EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-30082 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr5:42000136-42003293 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr5:42002721-42002732ATGTTTACATA-6.14
FOXC1MA0032.2chr5:42002721-42002732ATGTTTACATA-6.32
FOXK2MA1103.1chr5:42002720-42002731CATGTTTACAT-6.14
IRF1MA0050.2chr5:42003038-42003059TGCTACTTTCACTTTTCATAG+6.13
MNX1MA0707.1chr5:42000189-42000199GGTAATTAAA+6.02
PBX2MA1113.1chr5:42002960-42002972GCTGTCAATCAA-6.32
POU3F1MA0786.1chr5:42002678-42002690TTATGCTAATTT+6.37
POU3F2MA0787.1chr5:42002678-42002690TTATGCTAATTT+6.22
POU3F3MA0788.1chr5:42002677-42002690CTTATGCTAATTT+6.05
POU4F1MA0790.1chr5:42002264-42002278CATTAATTATTCAT-8.42
POU4F2MA0683.1chr5:42002262-42002278ATCATTAATTATTCAT-7.84
POU4F3MA0791.1chr5:42002262-42002278ATCATTAATTATTCAT-8.35
Pou2f3MA0627.1chr5:42002413-42002429TAGTATGCAAATGTAA+6.97
Sox1MA0870.1chr5:42001492-42001507GACAATAACATTGTA+7.09
ZNF384MA1125.1chr5:42000772-42000784TTTCAAAAAAAA+6.18
Enhancer Sequence
ATTTCATCCA GCCCCACTAC AAAATATGCA GAGTCCACAT TTGGCTCAAG GCAGGTAATT 60
AAATCACTTT TCTACAACAT GGAGGGAAAA AAATCTGTTC CAAACGTACC TGAGACATTC 120
GATGGCTCAA CTGACATCGT TGAAGCAAAT TCAGTCAACG GTCCTTCGGT CATTGATGGC 180
CCTGGAACGG GCTCGATGTC CTGAATTTCT GTCAAAACTG TAAACAGATG CACAATGTGG 240
TTATCTGTAC ATTATGGAAC ATTCATAATA TAAAGACATT AAAAAACATT TACACAATAT 300
TAGTTACCGA TCATACTTTC ATACGCCATT TCAGCTTCTC TAAACCGTAA AATCCTGAGC 360
TGGAAGACTA TATTTTTCTA GTTCAATAAG TACTTCAACT CAAATGATGA AATCTTGGAA 420
AAAATAACAA TTTATCGGAC ACAGTTACTA CCCTGAAATG GCACCGAAGA GTGGGAATGA 480
CCCAATTAAC GTTAGGCCTA AATTATATCG AGCAAAAGAA TCAAATGATT TAAAGGTGTA 540
ATATACTACT TCAAATACCT GTAATTCCTC CAACTGACGT TGAAGCTGGT CCGGCGATCG 600
GAGGTGTATT TGCCGAAGAA TCCATAAGTG GAAAATTTTC AAAAAAAACA AGTTTAAAGA 660
TTCAACTGTG CTGTAAAATC TCTGGAGGTC TGTCGATATG CAATAGACGA CCACTTCTCT 720
CGCGAGTTCA ATATCAACTG AGGAAATGGC TTCGCGCGGC CGAATTTATG GAGCGCTGGA 780
GCTGACGTCA CTGCTTTTAG AACGAGGCGC TAAACCCGAG ACTAATGTTT ATATTTGATT 840
CTCACGAGAA AATAAAAGTC ACATTTCTGT GTTAAATCTC TCCCGCTTTT AGGCAAGTTT 900
TACACAAACA AATGGACCGA AAGGATATAG CCAATATCTT CCCTTTCCAG GCTCATTTAA 960
AGATTTATTT TAAAACCCTT AAAGGACTTT CGACTTTACG ATGCGAGTGT CATAATTGCA 1020
ATACTTTGTT ATAGTTTGAT TGTTAAATAT ACAGCACACA GTAATACATT CTAAAATAAT 1080
TTTTAATTAT TTATTTGACA ATGTTATATG TTCATCATAA TTACAAACAA TAATAAAAAC 1140
