAA ATGTCAATAA AAACAAGATC 360
AAAATCAAAA TAAACACAAC AAAAGAGCAA CAAAACGTGT CAAAAGGAAT AATTTCAGCT 420
CTGAGCGTCG ATCTCCTTGT AAAATAAAAG TCTTCTGTCA GAAATTCTCT GGTCTCCTTG 480
AAGAATCGCA GTATCAGCAC AGTAATCCTC AGCAAATGTC TCAGAAATTC GCCTCTCCTC 540
AATCAACAGA TAGCGGCGAG TCTCGGTGTT TATATATGGA GTCAAATCAT ACCACGCGTT 600
GCTATAGCAA CCACAATTTG AATCGCCAAT CTGAATCACG TGAGTAAACG ATTCATCTCA 660
TCTCAACATA TAAATAATAA ATAATTAATA ATAATAATAA ACAAAGTTAA AATAATAATA 720
ATAATAATAA TAATAATAAT AATAATAATG AAGTTTAAAT CAATTAATTT ATAATTCACG 780
AAACTGTAAT AATAATGCTA AATGAGCAAG ATTGGTTTGA CAAGGTTTGA CTTTGTAAAA 840
TGTACAGCTA TTTAGGAATT AATTAAATTA AAATAATAAA ATTAACTCAT ATATTTTCTA 900
TTAGTGGCCC AAGCAATGTA AGTGCATGCT GTTTAATTAC ACGTACAGTG CTAACTGCTC 960
ACGTAGATAT TAGGAATATA AGTTAAAAAA AGTTTATTAT TGTAAATAAT AGAAAGTAAA 1020
TTAAATCGTT CACAATTTCT ATGTCTATGC CTATATTTTA CAGTCTATGG TCTACGCACG 1080
ATTTCAGATC ACATGGCCGT TTGTATCATC ATCTGGTAGG CTACATGGTT CAGTCATATT 1140
TATGTACTTT TCATTTGCTC TTGTTTTCAG ATTTAATATT ATTAAGTTTT ATTAATGTTT 1200
TCGTTATTTT GGATGTATGT GAAGGCTTTT TAAGGGACTT TGTGTTCACT CAACGGCTAG 1260
AAAGCACAAA AGTTCACCTG CCGAATGAGT TCCCGCGTCT GACCACAAGA TGGCGTCCAC 1320
AGCAGAAAGG TGCAAGTTTA TAAATACAAT ATTTCTGTTT GTATGAATCT AAATAGCTGT 1380
TTTCATCACT AATATACAGC TTTCAATAAG CTAAATTACT ATCACAAGGT CTGTAATGAC 1440
AATTAGCTTG TACATTTGCT AGAATTTTCC TAACCGATCT AGCCTTGTTC ATTTATATTA 1500
AAACAAAAAA AGATTGTATT AAATTCAGAA AAACATCTCT CGTTTGTCAT TACGTTTGAT 1560
GATTTGATGT GATTTGAGCT TCTGAACTTC TGTTAAGGGT GCAAAGTCTG CCTTGAAGCG 1620
GCCTGATTTT ATACACCAGT TTACAGTAGT AAAAATATAT CAAAGTTAAT TAAAGTAAAC 1680
ATATTAAAGG TAAACAGGTT TCTATTTTTT GAATATAGTT AAAAATTATT TATAAAGTGA 1740
ATAATATGAT TAATAATATG ATTCATTTAT TATATTGATA TACATTTTTT ATATTAAATT 1800
ATCCCTGGGT CATAAAGGAT TCTGCTTGCA GCCTACAGTA CATCAGCTTT CAGGCTCAGT 1860
GCTGTGTTTC TTCTTCTTCT TCTTGGTCTT TACTGACGCT CCTGGTGCAG TGATGTTGCA 1920
GTTGCTGTGA AAAGCTAGGC GAGAACACAA ACCACAAGTG TTTTTATTCA GGCATGCAAC 1980
AGACTGAATG TCCTAAAACT GTTTGTGGTC AAGCTGGTGA TCTTGCATGC TCAATACACA 2040
CATCAATGCA TGAGATAAAC TGTGGTTAGA AAAAAACAGA AATAAGAAAA GTAAGAAAAT 2100
ATTTAGTGCA CGCTGCAGCT GTAAATGTTG CTTTTAATAT TTTCATGACT TGGAATTGAT 2160
GAGAAACTGA AGATGCAAAA GTCTGATTTA TTAAAATACG TGCCATGAAT CAGAGACAGT 2220
GTAAACAGCA CACAACTGAG GTTTGATTTA TTTAAAGAAG AGCAGAGCAA TGCAACATGT 2280
ACGAGTGCAA CATTCAACAT TTAAACCAAA TTGTAATAAT CATTCAACAA AATTTCCTTT 2340
CATAAAGCAA ATCCATCTGT TTGTATTTCC TATTATCTTT TAATTTCTAC ATTAGACCTT 2400
CTTTAGTTGT TGAGAAATGA CAGCATCCTG TTCACTGATC AGACACTTAT AATGAATTTA 2460
ATGTGAGAAG AGAGTTTAGT GTGGAGTAAA TTCAGCACAA TGGACAGCTC CCTGCAGTGC 2520
TGAACTGACT GAACCACATC TGCAGGAGGA AATGCTACAG AGATGTTTAA TTACTGCTGA 2580
ATAATTACTG AACAATATTG AATATTGAAA ATCTAACCCA TCAGTAGTG 2629