GCGTATTTGC ACAAACGTAG AACATCAAGC CAAGGTGTGT GGGGGGTCTA GAAAAAATAG 1200
TGCTGTAGGA AAAATAGATA TATAAAAAAT AATAATTATT TTTAAGTATT AATTAACCCC 1260
ATATAGTCTA TGCCATTTTC AATTCATGCA GCAGCAGTAT TGAAGGAAAT TTTTCAGTAA 1320
GCAGGCTAAA ATTCTTAATA TTTATTATAT AGTATTGACA ATAACATTGT ACTAAAGTTG 1380
TTCTCATTTC AGAATTCAGC ATTTAAATAA TTGAAAATTA TTAAATAATA ATAAATATTC 1440
ATCTCTCCGC CAAAACGGTT ACCATGGTGA AGTCTAGACA GGATACAGCT GCGGATACGC 1500
ACATCAATAT AGCATAATTT TTGTAACACT GTAAAACAAT GAATAATATT TTTACAGTAC 1560
TGTGGTGGTT GGGTTTAGGG TTGGGATAGG TGTAGATCTT AATAAAATAT AATTTACTGG 1620
GTAATTTAAT AAATAAATAA TTCCCGTTAA CTTCCGGCCA CAACCGTCTG TGATCTTCCA 1680
ACCAGTGCCG CAAAAAGAGG GTATGCAGTA TATGCGGCGC ATAGGGGCGC CACACGTGGG 1740
GGGGCGCCAT TGTGCCAAAA CTATTTTTGA AATTATACAT ATTATTATTA TACATATTAA 1800
ACAAAATAAA TACATATTTT TGGTTAAAAA TGTTTATCCT GCATTTTATA TAAATATACA 1860
ATTGTATTTT ATTGAATAAA AAAAATTATA CCACCCCTCC CTCTTCATTG ACCATTTGAT 1920
TGATCCGTTG CTCGGTTACA GTCACATGTT CAAAATGGAA AGAAGAGTAA AGAGACATGG 1980
AGGTCAAAAT AGAAAACAAA AAGAGAACAA ACAATGCCTT AAAATAAAAA CTGCCATGAC 2040
AAATTGGATA ATAAGGAATT GGTTAAGCTT AATATTACCA CACTTTTAAT CAACTTCTAA 2100
TGTTTTTAGG AGCGACGGGC TGCCATATCA TTAATTATTC ATTATCGCCA CTCAGTCACT 2160
GCATGCATGG GCTTTTACTT AACATAAATG CAGACAAGGT GGTTTTGTCC AGGCAGGGGG 2220
ACAGTGACGC ACGGCCACAC CTGAACTGCG TCTGAAATCG CATATTTGCA TCCTGTATAG 2280
TATGCAAATG TAATTCTATG GGCTAAAGCC ATGATAAGCT GGTGTAAAGT TAACTTTATG 2340
GTAAAGGCTT TTGACAGTCG TAAATTCATG GACCGTCAGC TTCAAAAAAG AAAATTTTTA 2400
TTTACTGCAT TTAAATATTG ATTACAGGTA CTATAGTTAT TTACTATAAA AGCGACAAAT 2460
GAATCTAGTT TGATCCTCTG TTTTGTTTGA TAACAGAGGT GCGAGTCTGA CTGTAAGAAT 2520
GCAATGAAAA CATTTGTTTT GCTTATGCTA ATTTAAGATA ATATTACTTG TGTTTCAAAT 2580
AAAACATGTT TACATATTAT TGTGTATATA TTTTTTTCTA TTTACACACC TGAATCTTAA 2640
AGTATCCGCT CTCATTCATC TTCAAATCGC GTGTATAGAA GCCGTCTTTA TCACTATGGA 2700
GCGCATCCGT CGGTTCACTA CCGACCGTTA TACTGATTCA GAGGCTGCAT AAGGGCTACA 2760
AAAGACACAT AAAGCTTTAC TGGAAAGGAC GTGAATGCGG CCGTTTTTAC ATTAATTTCA 2820
ACGTGCTGTC AATCAAAATA ATGTGAAAGC TTAATTCTCT TAAACAGTTC TTACATCACA 2880
TTTGAGATCG GCTCTGTGCA GCTGCTACTT TCACTTTTCA TAGAAACATT ACAAATGCAG 2940
GAGAAATACT GGAAAAACAC ACACGGAAGA CAGCGGATAG AATGGTAAAA TATGGTAGAA 3000
TTAATATGCC AAAAACGAGG GGGTTTATAG GTATGAATTG CATTCGTTGG CACACACATT 3060
TTAATTCAAA ATCATTTAAA ACAACATGCA GTCACACATC AAAGTGTAAA GTTTATGTAA 3120
AAGTTTTATC AAAATAAACT TTCAAATCAT ACTCACA 3157